RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.6■■□□□ 1.37
FCHO1-228ENST00000599236 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
FCHO1-228ENST00000599236 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-228ENST00000599236 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-228ENST00000599236 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
FCHO1-228ENST00000599236 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-228ENST00000599236 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.53■■□□□ 1.36
FCHO1-228ENST00000599236 AFAP1Q8N556 730 aa23.52■■□□□ 1.36
FCHO1-228ENST00000599236 ATP10AO60312 1499 aa23.51■■□□□ 1.35
FCHO1-228ENST00000599236 KIF14Q15058 1648 aa23.5■■□□□ 1.35
FCHO1-228ENST00000599236 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.49■■□□□ 1.35
FCHO1-228ENST00000599236 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.48■■□□□ 1.35
FCHO1-228ENST00000599236 CERKQ8TCT0 537 aa23.47■■□□□ 1.35
FCHO1-228ENST00000599236 FMN1Q68DA7 1419 aa23.47■■□□□ 1.35
FCHO1-228ENST00000599236 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.45■■□□□ 1.34
FCHO1-228ENST00000599236 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.44■■□□□ 1.34
FCHO1-228ENST00000599236 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.44■■□□□ 1.34
FCHO1-228ENST00000599236 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
FCHO1-228ENST00000599236 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
FCHO1-228ENST00000599236 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.43■■□□□ 1.34
FCHO1-228ENST00000599236 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.38■■□□□ 1.33
FCHO1-228ENST00000599236 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.37■■□□□ 1.33
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.36■■□□□ 1.33
FCHO1-228ENST00000599236 KDM5CP41229 1560 aa23.35■■□□□ 1.33
FCHO1-228ENST00000599236 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.35■■□□□ 1.33
FCHO1-228ENST00000599236 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.34■■□□□ 1.33
FCHO1-228ENST00000599236 STRCQ7RTU9 1775 aa23.34■■□□□ 1.33
FCHO1-228ENST00000599236 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
FCHO1-228ENST00000599236 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.33■■□□□ 1.33
FCHO1-228ENST00000599236 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-228ENST00000599236 CLIP1P30622 1438 aa23.31■■□□□ 1.32
FCHO1-228ENST00000599236 ABCA6Q8N139 1617 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-228ENST00000599236 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-228ENST00000599236 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-228ENST00000599236 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-228ENST00000599236 ABCC1P33527 1531 aa23.23■■□□□ 1.31
FCHO1-228ENST00000599236 REREQ9P2R6 1566 aa23.23■■□□□ 1.31
FCHO1-228ENST00000599236 C3P01024 1663 aa23.23■■□□□ 1.31
FCHO1-228ENST00000599236 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.22■■□□□ 1.31
FCHO1-228ENST00000599236 PREX2Q70Z35 1606 aa23.22■■□□□ 1.31
FCHO1-228ENST00000599236 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.22■■□□□ 1.31
FCHO1-228ENST00000599236 AGLP35573 1532 aa23.2■■□□□ 1.3
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
FCHO1-228ENST00000599236 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.19■■□□□ 1.3
FCHO1-228ENST00000599236 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
FCHO1-228ENST00000599236 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.19■■□□□ 1.3
FCHO1-228ENST00000599236 ILDR2Q71H61 639 aa23.17■■□□□ 1.3
FCHO1-228ENST00000599236 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
FCHO1-228ENST00000599236 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.16■■□□□ 1.3
FCHO1-228ENST00000599236 PTPRTO14522 1441 aa23.15■■□□□ 1.3
FCHO1-228ENST00000599236 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-228ENST00000599236 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-228ENST00000599236 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-228ENST00000599236 ZMYM3Q14202 1370 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-228ENST00000599236 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-228ENST00000599236 NCOA1Q15788 1441 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-228ENST00000599236 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-228ENST00000599236 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-228ENST00000599236 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.08■■□□□ 1.28
FCHO1-228ENST00000599236 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-228ENST00000599236 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-228ENST00000599236 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-228ENST00000599236 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-228ENST00000599236 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.02■■□□□ 1.28
FCHO1-228ENST00000599236 GGT6Q6P531 493 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-228ENST00000599236 NPATQ14207 1427 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-228ENST00000599236 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
FCHO1-228ENST00000599236 A2MP01023 1474 aa22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-228ENST00000599236 ATP7AQ04656 1500 aa22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-228ENST00000599236 MROH2AA6NES4 1674 aa22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-228ENST00000599236 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-228ENST00000599236 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-228ENST00000599236 PTPRKQ15262 1439 aa22.97■■□□□ 1.27
FCHO1-228ENST00000599236 PLXNC1O60486 1568 aa22.96■■□□□ 1.27
FCHO1-228ENST00000599236 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
FCHO1-228ENST00000599236 SOCS7O14512 581 aa22.93■■□□□ 1.26
FCHO1-228ENST00000599236 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.92■■□□□ 1.26
FCHO1-228ENST00000599236 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.92■■□□□ 1.26
FCHO1-228ENST00000599236 MBD5Q9P267 1494 aa22.91■■□□□ 1.26
FCHO1-228ENST00000599236 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.89■■□□□ 1.25
FCHO1-228ENST00000599236 PKD2Q13563 968 aa22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-228ENST00000599236 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-228ENST00000599236 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-228ENST00000599236 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
FCHO1-228ENST00000599236 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.87■■□□□ 1.25
FCHO1-228ENST00000599236 TIAM1Q13009 1591 aa22.87■■□□□ 1.25
FCHO1-228ENST00000599236 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-228ENST00000599236 PLA2R1Q13018 1463 aa22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-228ENST00000599236 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.84■■□□□ 1.25
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
FCHO1-228ENST00000599236 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.84■■□□□ 1.25
FCHO1-228ENST00000599236 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
FCHO1-228ENST00000599236 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-228ENST00000599236 KIF3BO15066 747 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-228ENST00000599236 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.8■■□□□ 1.24
FCHO1-228ENST00000599236 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
FCHO1-228ENST00000599236 CEP162Q5TB80 1403 aa22.78■■□□□ 1.24
FCHO1-228ENST00000599236 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms