RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.32■■■□□ 2.12
FCHO1-230ENST00000600058 MLECQ14165 292 aa28.28■■■□□ 2.12
FCHO1-230ENST00000600058 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.26■■■□□ 2.11
FCHO1-230ENST00000600058 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.25■■■□□ 2.11
FCHO1-230ENST00000600058 ATP10AO60312 1499 aa28.25■■■□□ 2.11
FCHO1-230ENST00000600058 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.22■■■□□ 2.11
FCHO1-230ENST00000600058 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.2■■■□□ 2.11
FCHO1-230ENST00000600058 FMN1Q68DA7 1419 aa28.2■■■□□ 2.11
FCHO1-230ENST00000600058 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.2■■■□□ 2.1
FCHO1-230ENST00000600058 CERKQ8TCT0 537 aa28.19■■■□□ 2.1
FCHO1-230ENST00000600058 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
FCHO1-230ENST00000600058 KIF14Q15058 1648 aa28.16■■■□□ 2.1
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.15■■■□□ 2.1
FCHO1-230ENST00000600058 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
FCHO1-230ENST00000600058 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.13■■■□□ 2.09
FCHO1-230ENST00000600058 KDM5CP41229 1560 aa28.12■■■□□ 2.09
FCHO1-230ENST00000600058 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
FCHO1-230ENST00000600058 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.09■■■□□ 2.09
FCHO1-230ENST00000600058 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
FCHO1-230ENST00000600058 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
FCHO1-230ENST00000600058 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
FCHO1-230ENST00000600058 STRCQ7RTU9 1775 aa28.06■■■□□ 2.08
FCHO1-230ENST00000600058 CLIP1P30622 1438 aa28.05■■■□□ 2.08
FCHO1-230ENST00000600058 AFAP1Q8N556 730 aa28.05■■■□□ 2.08
FCHO1-230ENST00000600058 REREQ9P2R6 1566 aa28.05■■■□□ 2.08
FCHO1-230ENST00000600058 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.05■■■□□ 2.08
FCHO1-230ENST00000600058 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.04■■■□□ 2.08
FCHO1-230ENST00000600058 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.03■■■□□ 2.08
FCHO1-230ENST00000600058 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.02■■■□□ 2.08
FCHO1-230ENST00000600058 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.02■■■□□ 2.08
FCHO1-230ENST00000600058 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.02■■■□□ 2.08
FCHO1-230ENST00000600058 ABCA6Q8N139 1617 aa28■■■□□ 2.07
FCHO1-230ENST00000600058 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.99■■■□□ 2.07
FCHO1-230ENST00000600058 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.98■■■□□ 2.07
FCHO1-230ENST00000600058 C3P01024 1663 aa27.97■■■□□ 2.07
FCHO1-230ENST00000600058 PREX2Q70Z35 1606 aa27.96■■■□□ 2.07
FCHO1-230ENST00000600058 AGLP35573 1532 aa27.95■■■□□ 2.06
FCHO1-230ENST00000600058 ABCC1P33527 1531 aa27.93■■■□□ 2.06
FCHO1-230ENST00000600058 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.92■■■□□ 2.06
FCHO1-230ENST00000600058 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.91■■■□□ 2.06
FCHO1-230ENST00000600058 PTPRTO14522 1441 aa27.89■■■□□ 2.06
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.88■■■□□ 2.05
FCHO1-230ENST00000600058 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.87■■■□□ 2.05
FCHO1-230ENST00000600058 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
FCHO1-230ENST00000600058 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.85■■■□□ 2.05
FCHO1-230ENST00000600058 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.85■■■□□ 2.05
FCHO1-230ENST00000600058 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.83■■■□□ 2.05
FCHO1-230ENST00000600058 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.81■■■□□ 2.04
FCHO1-230ENST00000600058 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.78■■■□□ 2.04
FCHO1-230ENST00000600058 NCOA1Q15788 1441 aa27.77■■■□□ 2.04
FCHO1-230ENST00000600058 MROH2AA6NES4 1674 aa27.77■■■□□ 2.04
FCHO1-230ENST00000600058 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.77■■■□□ 2.04
FCHO1-230ENST00000600058 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.75■■■□□ 2.03
FCHO1-230ENST00000600058 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.74■■■□□ 2.03
FCHO1-230ENST00000600058 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.73■■■□□ 2.03
FCHO1-230ENST00000600058 ILDR2Q71H61 639 aa27.73■■■□□ 2.03
FCHO1-230ENST00000600058 NPATQ14207 1427 aa27.73■■■□□ 2.03
FCHO1-230ENST00000600058 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.7■■■□□ 2.02
FCHO1-230ENST00000600058 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.69■■■□□ 2.02
FCHO1-230ENST00000600058 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
FCHO1-230ENST00000600058 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.68■■■□□ 2.02
FCHO1-230ENST00000600058 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
FCHO1-230ENST00000600058 SOCS7O14512 581 aa27.67■■■□□ 2.02
FCHO1-230ENST00000600058 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
FCHO1-230ENST00000600058 ZMYM3Q14202 1370 aa27.66■■■□□ 2.02
FCHO1-230ENST00000600058 ATP7AQ04656 1500 aa27.64■■■□□ 2.02
FCHO1-230ENST00000600058 PLXNC1O60486 1568 aa27.63■■■□□ 2.01
FCHO1-230ENST00000600058 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
FCHO1-230ENST00000600058 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
FCHO1-230ENST00000600058 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.62■■■□□ 2.01
FCHO1-230ENST00000600058 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
FCHO1-230ENST00000600058 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.61■■■□□ 2.01
FCHO1-230ENST00000600058 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.59■■■□□ 2.01
FCHO1-230ENST00000600058 A2MP01023 1474 aa27.58■■■□□ 2.01
FCHO1-230ENST00000600058 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.56■■■□□ 2
FCHO1-230ENST00000600058 PLA2R1Q13018 1463 aa27.56■■■□□ 2
FCHO1-230ENST00000600058 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
FCHO1-230ENST00000600058 PTPRKQ15262 1439 aa27.55■■■□□ 2
FCHO1-230ENST00000600058 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
FCHO1-230ENST00000600058 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.53■■■□□ 2
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
FCHO1-230ENST00000600058 PKD2Q13563 968 aa27.52■■■□□ 2
FCHO1-230ENST00000600058 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.52■■■□□ 2
FCHO1-230ENST00000600058 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.51■■■□□ 2
FCHO1-230ENST00000600058 GGT6Q6P531 493 aa27.49■■□□□ 1.99
FCHO1-230ENST00000600058 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.48■■□□□ 1.99
FCHO1-230ENST00000600058 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.46■■□□□ 1.99
FCHO1-230ENST00000600058 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.45■■□□□ 1.98
FCHO1-230ENST00000600058 TIAM1Q13009 1591 aa27.43■■□□□ 1.98
FCHO1-230ENST00000600058 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.41■■□□□ 1.98
FCHO1-230ENST00000600058 MBD5Q9P267 1494 aa27.4■■□□□ 1.98
FCHO1-230ENST00000600058 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
FCHO1-230ENST00000600058 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.39■■□□□ 1.97
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
FCHO1-230ENST00000600058 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.37■■□□□ 1.97
FCHO1-230ENST00000600058 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
FCHO1-230ENST00000600058 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
FCHO1-230ENST00000600058 CEP162Q5TB80 1403 aa27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms