RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 HSPA2P54652 639 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTN4-211ENST00000589528 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTN4-211ENST00000589528 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTN4-211ENST00000589528 PLCH2O75038 1416 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTN4-211ENST00000589528 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTN4-211ENST00000589528 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ACTN4-211ENST00000589528 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
ACTN4-211ENST00000589528 FMN1Q68DA7 1419 aa25.29■■□□□ 1.64
ACTN4-211ENST00000589528 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTN4-211ENST00000589528 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTN4-211ENST00000589528 ATP10AO60312 1499 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTN4-211ENST00000589528 KIF14Q15058 1648 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTN4-211ENST00000589528 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTN4-211ENST00000589528 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.2■■□□□ 1.63
ACTN4-211ENST00000589528 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTN4-211ENST00000589528 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTN4-211ENST00000589528 CLIP1P30622 1438 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTN4-211ENST00000589528 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-211ENST00000589528 CERKQ8TCT0 537 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN4-211ENST00000589528 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ACTN4-211ENST00000589528 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ACTN4-211ENST00000589528 KDM5CP41229 1560 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTN4-211ENST00000589528 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ACTN4-211ENST00000589528 AFAP1Q8N556 730 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTN4-211ENST00000589528 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTN4-211ENST00000589528 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTN4-211ENST00000589528 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTN4-211ENST00000589528 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTN4-211ENST00000589528 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ACTN4-211ENST00000589528 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTN4-211ENST00000589528 PREX2Q70Z35 1606 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTN4-211ENST00000589528 ABCA6Q8N139 1617 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTN4-211ENST00000589528 STRCQ7RTU9 1775 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTN4-211ENST00000589528 REREQ9P2R6 1566 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN4-211ENST00000589528 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25■■□□□ 1.59
ACTN4-211ENST00000589528 MLH3Q9UHC1 1453 aa25■■□□□ 1.59
ACTN4-211ENST00000589528 C3P01024 1663 aa25■■□□□ 1.59
ACTN4-211ENST00000589528 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25■■□□□ 1.59
ACTN4-211ENST00000589528 ABCC1P33527 1531 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTN4-211ENST00000589528 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.95■■□□□ 1.59
ACTN4-211ENST00000589528 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN4-211ENST00000589528 AGLP35573 1532 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN4-211ENST00000589528 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN4-211ENST00000589528 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN4-211ENST00000589528 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
ACTN4-211ENST00000589528 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTN4-211ENST00000589528 PTPRTO14522 1441 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTN4-211ENST00000589528 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTN4-211ENST00000589528 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTN4-211ENST00000589528 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN4-211ENST00000589528 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
ACTN4-211ENST00000589528 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTN4-211ENST00000589528 MROH2AA6NES4 1674 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTN4-211ENST00000589528 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ACTN4-211ENST00000589528 NCOA1Q15788 1441 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN4-211ENST00000589528 NPATQ14207 1427 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTN4-211ENST00000589528 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTN4-211ENST00000589528 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.555e-7■■■■□ 24.2
ACTN4-211ENST00000589528 ATP7AQ04656 1500 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTN4-211ENST00000589528 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ACTN4-211ENST00000589528 ZMYM3Q14202 1370 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTN4-211ENST00000589528 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ACTN4-211ENST00000589528 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTN4-211ENST00000589528 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTN4-211ENST00000589528 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ACTN4-211ENST00000589528 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTN4-211ENST00000589528 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTN4-211ENST00000589528 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTN4-211ENST00000589528 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
ACTN4-211ENST00000589528 ILDR2Q71H61 639 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTN4-211ENST00000589528 A2MP01023 1474 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTN4-211ENST00000589528 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTN4-211ENST00000589528 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTN4-211ENST00000589528 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
ACTN4-211ENST00000589528 GGT6Q6P531 493 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTN4-211ENST00000589528 PLXNC1O60486 1568 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTN4-211ENST00000589528 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTN4-211ENST00000589528 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTN4-211ENST00000589528 SOCS7O14512 581 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTN4-211ENST00000589528 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
ACTN4-211ENST00000589528 PKD2Q13563 968 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
ACTN4-211ENST00000589528 PLA2R1Q13018 1463 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTN4-211ENST00000589528 PTPRKQ15262 1439 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTN4-211ENST00000589528 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.58■■□□□ 1.53
ACTN4-211ENST00000589528 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTN4-211ENST00000589528 TIAM1Q13009 1591 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTN4-211ENST00000589528 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTN4-211ENST00000589528 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
ACTN4-211ENST00000589528 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTN4-211ENST00000589528 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTN4-211ENST00000589528 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
ACTN4-211ENST00000589528 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
ACTN4-211ENST00000589528 MBD5Q9P267 1494 aa24.48■■□□□ 1.51
ACTN4-211ENST00000589528 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
ACTN4-211ENST00000589528 CEP162Q5TB80 1403 aa24.46■■□□□ 1.51
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