RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DAPK1P53355 1430 aa16.69■□□□□ 0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.69■□□□□ 0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.68■□□□□ 0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AKNAQ7Z591 1439 aa16.66■□□□□ 0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANP32CO43423 234 aa16.66■□□□□ 0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.66■□□□□ 0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.61■□□□□ 0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ROCK1Q13464 1354 aa16.61■□□□□ 0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUP160Q12769 1436 aa16.6■□□□□ 0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIF14Q15058 1648 aa16.59■□□□□ 0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.58■□□□□ 0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.58■□□□□ 0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.58■□□□□ 0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.57■□□□□ 0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.57■□□□□ 0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCER2I3L3R5 266 aa16.56■□□□□ 0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCOA1Q15788 1441 aa16.54■□□□□ 0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP10BO94823 1461 aa16.52■□□□□ 0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCANQ96GW7 911 aa16.49■□□□□ 0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PKD2Q13563 968 aa16.49■□□□□ 0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PZPP20742 1482 aa16.49■□□□□ 0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.47■□□□□ 0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCA8O94911 1581 aa16.47■□□□□ 0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.47■□□□□ 0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.46■□□□□ 0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTPRGP23470 1445 aa16.46■□□□□ 0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FKBP8Q14318 412 aa16.46■□□□□ 0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.45■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.45■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.44■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC184Q52MB2 194 aa16.44■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPY4P0CV99 314 aa16.43■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPY10P0CW01 314 aa16.43■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.42■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUP155O75694 1391 aa16.42■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADGRL2O95490 1459 aa16.42■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC7Q96M83 1385 aa16.41■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.41■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.4■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.39■□□□□ 0.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.39■□□□□ 0.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.38■□□□□ 0.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.38■□□□□ 0.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.38■□□□□ 0.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa16.37■□□□□ 0.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIF15Q9NS87 1388 aa16.36■□□□□ 0.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.35■□□□□ 0.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MBD5Q9P267 1494 aa16.33■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM9BQ8IZU0 186 aa16.33■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHD1O14646 1710 aa16.33■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEFLP07196 543 aa16.32■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.31■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP47Q96K76 1375 aa16.31■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.3■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRS2Q9HD23 443 aa16.3■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.29■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.29■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.29■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.28■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.28■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.27■□□□□ 0.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.26■□□□□ 0.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RGL3Q3MIN7 710 aa16.25■□□□□ 0.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.24■□□□□ 0.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.24■□□□□ 0.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.24■□□□□ 0.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.24■□□□□ 0.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.23■□□□□ 0.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PREX2Q70Z35 1606 aa16.23■□□□□ 0.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.22■□□□□ 0.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa16.22■□□□□ 0.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.21■□□□□ 0.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHROOM2Q13796 1616 aa16.2■□□□□ 0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.2■□□□□ 0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.2■□□□□ 0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.19■□□□□ 0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KDM5CP41229 1560 aa16.18■□□□□ 0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCC2Q92887 1545 aa16.18■□□□□ 0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.17■□□□□ 0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.17■□□□□ 0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.16■□□□□ 0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms