RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593111.1

PSME3-216, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene PSME3, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-216ENST00000593111 FMN1Q68DA7 1419 aa28.88■■■□□ 2.21
PSME3-216ENST00000593111 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.87■■■□□ 2.21
PSME3-216ENST00000593111 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.87■■■□□ 2.21
PSME3-216ENST00000593111 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.86■■■□□ 2.21
PSME3-216ENST00000593111 HECW1Q76N89 1606 aa28.85■■■□□ 2.21
PSME3-216ENST00000593111 HSPA2P54652 639 aa28.83■■■□□ 2.21
PSME3-216ENST00000593111 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.83■■■□□ 2.21
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PSME3-216ENST00000593111 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.79■■■□□ 2.2
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PSME3-216ENST00000593111 ATP10AO60312 1499 aa28.75■■■□□ 2.19
PSME3-216ENST00000593111 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.75■■■□□ 2.19
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PSME3-216ENST00000593111 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.7■■■□□ 2.19
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PSME3-216ENST00000593111 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.69■■■□□ 2.18
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PSME3-216ENST00000593111 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.66■■■□□ 2.18
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PSME3-216ENST00000593111 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.54■■■□□ 2.16
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PSME3-216ENST00000593111 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.49■■■□□ 2.15
PSME3-216ENST00000593111 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.49■■■□□ 2.15
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PSME3-216ENST00000593111 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.44■■■□□ 2.14
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PSME3-216ENST00000593111 REREQ9P2R6 1566 aa28.43■■■□□ 2.14
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PSME3-216ENST00000593111 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.4■■■□□ 2.14
PSME3-216ENST00000593111 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.38■■■□□ 2.13
PSME3-216ENST00000593111 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.38■■■□□ 2.13
PSME3-216ENST00000593111 AGLP35573 1532 aa28.38■■■□□ 2.13
PSME3-216ENST00000593111 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
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PSME3-216ENST00000593111 STRCQ7RTU9 1775 aa28.34■■■□□ 2.13
PSME3-216ENST00000593111 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.34■■■□□ 2.13
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PSME3-216ENST00000593111 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PSME3-216ENST00000593111 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.26■■■□□ 2.11
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PSME3-216ENST00000593111 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.19■■■□□ 2.1
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PSME3-216ENST00000593111 GGT6Q6P531 493 aa28.17■■■□□ 2.1
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PSME3-216ENST00000593111 A2MP01023 1474 aa28.15■■■□□ 2.1
PSME3-216ENST00000593111 NCOA1Q15788 1441 aa28.14■■■□□ 2.1
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PSME3-216ENST00000593111 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.1■■■□□ 2.09
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PSME3-216ENST00000593111 PLXNC1O60486 1568 aa28.06■■■□□ 2.08
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PSME3-216ENST00000593111 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.04■■■□□ 2.08
PSME3-216ENST00000593111 TIAM1Q13009 1591 aa28.02■■■□□ 2.08
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PSME3-216ENST00000593111 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28■■■□□ 2.07
PSME3-216ENST00000593111 PKD2Q13563 968 aa27.99■■■□□ 2.07
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PSME3-216ENST00000593111 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.96■■■□□ 2.07
PSME3-216ENST00000593111 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
PSME3-216ENST00000593111 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.96■■■□□ 2.07
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PSME3-216ENST00000593111 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
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PSME3-216ENST00000593111 ILDR2Q71H61 639 aa27.93■■■□□ 2.06
PSME3-216ENST00000593111 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
PSME3-216ENST00000593111 PLA2R1Q13018 1463 aa27.92■■■□□ 2.06
PSME3-216ENST00000593111 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.9■■■□□ 2.06
PSME3-216ENST00000593111 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.89■■■□□ 2.06
PSME3-216ENST00000593111 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
PSME3-216ENST00000593111 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
PSME3-216ENST00000593111 NCOA2Q15596 1464 aa27.87■■■□□ 2.05
PSME3-216ENST00000593111 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.86■■■□□ 2.05
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