RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590112.5

CELF4-216, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene CELF4, Length 3,236 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4-216ENST00000590112 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.87■□□□□ 0.93
CELF4-216ENST00000590112 ERCC6Q03468 1493 aa20.87■□□□□ 0.93
CELF4-216ENST00000590112 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CELF4-216ENST00000590112 GRIN2AQ12879 1464 aa20.84■□□□□ 0.93
CELF4-216ENST00000590112 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CELF4-216ENST00000590112 MIA2Q96PC5 1412 aa20.84■□□□□ 0.93
CELF4-216ENST00000590112 KIAA0556O60303 1618 aa20.83■□□□□ 0.93
CELF4-216ENST00000590112 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 ABCC5O15440 1437 aa20.81■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 DAPK1P53355 1430 aa20.81■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.81■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.81■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 CCER2I3L3R5 266 aa20.8■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.79■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 MSH5O43196 834 aa20.78■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.77■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 JPH4Q96JJ6 628 aa20.77■□□□□ 0.92
CELF4-216ENST00000590112 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.75■□□□□ 0.91
CELF4-216ENST00000590112 NBR1Q14596 966 aa20.74■□□□□ 0.91
CELF4-216ENST00000590112 AKNAQ7Z591 1439 aa20.74■□□□□ 0.91
CELF4-216ENST00000590112 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CELF4-216ENST00000590112 CEP170Q5SW79 1584 aa20.71■□□□□ 0.91
CELF4-216ENST00000590112 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.71■□□□□ 0.91
CELF4-216ENST00000590112 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
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CELF4-216ENST00000590112 KIF14Q15058 1648 aa20.65■□□□□ 0.9
CELF4-216ENST00000590112 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.65■□□□□ 0.9
CELF4-216ENST00000590112 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CELF4-216ENST00000590112 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
CELF4-216ENST00000590112 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.64■□□□□ 0.89
CELF4-216ENST00000590112 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.63■□□□□ 0.89
CELF4-216ENST00000590112 PKD2Q13563 968 aa20.62■□□□□ 0.89
CELF4-216ENST00000590112 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CELF4-216ENST00000590112 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CELF4-216ENST00000590112 NCOA1Q15788 1441 aa20.61■□□□□ 0.89
CELF4-216ENST00000590112 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.61■□□□□ 0.89
CELF4-216ENST00000590112 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.59■□□□□ 0.89
CELF4-216ENST00000590112 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.59■□□□□ 0.89
CELF4-216ENST00000590112 CCDC7Q96M83 1385 aa20.58■□□□□ 0.89
CELF4-216ENST00000590112 PZPP20742 1482 aa20.58■□□□□ 0.89
CELF4-216ENST00000590112 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.58■□□□□ 0.89
CELF4-216ENST00000590112 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CELF4-216ENST00000590112 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
CELF4-216ENST00000590112 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.55■□□□□ 0.88
CELF4-216ENST00000590112 NUP160Q12769 1436 aa20.55■□□□□ 0.88
CELF4-216ENST00000590112 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.54■□□□□ 0.88
CELF4-216ENST00000590112 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CELF4-216ENST00000590112 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CELF4-216ENST00000590112 ATP10BO94823 1461 aa20.53■□□□□ 0.88
CELF4-216ENST00000590112 MRS2Q9HD23 443 aa20.52■□□□□ 0.88
CELF4-216ENST00000590112 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.52■□□□□ 0.88
CELF4-216ENST00000590112 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.52■□□□□ 0.88
CELF4-216ENST00000590112 NUP155O75694 1391 aa20.51■□□□□ 0.87
CELF4-216ENST00000590112 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.51■□□□□ 0.87
CELF4-216ENST00000590112 TSPY4P0CV99 314 aa20.49■□□□□ 0.87
CELF4-216ENST00000590112 TSPY10P0CW01 314 aa20.49■□□□□ 0.87
CELF4-216ENST00000590112 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CELF4-216ENST00000590112 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.48■□□□□ 0.87
CELF4-216ENST00000590112 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.47■□□□□ 0.87
CELF4-216ENST00000590112 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.47■□□□□ 0.87
CELF4-216ENST00000590112 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.47■□□□□ 0.87
CELF4-216ENST00000590112 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.45■□□□□ 0.86
CELF4-216ENST00000590112 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.44■□□□□ 0.86
CELF4-216ENST00000590112 PTPRGP23470 1445 aa20.44■□□□□ 0.86
CELF4-216ENST00000590112 ABCA8O94911 1581 aa20.43■□□□□ 0.86
CELF4-216ENST00000590112 USP47Q96K76 1375 aa20.42■□□□□ 0.86
CELF4-216ENST00000590112 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.42■□□□□ 0.86
CELF4-216ENST00000590112 ADGRL2O95490 1459 aa20.42■□□□□ 0.86
CELF4-216ENST00000590112 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.41■□□□□ 0.86
CELF4-216ENST00000590112 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.41■□□□□ 0.86
CELF4-216ENST00000590112 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.4■□□□□ 0.86
CELF4-216ENST00000590112 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.39■□□□□ 0.85
CELF4-216ENST00000590112 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
CELF4-216ENST00000590112 KIF15Q9NS87 1388 aa20.39■□□□□ 0.85
CELF4-216ENST00000590112 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.38■□□□□ 0.85
CELF4-216ENST00000590112 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.37■□□□□ 0.85
CELF4-216ENST00000590112 RGL3Q3MIN7 710 aa20.36■□□□□ 0.85
CELF4-216ENST00000590112 MBD5Q9P267 1494 aa20.34■□□□□ 0.85
CELF4-216ENST00000590112 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CELF4-216ENST00000590112 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.33■□□□□ 0.84
CELF4-216ENST00000590112 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.33■□□□□ 0.84
CELF4-216ENST00000590112 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CELF4-216ENST00000590112 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CELF4-216ENST00000590112 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CELF4-216ENST00000590112 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CELF4-216ENST00000590112 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CELF4-216ENST00000590112 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.26■□□□□ 0.83
CELF4-216ENST00000590112 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.26■□□□□ 0.83
CELF4-216ENST00000590112 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.25■□□□□ 0.83
CELF4-216ENST00000590112 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.25■□□□□ 0.83
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