RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 ZBTB5O15062 677 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 CTAGE5O15320 804 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 PRC1O43663 620 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 ZEB2O60315 1214 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 ANTXR2P58335 489 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 BEX3Q00994 111 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 C16orf59Q7L2K0 433 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
NME4-201ENST00000219479 ARVCFO00192 962 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 TRAF1Q13077 416 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.635e-9■■□□□ 11.9
NME4-201ENST00000219479 FAM126BQ8IXS8 530 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 USP38Q8NB14 1042 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 TIFAQ96CG3 184 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 LCTP09848 1927 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 TROAPQ12815 778 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 TMEM240Q5SV17 173 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 MTA3Q9BTC8 594 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 ZNF576Q9H609 170 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 Q9Y3F1 56 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 GBF1Q92538 1859 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 CCDC69A6NI79 296 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 CFBP00751 764 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 CSF2RAP15509 400 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 KIF5BP33176 963 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 NKX3-2P78367 333 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 NECTIN1Q15223 517 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 RASIP1Q5U651 963 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 TMTC2Q8N394 836 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 TMEM87BQ96K49 555 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 LY9Q9HBG7 655 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 CABYRO75952 493 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 DDAH1O94760 285 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 EDNRBP24530 442 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 PPP2R5BQ15173 497 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 SCFD2Q8WU76 684 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 TBC1D5Q92609 795 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 PIGSQ96S52 555 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 RMDN3Q96TC7 470 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 CHD7Q9P2D1 2997 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 GRXCR1A8MXD5 290 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 ACRP10323 421 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 PBX2P40425 430 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 TMEM199Q8N511 208 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 MTMR8Q96EF0 704 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 PBX4Q9BYU1 374 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 MUC3AQ02505 3323 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 CD4P01730 458 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 PTGS1P23219 599 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 TMEM63BQ5T3F8 832 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 MYL10Q9BUA6 226 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NME4-201ENST00000219479 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.623e-10■□□□□ 8.7
NME4-201ENST00000219479 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 CPT1AP50416 773 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 TTLL4Q14679 1199 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 STXBP2Q15833 593 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 ZNF365Q70YC5 407 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 IWS1Q96ST2 819 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 MAP3K14Q99558 947 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 TXNP10599 105 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 CYP2C18P33260 490 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 COL20A1Q9P218 1284 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 CALM1P0DP23 149 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 CALM2P0DP24 149 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 CALM3P0DP25 149 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 GNAQP50148 359 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 HSD17B4P51659 736 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 SLC43A3Q8NBI5 491 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms