RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 HECW1Q76N89 1606 aa45.53■■■■■ 4.88
CAPNS1-217ENST00000629983 PLCH2O75038 1416 aa45.52■■■■■ 4.88
CAPNS1-217ENST00000629983 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.49■■■■■ 4.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa45.46■■■■■ 4.87
CAPNS1-217ENST00000629983 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa45.42■■■■■ 4.86
CAPNS1-217ENST00000629983 FMN1Q68DA7 1419 aa45.42■■■■■ 4.86
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.41■■■■■ 4.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP10AO60312 1499 aa45.36■■■■■ 4.85
CAPNS1-217ENST00000629983 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa45.35■■■■■ 4.85
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf84Q5VXU9 1444 aa45.35■■■■■ 4.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MYT1LQ9UL68 1186 aa45.29■■■■■ 4.84
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO5CQ9NQX4 1742 aa45.28■■■■■ 4.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.28■■■■■ 4.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa45.26■■■■■ 4.84
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF14Q15058 1648 aa45.24■■■■■ 4.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP5Q13017 1502 aa45.23■■■■■ 4.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CLIP1P30622 1438 aa45.22■■■■■ 4.83
CAPNS1-217ENST00000629983 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP45.22■■■■■ 4.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CERKQ8TCT0 537 aa45.22■■■■■ 4.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa45.22■■■■■ 4.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP45.21■■■■■ 4.83
CAPNS1-217ENST00000629983 AFAP1Q8N556 730 aa45.18■■■■■ 4.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PREX1Q8TCU6 1659 aa45.08■■■■■ 4.81
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM5CP41229 1560 aa45.07■■■■■ 4.8
CAPNS1-217ENST00000629983 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa45.02■■■■■ 4.8
CAPNS1-217ENST00000629983 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa44.99■■■■■ 4.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP44.97■■■■■ 4.79
CAPNS1-217ENST00000629983 DMRT2Q9Y5R5 561 aa44.97■■■■■ 4.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.93■■■■■ 4.78
CAPNS1-217ENST00000629983 MLH3Q9UHC1 1453 aa44.91■■■■■ 4.78
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.9■■■■■ 4.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa44.9■■■■■ 4.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCA6Q8N139 1617 aa44.9■■■■■ 4.78
CAPNS1-217ENST00000629983 REREQ9P2R6 1566 aa44.89■■■■■ 4.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.87■■■■■ 4.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa44.87■■■■■ 4.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCC1P33527 1531 aa44.85■■■■■ 4.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PREX2Q70Z35 1606 aa44.85■■■■■ 4.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.84■■■■■ 4.77
CAPNS1-217ENST00000629983 AGLP35573 1532 aa44.79■■■■■ 4.76
CAPNS1-217ENST00000629983 STRCQ7RTU9 1775 aa44.79■■■■■ 4.76
CAPNS1-217ENST00000629983 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.75■■■■■ 4.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP44.75■■■■■ 4.75
CAPNS1-217ENST00000629983 C3P01024 1663 aa44.74■■■■■ 4.75
CAPNS1-217ENST00000629983 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP44.71■■■■■ 4.75
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRTO14522 1441 aa44.68■■■■■ 4.74
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTLNQ9NXG0 1405 aa44.68■■■■■ 4.74
CAPNS1-217ENST00000629983 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa44.64■■■■■ 4.74
CAPNS1-217ENST00000629983 DISP3Q9P2K9 1392 aa44.63■■■■■ 4.73
CAPNS1-217ENST00000629983 FYCO1Q9BQS8 1478 aa44.62■■■■■ 4.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.61■■■■■ 4.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa44.59■■■■■ 4.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SYCP2Q9BX26 1530 aa44.56■■■■■ 4.72
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP44.55■■■■■ 4.72
CAPNS1-217ENST00000629983 NCOA1Q15788 1441 aa44.53■■■■■ 4.72
CAPNS1-217ENST00000629983 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
CAPNS1-217ENST00000629983 NPATQ14207 1427 aa44.48■■■■■ 4.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMYM3Q14202 1370 aa44.47■■■■■ 4.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.43■■■■■ 4.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa44.42■■■■■ 4.7
CAPNS1-217ENST00000629983 LTBP4Q8N2S1 1624 aa44.42■■■■■ 4.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP7AQ04656 1500 aa44.41■■■■■ 4.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa44.4■■■■■ 4.7
CAPNS1-217ENST00000629983 MROH2AA6NES4 1674 aa44.4■■■■■ 4.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ILDR2Q71H61 639 aa44.4■■■■■ 4.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa44.38■■■■■ 4.69
CAPNS1-217ENST00000629983 A2MP01023 1474 aa44.36■■■■■ 4.69
CAPNS1-217ENST00000629983 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa44.36■■■■■ 4.69
CAPNS1-217ENST00000629983 GGT6Q6P531 493 aa44.36■■■■■ 4.69
CAPNS1-217ENST00000629983 MTUS2Q5JR59 1369 aa44.34■■■■■ 4.69
CAPNS1-217ENST00000629983 IQSEC2Q5JU85 1478 aa44.33■■■■■ 4.69
CAPNS1-217ENST00000629983 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
CAPNS1-217ENST00000629983 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
CAPNS1-217ENST00000629983 PLXNC1O60486 1568 aa44.28■■■■■ 4.68
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa44.27■■■■■ 4.68
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP44.24■■■■■ 4.67
CAPNS1-217ENST00000629983 SOCS7O14512 581 aa44.24■■■■■ 4.67
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRKQ15262 1439 aa44.22■■■■■ 4.67
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO3AQ8NEV4 1616 aa44.21■■■■■ 4.67
CAPNS1-217ENST00000629983 PKD2Q13563 968 aa44.21■■■■■ 4.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP44.18■■■■■ 4.66
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2R1Q13018 1463 aa44.17■■■■■ 4.66
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
CAPNS1-217ENST00000629983 UBAP1LF5GYI3 381 aa44.16■■■■■ 4.66
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP6R1Q9UPN7 881 aa44.13■■■■■ 4.66
CAPNS1-217ENST00000629983 TIAM1Q13009 1591 aa44.09■■■■■ 4.65
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGBQ8N7X0 1667 aa44.09■■■■■ 4.65
CAPNS1-217ENST00000629983 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
CAPNS1-217ENST00000629983 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.06■■■■■ 4.64
CAPNS1-217ENST00000629983 MBD5Q9P267 1494 aa44.04■■■■■ 4.64
CAPNS1-217ENST00000629983 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa44■■■■■ 4.63
CAPNS1-217ENST00000629983 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
CAPNS1-217ENST00000629983 A2ML1A8K2U0 1454 aa44■■■■■ 4.63
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP162Q5TB80 1403 aa43.97■■■■■ 4.63
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF3BO15066 747 aa43.96■■■■■ 4.63
CAPNS1-217ENST00000629983 TNRQ92752 1358 aa43.92■■■■■ 4.62
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