RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000016569.10

Pds5b-201, Transcript of Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pds5b, Length 7,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cnpy3Q9DAU1 276 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cyth1Q9QX11 398 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 GssP51855 474 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tcp11Q01755 566 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Creb3l3Q91XE9 479 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Slc13a1Q9JHI4 594 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gm45194A0A140LJG2 572 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tex13cD3YU32 604 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gm4981Q3ULJ8 291 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 TbcbQ9D1E6 244 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Psmg1Q9JK23 289 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 RcvrnP34057 202 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 FancaQ9JL70 1439 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Klhl34A2AI76 644 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Qtrt2B8ZXI1 415 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Dnaaf5B9EJR8 853 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Fam83bQ0VBM2 1012 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 BlvraQ9CY64 295 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Erich3F6QRE9 1637 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Sept2P42208 361 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Zc3h18Q0P678 948 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Mettl24Q8CCB5 363 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Pcdhb12Q91Y07 789 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Krt34Q9D646 392 aa14.54□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Atp1b3P97370 278 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Q80ZQ3 298 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Psmd2Q8VDM4 908 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Mms19Q9D071 1031 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ckap2Q3V1H1 664 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Apol6B7ZC55 329 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Timm44O35857 452 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 OtulinQ3UCV8 352 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Sytl1Q99N80 567 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gm11549A0A286YD83 63 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Elf1Q60775 612 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 AmphQ7TQF7 686 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ppfia2Q8BSS9 1257 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Snrnp35Q9D384 244 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ppp2r5aQ6PD03 486 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Psip1Q99JF8 528 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tex21Q9R0U9 575 aa14.53□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gm43302L7N1X8 611 aa14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Palb2Q3U0P1 1104 aa14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Arhgap29Q8CGF1 1266 aa14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Vmn1r199Q8R280 367 aa14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Slc35f6Q8VE96 372 aa14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Prc1Q99K43 603 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cul1Q9WTX6 776 aa14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Lnx1O70263 728 aa14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Dok7Q18PE0 504 aa14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Pnma5Q5DTT8 618 aa14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gm1661E9Q963 441 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Clcn6O35454 870 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Casp2P29594 452 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gad1P48318 593 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Dab2P98078 766 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cage1Q5IR70 849 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ripor2Q80U16 1078 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 F13a1Q8BH61 732 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Pus7lQ8CE46 702 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tmem60Q8K174 133 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ppp4r1Q8K2V1 951 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 LtkP08923 888 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Fbxo41Q6NS60 873 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Snx1Q9WV80 522 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Sgk1Q9WVC6 431 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 DnttP09838 530 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rtel1Q0VGM9 1203 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ppp2r5dQ91V89 594 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Nuf2Q99P69 463 aa14.52□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 MlxiplQ99MZ3 864 aa14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Psma8Q9CWH6 250 aa14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Add2Q9QYB8 725 aa14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ptch1Q61115 1434 aa14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Prkg1P0C605 671 aa14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Sesn2P58043 480 aa14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Sparcl1P70663 650 aa14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Trim17Q7TPM3 477 aa14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gfpt2Q9Z2Z9 682 aa14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Mmrn1B2RPV6 1210 aa14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 RpsaP14206 295 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cyp11b2P15539 500 aa14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Q66JV7 365 aa14.51□□□□□ -0.09
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ddx19bQ8BZY3 494 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 56.9 ms