RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.77■■■□□ 2.84
USP36-218ENST00000590546 OSCARQ8IYS5 282 aa32.76■■■□□ 2.84
USP36-218ENST00000590546 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
USP36-218ENST00000590546 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.74■■■□□ 2.83
USP36-218ENST00000590546 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.72■■■□□ 2.83
USP36-218ENST00000590546 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.72■■■□□ 2.83
USP36-218ENST00000590546 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
USP36-218ENST00000590546 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
USP36-218ENST00000590546 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.65■■■□□ 2.82
USP36-218ENST00000590546 PREX2Q70Z35 1606 aa32.63■■■□□ 2.81
USP36-218ENST00000590546 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
USP36-218ENST00000590546 ADGRL2O95490 1459 aa32.62■■■□□ 2.81
USP36-218ENST00000590546 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.61■■■□□ 2.81
USP36-218ENST00000590546 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.6■■■□□ 2.81
USP36-218ENST00000590546 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.59■■■□□ 2.81
USP36-218ENST00000590546 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.57■■■□□ 2.81
USP36-218ENST00000590546 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.57■■■□□ 2.8
USP36-218ENST00000590546 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.56■■■□□ 2.8
USP36-218ENST00000590546 NCOA1Q15788 1441 aa32.55■■■□□ 2.8
USP36-218ENST00000590546 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.55■■■□□ 2.8
USP36-218ENST00000590546 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.54■■■□□ 2.8
USP36-218ENST00000590546 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.52■■■□□ 2.8
USP36-218ENST00000590546 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.5■■■□□ 2.79
USP36-218ENST00000590546 KDM6BO15054 1643 aa32.5■■■□□ 2.79
USP36-218ENST00000590546 TSPY4P0CV99 314 aa32.49■■■□□ 2.79
USP36-218ENST00000590546 TSPY10P0CW01 314 aa32.49■■■□□ 2.79
USP36-218ENST00000590546 TRIM52Q96A61 297 aa32.49■■■□□ 2.79
USP36-218ENST00000590546 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.48■■■□□ 2.79
USP36-218ENST00000590546 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.48■■■□□ 2.79
USP36-218ENST00000590546 MBD5Q9P267 1494 aa32.47■■■□□ 2.79
USP36-218ENST00000590546 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.47■■■□□ 2.79
USP36-218ENST00000590546 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.46■■■□□ 2.79
USP36-218ENST00000590546 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.46■■■□□ 2.79
USP36-218ENST00000590546 KCNH8Q96L42 1107 aa32.45■■■□□ 2.78
USP36-218ENST00000590546 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.44■■■□□ 2.78
USP36-218ENST00000590546 PLCH2O75038 1416 aa32.43■■■□□ 2.78
USP36-218ENST00000590546 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.43■■■□□ 2.78
USP36-218ENST00000590546 NEUROD1Q13562 356 aa32.42■■■□□ 2.78
USP36-218ENST00000590546 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.4■■■□□ 2.78
USP36-218ENST00000590546 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.4■■■□□ 2.78
USP36-218ENST00000590546 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.39■■■□□ 2.785e-7■■■■□ 21
USP36-218ENST00000590546 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.38■■■□□ 2.77
USP36-218ENST00000590546 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
USP36-218ENST00000590546 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.36■■■□□ 2.77
USP36-218ENST00000590546 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.35■■■□□ 2.77
USP36-218ENST00000590546 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.33■■■□□ 2.77
USP36-218ENST00000590546 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.77
USP36-218ENST00000590546 TONSLQ96HA7 1378 aa32.32■■■□□ 2.77
USP36-218ENST00000590546 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.32■■■□□ 2.76
USP36-218ENST00000590546 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.3■■■□□ 2.76
USP36-218ENST00000590546 KIF15Q9NS87 1388 aa32.27■■■□□ 2.76
USP36-218ENST00000590546 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
USP36-218ENST00000590546 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
USP36-218ENST00000590546 ASXL2Q76L83 1435 aa32.25■■■□□ 2.75
USP36-218ENST00000590546 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.24■■■□□ 2.75
USP36-218ENST00000590546 ABCC1P33527 1531 aa32.21■■■□□ 2.75
USP36-218ENST00000590546 PZPP20742 1482 aa32.21■■■□□ 2.75
USP36-218ENST00000590546 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.18■■■□□ 2.74
USP36-218ENST00000590546 PLXNC1O60486 1568 aa32.17■■■□□ 2.74
USP36-218ENST00000590546 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.17■■■□□ 2.74
USP36-218ENST00000590546 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.15■■■□□ 2.74
USP36-218ENST00000590546 NUP155O75694 1391 aa32.1■■■□□ 2.73
USP36-218ENST00000590546 FANCAO15360 1455 aa32.09■■■□□ 2.73
USP36-218ENST00000590546 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
USP36-218ENST00000590546 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.07■■■□□ 2.72
USP36-218ENST00000590546 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.07■■■□□ 2.72
USP36-218ENST00000590546 FOXD1Q16676 465 aa32.05■■■□□ 2.72
USP36-218ENST00000590546 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.04■■■□□ 2.72
USP36-218ENST00000590546 PKD2Q13563 968 aa32.02■■■□□ 2.72
USP36-218ENST00000590546 ERBINQ96RT1 1412 aa32.02■■■□□ 2.72
USP36-218ENST00000590546 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
USP36-218ENST00000590546 UNC13BO14795 1591 aa31.98■■■□□ 2.71
USP36-218ENST00000590546 ADGRL1O94910 1474 aa31.96■■■□□ 2.71
USP36-218ENST00000590546 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.95■■■□□ 2.7
USP36-218ENST00000590546 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.93■■■□□ 2.7
USP36-218ENST00000590546 CD109Q6YHK3 1445 aa31.92■■■□□ 2.7
USP36-218ENST00000590546 L3MBTL2Q969R5 705 aa31.92■■■□□ 2.7
USP36-218ENST00000590546 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.92■■■□□ 2.7
USP36-218ENST00000590546 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.92■■■□□ 2.7
USP36-218ENST00000590546 AFAP1Q8N556 730 aa31.9■■■□□ 2.7
USP36-218ENST00000590546 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.89■■■□□ 2.7
USP36-218ENST00000590546 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.89■■■□□ 2.7
USP36-218ENST00000590546 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.89■■■□□ 2.7
USP36-218ENST00000590546 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.89■■■□□ 2.7
USP36-218ENST00000590546 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.88■■■□□ 2.69
USP36-218ENST00000590546 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
USP36-218ENST00000590546 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.86■■■□□ 2.69
USP36-218ENST00000590546 ATP7AQ04656 1500 aa31.85■■■□□ 2.69
USP36-218ENST00000590546 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.84■■■□□ 2.69
USP36-218ENST00000590546 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.82■■■□□ 2.68
USP36-218ENST00000590546 NEO1Q92859 1461 aa31.78■■■□□ 2.68
USP36-218ENST00000590546 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.76■■■□□ 2.673e-7■■□□□ 13.6
USP36-218ENST00000590546 MIER1Q8N108 512 aa31.73■■■□□ 2.67
USP36-218ENST00000590546 GLI2P10070 1586 aa31.73■■■□□ 2.67
USP36-218ENST00000590546 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
USP36-218ENST00000590546 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
USP36-218ENST00000590546 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.7■■■□□ 2.67
USP36-218ENST00000590546 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.7■■■□□ 2.67
USP36-218ENST00000590546 DEPDC5O75140 1603 aa31.7■■■□□ 2.66
USP36-218ENST00000590546 ATP10AO60312 1499 aa31.69■■■□□ 2.66
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