RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640703.1

GLDC-222, Transcript of glycine decarboxylase, human

TSL 5

Gene GLDC, Length 620 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GLDC-222	ENST00000640703	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		10.23	□□□□□ -0.77
GLDC-222	ENST00000640703	SPOCK2	Q92563	424 aa		10.23	□□□□□ -0.77
GLDC-222	ENST00000640703	BCAN	Q96GW7	911 aa		10.22	□□□□□ -0.77
GLDC-222	ENST00000640703	MAP3K13	O43283	966 aa		10.21	□□□□□ -0.77
GLDC-222	ENST00000640703	POTEI	P0CG38	1075 aa		10.21	□□□□□ -0.77
GLDC-222	ENST00000640703	GSE1	Q14687	1217 aa		10.21	□□□□□ -0.77
GLDC-222	ENST00000640703	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	CLIP1	P30622	1438 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	CHD1	O14646	1710 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	ABCC8	Q09428	1581 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	WIZ	O95785	1651 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	CFTR	P13569	1480 aa		10.17	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	IFT140	Q96RY7	1462 aa		10.17	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	PYGB	P11216	843 aa		10.16	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	USP35	Q9P2H5	1018 aa		10.15	□□□□□ -0.78
GLDC-222	ENST00000640703	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	SOGA1	O94964	1423 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	TIE1	P35590	1138 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	IFNL1	Q8IU54	200 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	MAPKBP1	O60336	1514 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	TRPC6	Q9Y210	931 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GLDC-222	ENST00000640703	ITGAE	P38570	1179 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	ANP32C	O43423	234 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	KCNH8	Q96L42	1107 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	SYNJ1	O43426	1573 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	LHX8	Q68G74	356 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	SLC39A7	Q92504	469 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	10.04	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	MAP3K1	Q13233	1512 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	TOPBP1	Q92547	1522 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	WDR97	A6NE52	1622 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GLDC-222	ENST00000640703	C7	P10643	843 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	METRN	Q9UJH8	293 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		10	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	IL27	Q8NEV9	243 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	PRDM2	Q13029	1718 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	NBR1	Q14596	966 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	TRIM52	Q96A61	297 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GLDC-222	ENST00000640703	SLC24A1	O60721	1099 aa		9.95	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		9.95	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		9.95	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		9.95	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		9.94	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	IER5L	Q5T953	404 aa		9.94	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		9.93	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	NCOA2	Q15596	1464 aa		9.93	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		9.93	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	PSEN1	P49768	467 aa		9.93	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		9.92	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		9.92	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		9.92	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	SEC24B	O95487	1268 aa		9.92	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	9.92	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		9.92	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	9.91	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		9.91	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	9.91	□□□□□ -0.82
GLDC-222	ENST00000640703	GOLGA2	Q08379	1002 aa		9.9	□□□□□ -0.82

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