RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA6BA6NDN3 693 aa24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 KLRF2D3W0D1 207 aa24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 NAPAP54920 295 aa24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA4Q8NEY3 305 aa24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 GNA11P29992 359 aa24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 TECP42680 631 aa24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 CORO7P57737 925 aa24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 CALML4Q96GE6 196 aa24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 EPHB6O15197 1021 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 PJA2O43164 708 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 MAN2A1Q16706 1144 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM76AQ8TAV0 307 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 OSBPL9Q96SU4 736 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC1Q9BTT6 524 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 HYOU1Q9Y4L1 999 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 SMCO2A6NFE2 343 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 MOCS3O95396 460 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 UNC13DQ70J99 1090 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 SV2BQ7L1I2 683 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 HPS3Q969F9 1004 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC39A2Q9NP94 309 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 STK17AQ9UEE5 414 aa24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 RASA1P20936 1047 aa24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP4CP60510 307 aa24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 NLRP3Q96P20 1036 aa24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3GL2Q99962 352 aa24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 STX8Q9UNK0 236 aa24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1-201ENST00000218364 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.58■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 SMARCA1P28370 1054 aa24.58■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 GRB10Q13322 594 aa24.58■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.58■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.58■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA6CA6NDK9 693 aa24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA6DP0CG33 693 aa24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS72Q15906 364 aa24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 JAG2Q9Y219 1238 aa24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 TNFRSF8P28908 595 aa24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXR2Q6PJQ5 311 aa24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 BAP1Q92560 729 aa24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 NYXQ9GZU5 481 aa24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 MYMKA6NI61 221 aa24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 MTMR9Q96QG7 549 aa24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC63Q05C16 580 aa24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 TBCKQ8TEA7 893 aa24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 DEF6Q9H4E7 631 aa24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 EFCC1Q9HA90 598 aa24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 MTMR7Q9Y216 660 aa24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 AFF2P51816 1311 aa24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC53A6NM62 1247 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 AKR1B10O60218 316 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 PNMA5Q96PV4 448 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 MMRN2Q9H8L6 949 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 ESYT2A0FGR8 921 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA8KD6RF30 607 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 BAG3O95817 575 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEA1P43355 309 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.521e-6■■■■□ 26.5
HTATSF1-201ENST00000218364 GSTO1P78417 241 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 PPFIA1Q13136 1202 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 EMBQ6PCB8 327 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 VGLL3A8MV65 326 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 EPHB4P54760 987 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 SOGA3Q5TF21 947 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 POTEDQ86YR6 584 aa24.54■■□□□ 1.52
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