RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615330.4

RASGEF1C-207, Transcript of RasGEF domain family member 1C, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RASGEF1C, Length 2,268 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1C-207ENST00000615330 ABCC5O15440 1437 aa41.14■■■■■ 4.18
RASGEF1C-207ENST00000615330 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.14■■■■■ 4.18
RASGEF1C-207ENST00000615330 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
RASGEF1C-207ENST00000615330 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.06■■■■■ 4.16
RASGEF1C-207ENST00000615330 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.04■■■■■ 4.166e-9■■■■□ 22.7
RASGEF1C-207ENST00000615330 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.02■■■■■ 4.16
RASGEF1C-207ENST00000615330 MAPKBP1O60336 1514 aa41.01■■■■■ 4.16
RASGEF1C-207ENST00000615330 KDM6BO15054 1643 aa40.98■■■■■ 4.15
RASGEF1C-207ENST00000615330 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.97■■■■■ 4.15
RASGEF1C-207ENST00000615330 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.97■■■■■ 4.15
RASGEF1C-207ENST00000615330 PREX2Q70Z35 1606 aa40.92■■■■■ 4.14
RASGEF1C-207ENST00000615330 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.91■■■■■ 4.14
RASGEF1C-207ENST00000615330 AKNAQ7Z591 1439 aa40.9■■■■■ 4.14
RASGEF1C-207ENST00000615330 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.88■■■■■ 4.14
RASGEF1C-207ENST00000615330 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.87■■■■■ 4.13
RASGEF1C-207ENST00000615330 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.86■■■■■ 4.13
RASGEF1C-207ENST00000615330 TRIM52Q96A61 297 aa40.86■■■■■ 4.13
RASGEF1C-207ENST00000615330 ROCK1Q13464 1354 aa40.86■■■■■ 4.13
RASGEF1C-207ENST00000615330 NEUROD1Q13562 356 aa40.82■■■■■ 4.12
RASGEF1C-207ENST00000615330 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.81■■■■■ 4.12
RASGEF1C-207ENST00000615330 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.81■■■■■ 4.12
RASGEF1C-207ENST00000615330 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.8■■■■■ 4.12
RASGEF1C-207ENST00000615330 NCOA1Q15788 1441 aa40.79■■■■■ 4.12
RASGEF1C-207ENST00000615330 ASXL2Q76L83 1435 aa40.77■■■■■ 4.12
RASGEF1C-207ENST00000615330 MBD5Q9P267 1494 aa40.77■■■■■ 4.12
RASGEF1C-207ENST00000615330 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.77■■■■■ 4.12
RASGEF1C-207ENST00000615330 TSPY4P0CV99 314 aa40.74■■■■■ 4.11
RASGEF1C-207ENST00000615330 TSPY10P0CW01 314 aa40.74■■■■■ 4.11
RASGEF1C-207ENST00000615330 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.73■■■■■ 4.11
RASGEF1C-207ENST00000615330 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.73■■■■■ 4.11
RASGEF1C-207ENST00000615330 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.73■■■■■ 4.11
RASGEF1C-207ENST00000615330 PLCH2O75038 1416 aa40.72■■■■■ 4.11
RASGEF1C-207ENST00000615330 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.7■■■■■ 4.11
RASGEF1C-207ENST00000615330 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.69■■■■■ 4.1
RASGEF1C-207ENST00000615330 ADGRL2O95490 1459 aa40.66■■■■■ 4.1
RASGEF1C-207ENST00000615330 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.64■■■■■ 4.1
RASGEF1C-207ENST00000615330 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.64■■■■■ 4.1
RASGEF1C-207ENST00000615330 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.64■■■■■ 4.1
RASGEF1C-207ENST00000615330 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.62■■■■■ 4.09
RASGEF1C-207ENST00000615330 FOXD1Q16676 465 aa40.62■■■■■ 4.09
RASGEF1C-207ENST00000615330 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
RASGEF1C-207ENST00000615330 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.61■■■■■ 4.09
RASGEF1C-207ENST00000615330 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.6■■■■■ 4.09
RASGEF1C-207ENST00000615330 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.57■■■■■ 4.08
RASGEF1C-207ENST00000615330 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.57■■■■■ 4.08
RASGEF1C-207ENST00000615330 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.57■■■■■ 4.08
RASGEF1C-207ENST00000615330 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.54■■■■■ 4.08
RASGEF1C-207ENST00000615330 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.53■■■■■ 4.08
RASGEF1C-207ENST00000615330 KIF15Q9NS87 1388 aa40.52■■■■■ 4.08
RASGEF1C-207ENST00000615330 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.51■■■■■ 4.08
RASGEF1C-207ENST00000615330 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.5■■■■■ 4.07
RASGEF1C-207ENST00000615330 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.48■■■■■ 4.07
RASGEF1C-207ENST00000615330 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
RASGEF1C-207ENST00000615330 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.47■■■■■ 4.07
RASGEF1C-207ENST00000615330 ABCC1P33527 1531 aa40.46■■■■■ 4.07
RASGEF1C-207ENST00000615330 FANCAO15360 1455 aa40.45■■■■■ 4.07
RASGEF1C-207ENST00000615330 AFAP1Q8N556 730 aa40.44■■■■■ 4.06
RASGEF1C-207ENST00000615330 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
RASGEF1C-207ENST00000615330 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.37■■■■■ 4.05
RASGEF1C-207ENST00000615330 PZPP20742 1482 aa40.36■■■■■ 4.05
RASGEF1C-207ENST00000615330 NUP155O75694 1391 aa40.32■■■■■ 4.04
RASGEF1C-207ENST00000615330 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.31■■■■■ 4.04
RASGEF1C-207ENST00000615330 TONSLQ96HA7 1378 aa40.31■■■■■ 4.04
RASGEF1C-207ENST00000615330 CD109Q6YHK3 1445 aa40.3■■■■■ 4.04
RASGEF1C-207ENST00000615330 ADGRL1O94910 1474 aa40.28■■■■■ 4.04
RASGEF1C-207ENST00000615330 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.27■■■■■ 4.04
RASGEF1C-207ENST00000615330 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
RASGEF1C-207ENST00000615330 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
RASGEF1C-207ENST00000615330 PKD2Q13563 968 aa40.25■■■■■ 4.03
RASGEF1C-207ENST00000615330 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.22■■■■■ 4.03
RASGEF1C-207ENST00000615330 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.22■■■■■ 4.03
RASGEF1C-207ENST00000615330 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
RASGEF1C-207ENST00000615330 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.22■■■■■ 4.03
RASGEF1C-207ENST00000615330 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.21■■■■■ 4.03
RASGEF1C-207ENST00000615330 PLXNC1O60486 1568 aa40.19■■■■■ 4.02
RASGEF1C-207ENST00000615330 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
RASGEF1C-207ENST00000615330 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.12■■■■■ 4.01
RASGEF1C-207ENST00000615330 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.1■■■■■ 4.01
RASGEF1C-207ENST00000615330 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.04■■■■■ 4
RASGEF1C-207ENST00000615330 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.04■■■■■ 4
RASGEF1C-207ENST00000615330 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.04■■■■■ 4
RASGEF1C-207ENST00000615330 ATP7AQ04656 1500 aa40.03■■■■■ 4
RASGEF1C-207ENST00000615330 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.03■■■■■ 4
RASGEF1C-207ENST00000615330 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.02■■■■■ 4
RASGEF1C-207ENST00000615330 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
RASGEF1C-207ENST00000615330 ERBINQ96RT1 1412 aa40.01■■■■□ 3.99
RASGEF1C-207ENST00000615330 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
RASGEF1C-207ENST00000615330 RAPGEF3O95398 923 aa39.98■■■■□ 3.99
RASGEF1C-207ENST00000615330 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
RASGEF1C-207ENST00000615330 UNC13BO14795 1591 aa39.96■■■■□ 3.99
RASGEF1C-207ENST00000615330 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.94■■■■□ 3.98
RASGEF1C-207ENST00000615330 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.92■■■■□ 3.98
RASGEF1C-207ENST00000615330 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.92■■■■□ 3.98
RASGEF1C-207ENST00000615330 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.91■■■■□ 3.98
RASGEF1C-207ENST00000615330 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.89■■■■□ 3.98
RASGEF1C-207ENST00000615330 DIP2BQ9P265 1576 aa39.87■■■■□ 3.97
RASGEF1C-207ENST00000615330 KIF3BO15066 747 aa39.86■■■■□ 3.97
RASGEF1C-207ENST00000615330 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.85■■■■□ 3.97
RASGEF1C-207ENST00000615330 NEO1Q92859 1461 aa39.85■■■■□ 3.97
RASGEF1C-207ENST00000615330 GLI2P10070 1586 aa39.83■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms