RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 NDUFAB1O14561 156 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 GLI1P08151 1106 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 CALML3P27482 149 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC16A2P36021 539 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 SOGA3Q5TF21 947 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 WDR93Q6P2C0 686 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 KCNK18Q7Z418 384 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 NDST4Q9H3R1 872 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 JRKLQ9Y4A0 524 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 USP54Q70EL1 1684 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 MYMKA6NI61 221 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 PPFIA4O75335 1185 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 CCNE1P24864 410 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 NOP2P46087 812 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 VAV2P52735 878 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 NAA35Q5VZE5 725 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC30A10Q6XR72 485 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 TSPYL1Q9H0U9 437 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 SNX12Q9UMY4 172 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM169AQ9Y6X4 670 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 EBAG9O00559 213 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 OR52Z1P0C646 297 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 PAFAH1B1P43034 410 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 TBC1D9BQ66K14 1250 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 AP1M1Q9BXS5 423 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 MAD2L2Q9UI95 211 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 COL4A1P02462 1669 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 MYH6P13533 1939 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 TMCO5BA8MYB1 307 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 ERVV-1B6SEH8 477 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 MYO1AQ9UBC5 1043 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 MNAT1P51948 309 aa19.24■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.24■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 MAGEA9P43362 315 aa19.24■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 SNAP25P60880 206 aa19.24■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 ZIM3Q96PE6 472 aa19.24■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 BRIP1Q9BX63 1249 aa19.24■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 MYO1FO00160 1098 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC37A4O43826 429 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 ACTN1P12814 892 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 RPS8P62241 208 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 TTMPQ5BVD1 217 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM133AQ8N9E0 248 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 SNX29Q8TEQ0 813 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 TBC1D5Q92609 795 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 THAP9Q9H5L6 903 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 SLIT2O94813 1529 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 SMIM23A6NLE4 172 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 USP17L5A8MUK1 530 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 HSF2BPO75031 334 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 PALMO75781 387 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 KAT2BQ92831 832 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 CALML4Q96GE6 196 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 NUP188Q5SRE5 1749 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 RHOBTB3O94955 611 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 DDB1Q16531 1140 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 BCAS3Q9H6U6 928 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 ANAPC4Q9UJX5 808 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 CAPN7Q9Y6W3 813 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 STXBP3O00186 592 aa19.22■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 KBTBD4Q9NVX7 518 aa19.22■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM184BQ9ULE4 1060 aa19.22■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 LAMB4A4D0S4 1761 aa19.22■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 ERLIN2O94905 339 aa19.22■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 NNTQ13423 1086 aa19.22■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 VWA3BQ502W6 1294 aa19.22■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 TCERG1LQ5VWI1 586 aa19.22■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 SV2BQ7L1I2 683 aa19.22■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 CORO7P57737 925 aa19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 SHTN1A0MZ66 631 aa19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 EPS15P42566 896 aa19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 HAUS3Q68CZ6 603 aa19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 ALS2CR12Q96Q35 445 aa19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 MEIS1O00470 390 aa19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 KRT18P05783 430 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 COPB2P35606 906 aa19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 TUBB2AQ13885 445 aa19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 NFIXQ14938 502 aa19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 TUBB2BQ9BVA1 445 aa19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 IKZF4Q9H2S9 585 aa19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 SH2D4AQ9H788 454 aa19.21■□□□□ 0.67
KCNQ1-201ENST00000155840 TNS2Q63HR2 1409 aa19.2■□□□□ 0.66
KCNQ1-201ENST00000155840 LDHBP07195 334 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms