RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, humanhuman

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNM1-222ENST00000636280 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.44■■□□□ 1.34
DNM1-222ENST00000636280 MAPKBP1O60336 1514 aa23.43■■□□□ 1.34
DNM1-222ENST00000636280 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.43■■□□□ 1.34
DNM1-222ENST00000636280 AKNAQ7Z591 1439 aa23.43■■□□□ 1.34
DNM1-222ENST00000636280 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
DNM1-222ENST00000636280 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.38■■□□□ 1.33
DNM1-222ENST00000636280 ROCK1Q13464 1354 aa23.38■■□□□ 1.33
DNM1-222ENST00000636280 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
DNM1-222ENST00000636280 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.34■■□□□ 1.33
DNM1-222ENST00000636280 KCNH8Q96L42 1107 aa23.34■■□□□ 1.33
DNM1-222ENST00000636280 PREX2Q70Z35 1606 aa23.32■■□□□ 1.32
DNM1-222ENST00000636280 KDM6BO15054 1643 aa23.31■■□□□ 1.32
DNM1-222ENST00000636280 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.31■■□□□ 1.32
DNM1-222ENST00000636280 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.28■■□□□ 1.32
DNM1-222ENST00000636280 NCOA1Q15788 1441 aa23.27■■□□□ 1.32
DNM1-222ENST00000636280 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.26■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 ADGRL2O95490 1459 aa23.25■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.24■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 MBD5Q9P267 1494 aa23.24■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.24■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.23■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.23■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 TRIM52Q96A61 297 aa23.23■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.23■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.22■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.22■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.22■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.21■■□□□ 1.31
DNM1-222ENST00000636280 PLCH2O75038 1416 aa23.2■■□□□ 1.3
DNM1-222ENST00000636280 NEUROD1Q13562 356 aa23.2■■□□□ 1.3
DNM1-222ENST00000636280 TSPY4P0CV99 314 aa23.19■■□□□ 1.3
DNM1-222ENST00000636280 TSPY10P0CW01 314 aa23.19■■□□□ 1.3
DNM1-222ENST00000636280 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.17■■□□□ 1.3
DNM1-222ENST00000636280 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
DNM1-222ENST00000636280 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.17■■□□□ 1.3
DNM1-222ENST00000636280 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
DNM1-222ENST00000636280 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.16■■□□□ 1.3
DNM1-222ENST00000636280 ASXL2Q76L83 1435 aa23.16■■□□□ 1.3
DNM1-222ENST00000636280 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
DNM1-222ENST00000636280 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.14■■□□□ 1.3
DNM1-222ENST00000636280 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.14■■□□□ 1.29
DNM1-222ENST00000636280 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.14■■□□□ 1.29
DNM1-222ENST00000636280 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.14■■□□□ 1.29
DNM1-222ENST00000636280 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
DNM1-222ENST00000636280 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.12■■□□□ 1.29
DNM1-222ENST00000636280 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.11■■□□□ 1.29
DNM1-222ENST00000636280 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.09■■□□□ 1.29
DNM1-222ENST00000636280 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.09■■□□□ 1.29
DNM1-222ENST00000636280 KIF15Q9NS87 1388 aa23.08■■□□□ 1.29
DNM1-222ENST00000636280 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.07■■□□□ 1.28
DNM1-222ENST00000636280 ABCC1P33527 1531 aa23.05■■□□□ 1.28
DNM1-222ENST00000636280 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.05■■□□□ 1.28
DNM1-222ENST00000636280 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
DNM1-222ENST00000636280 FOXD1Q16676 465 aa23.03■■□□□ 1.28
DNM1-222ENST00000636280 PZPP20742 1482 aa23.03■■□□□ 1.28
DNM1-222ENST00000636280 TONSLQ96HA7 1378 aa23.01■■□□□ 1.27
DNM1-222ENST00000636280 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23■■□□□ 1.27
DNM1-222ENST00000636280 FANCAO15360 1455 aa23■■□□□ 1.27
DNM1-222ENST00000636280 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
DNM1-222ENST00000636280 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
DNM1-222ENST00000636280 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.99■■□□□ 1.27
DNM1-222ENST00000636280 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.98■■□□□ 1.27
DNM1-222ENST00000636280 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.97■■□□□ 1.27
DNM1-222ENST00000636280 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.97■■□□□ 1.27
DNM1-222ENST00000636280 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.97■■□□□ 1.27
DNM1-222ENST00000636280 PLXNC1O60486 1568 aa22.96■■□□□ 1.27
DNM1-222ENST00000636280 NUP155O75694 1391 aa22.95■■□□□ 1.26
DNM1-222ENST00000636280 AFAP1Q8N556 730 aa22.93■■□□□ 1.26
DNM1-222ENST00000636280 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.92■■□□□ 1.26
DNM1-222ENST00000636280 PKD2Q13563 968 aa22.91■■□□□ 1.26
DNM1-222ENST00000636280 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
DNM1-222ENST00000636280 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
DNM1-222ENST00000636280 ADGRL1O94910 1474 aa22.9■■□□□ 1.26
DNM1-222ENST00000636280 CD109Q6YHK3 1445 aa22.89■■□□□ 1.26
DNM1-222ENST00000636280 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.89■■□□□ 1.25
DNM1-222ENST00000636280 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.88■■□□□ 1.25
DNM1-222ENST00000636280 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.88■■□□□ 1.25
DNM1-222ENST00000636280 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
DNM1-222ENST00000636280 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.85■■□□□ 1.25
DNM1-222ENST00000636280 ERBINQ96RT1 1412 aa22.84■■□□□ 1.25
DNM1-222ENST00000636280 UNC13BO14795 1591 aa22.82■■□□□ 1.24
DNM1-222ENST00000636280 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.82■■□□□ 1.24
DNM1-222ENST00000636280 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.82■■□□□ 1.24
DNM1-222ENST00000636280 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
DNM1-222ENST00000636280 ATP7AQ04656 1500 aa22.8■■□□□ 1.24
DNM1-222ENST00000636280 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
DNM1-222ENST00000636280 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.78■■□□□ 1.24
DNM1-222ENST00000636280 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.77■■□□□ 1.24
DNM1-222ENST00000636280 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.75■■□□□ 1.23
DNM1-222ENST00000636280 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.75■■□□□ 1.23
DNM1-222ENST00000636280 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.74■■□□□ 1.23
DNM1-222ENST00000636280 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.74■■□□□ 1.23
DNM1-222ENST00000636280 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.72■■□□□ 1.23
DNM1-222ENST00000636280 NEO1Q92859 1461 aa22.72■■□□□ 1.23
DNM1-222ENST00000636280 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.71■■□□□ 1.23
DNM1-222ENST00000636280 GLI2P10070 1586 aa22.7■■□□□ 1.22
DNM1-222ENST00000636280 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.69■■□□□ 1.22
DNM1-222ENST00000636280 KDM5CP41229 1560 aa22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms