RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609571.5

ATRNL1-209, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATRNL1, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-209ENST00000609571 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
ATRNL1-209ENST00000609571 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.09■■■■■ 4.01
ATRNL1-209ENST00000609571 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.06■■■■■ 4
ATRNL1-209ENST00000609571 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
ATRNL1-209ENST00000609571 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.01■■■■■ 4
ATRNL1-209ENST00000609571 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40■■■■□ 3.99
ATRNL1-209ENST00000609571 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40■■■■□ 3.99
ATRNL1-209ENST00000609571 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.97■■■■□ 3.99
ATRNL1-209ENST00000609571 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.95■■■■□ 3.99
ATRNL1-209ENST00000609571 ADGRL2O95490 1459 aa39.91■■■■□ 3.98
ATRNL1-209ENST00000609571 PREX2Q70Z35 1606 aa39.89■■■■□ 3.98
ATRNL1-209ENST00000609571 KDM6BO15054 1643 aa39.88■■■■□ 3.98
ATRNL1-209ENST00000609571 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
ATRNL1-209ENST00000609571 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.88■■■■□ 3.97
ATRNL1-209ENST00000609571 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.86■■■■□ 3.97
ATRNL1-209ENST00000609571 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
ATRNL1-209ENST00000609571 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
ATRNL1-209ENST00000609571 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.82■■■■□ 3.96
ATRNL1-209ENST00000609571 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.81■■■■□ 3.96
ATRNL1-209ENST00000609571 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.8■■■■□ 3.96
ATRNL1-209ENST00000609571 NCOA1Q15788 1441 aa39.8■■■■□ 3.96
ATRNL1-209ENST00000609571 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.77■■■■□ 3.96
ATRNL1-209ENST00000609571 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.74■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.74■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 NEUROD1Q13562 356 aa39.72■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.71■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.71■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 TRIM52Q96A61 297 aa39.7■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.7■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
ATRNL1-209ENST00000609571 MBD5Q9P267 1494 aa39.68■■■■□ 3.94
ATRNL1-209ENST00000609571 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.68■■■■□ 3.94
ATRNL1-209ENST00000609571 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.66■■■■□ 3.94
ATRNL1-209ENST00000609571 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.64■■■■□ 3.94
ATRNL1-209ENST00000609571 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.62■■■■□ 3.93
ATRNL1-209ENST00000609571 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.62■■■■□ 3.93
ATRNL1-209ENST00000609571 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.62■■■■□ 3.93
ATRNL1-209ENST00000609571 TONSLQ96HA7 1378 aa39.59■■■■□ 3.93
ATRNL1-209ENST00000609571 TSPY4P0CV99 314 aa39.59■■■■□ 3.93
ATRNL1-209ENST00000609571 TSPY10P0CW01 314 aa39.59■■■■□ 3.93
ATRNL1-209ENST00000609571 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.57■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 PLCH2O75038 1416 aa39.54■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.54■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.53■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.52■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.52■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.52■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.51■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.51■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.49■■■■□ 3.91
ATRNL1-209ENST00000609571 KCNH8Q96L42 1107 aa39.48■■■■□ 3.91
ATRNL1-209ENST00000609571 PZPP20742 1482 aa39.47■■■■□ 3.91
ATRNL1-209ENST00000609571 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.47■■■■□ 3.91
ATRNL1-209ENST00000609571 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.42■■■■□ 3.9
ATRNL1-209ENST00000609571 KIF15Q9NS87 1388 aa39.41■■■■□ 3.9
ATRNL1-209ENST00000609571 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
ATRNL1-209ENST00000609571 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.4■■■■□ 3.9
ATRNL1-209ENST00000609571 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.4■■■■□ 3.9
ATRNL1-209ENST00000609571 PLXNC1O60486 1568 aa39.36■■■■□ 3.89
ATRNL1-209ENST00000609571 ABCC1P33527 1531 aa39.35■■■■□ 3.89
ATRNL1-209ENST00000609571 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.34■■■■□ 3.89
ATRNL1-209ENST00000609571 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
ATRNL1-209ENST00000609571 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.29■■■■□ 3.88
ATRNL1-209ENST00000609571 ASXL2Q76L83 1435 aa39.26■■■■□ 3.88
ATRNL1-209ENST00000609571 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.24■■■■□ 3.87
ATRNL1-209ENST00000609571 FOXD1Q16676 465 aa39.24■■■■□ 3.87
ATRNL1-209ENST00000609571 NUP155O75694 1391 aa39.21■■■■□ 3.87
ATRNL1-209ENST00000609571 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.18■■■■□ 3.86
ATRNL1-209ENST00000609571 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.18■■■■□ 3.86
ATRNL1-209ENST00000609571 UNC13BO14795 1591 aa39.16■■■■□ 3.86
ATRNL1-209ENST00000609571 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.14■■■■□ 3.86
ATRNL1-209ENST00000609571 PKD2Q13563 968 aa39.14■■■■□ 3.86
ATRNL1-209ENST00000609571 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.12■■■■□ 3.85
ATRNL1-209ENST00000609571 MIER1Q8N108 512 aa39.11■■■■□ 3.85
ATRNL1-209ENST00000609571 FANCAO15360 1455 aa39.11■■■■□ 3.85
ATRNL1-209ENST00000609571 ERBINQ96RT1 1412 aa39.11■■■■□ 3.85
ATRNL1-209ENST00000609571 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.11■■■■□ 3.85
ATRNL1-209ENST00000609571 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.1■■■■□ 3.85
ATRNL1-209ENST00000609571 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.06■■■■□ 3.84
ATRNL1-209ENST00000609571 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.01■■■■□ 3.83
ATRNL1-209ENST00000609571 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.01■■■■□ 3.83
ATRNL1-209ENST00000609571 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39■■■■□ 3.83
ATRNL1-209ENST00000609571 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
ATRNL1-209ENST00000609571 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.96■■■■□ 3.83
ATRNL1-209ENST00000609571 ADGRL1O94910 1474 aa38.95■■■■□ 3.83
ATRNL1-209ENST00000609571 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
ATRNL1-209ENST00000609571 ATP7AQ04656 1500 aa38.89■■■■□ 3.82
ATRNL1-209ENST00000609571 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.89■■■■□ 3.82
ATRNL1-209ENST00000609571 AFAP1Q8N556 730 aa38.88■■■■□ 3.81
ATRNL1-209ENST00000609571 CD109Q6YHK3 1445 aa38.84■■■■□ 3.81
ATRNL1-209ENST00000609571 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP38.79■■■■□ 3.8
ATRNL1-209ENST00000609571 NBPF8Q3BBV2 869 aa38.79■■■■□ 3.8
ATRNL1-209ENST00000609571 DEPDC5O75140 1603 aa38.78■■■■□ 3.8
ATRNL1-209ENST00000609571 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa38.76■■■■□ 3.8
ATRNL1-209ENST00000609571 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
ATRNL1-209ENST00000609571 ATP10AO60312 1499 aa38.76■■■■□ 3.8
ATRNL1-209ENST00000609571 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.76■■■■□ 3.79
ATRNL1-209ENST00000609571 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
ATRNL1-209ENST00000609571 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms