RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588767.5

SLC25A39-211, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 5

Gene SLC25A39, Length 807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-211ENST00000588767 CERKQ8TCT0 537 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-211ENST00000588767 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC25A39-211ENST00000588767 FMN1Q68DA7 1419 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC25A39-211ENST00000588767 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-211ENST00000588767 PLCH2O75038 1416 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-211ENST00000588767 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.19■■□□□ 1.46
SLC25A39-211ENST00000588767 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A39-211ENST00000588767 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SLC25A39-211ENST00000588767 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-211ENST00000588767 ATP10AO60312 1499 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A39-211ENST00000588767 MLECQ14165 292 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A39-211ENST00000588767 CLIP1P30622 1438 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A39-211ENST00000588767 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A39-211ENST00000588767 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.14■■□□□ 1.45
SLC25A39-211ENST00000588767 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-211ENST00000588767 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-211ENST00000588767 KDM5CP41229 1560 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-211ENST00000588767 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-211ENST00000588767 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-211ENST00000588767 STRCQ7RTU9 1775 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC25A39-211ENST00000588767 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SLC25A39-211ENST00000588767 CEP162Q5TB80 1403 aa24.02■■□□□ 1.44
SLC25A39-211ENST00000588767 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SLC25A39-211ENST00000588767 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.02■■□□□ 1.44
SLC25A39-211ENST00000588767 REREQ9P2R6 1566 aa24.01■■□□□ 1.43
SLC25A39-211ENST00000588767 KIF14Q15058 1648 aa24.01■■□□□ 1.43
SLC25A39-211ENST00000588767 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.01■■□□□ 1.43
SLC25A39-211ENST00000588767 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.01■■□□□ 1.43
SLC25A39-211ENST00000588767 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.99■■□□□ 1.43
SLC25A39-211ENST00000588767 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SLC25A39-211ENST00000588767 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SLC25A39-211ENST00000588767 AFAP1Q8N556 730 aa23.96■■□□□ 1.43
SLC25A39-211ENST00000588767 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.95■■□□□ 1.43
SLC25A39-211ENST00000588767 PTPRTO14522 1441 aa23.95■■□□□ 1.42
SLC25A39-211ENST00000588767 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.95■■□□□ 1.42
SLC25A39-211ENST00000588767 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.94■■□□□ 1.42
SLC25A39-211ENST00000588767 ILDR2Q71H61 639 aa23.94■■□□□ 1.42
SLC25A39-211ENST00000588767 AGLP35573 1532 aa23.92■■□□□ 1.42
SLC25A39-211ENST00000588767 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.92■■□□□ 1.42
SLC25A39-211ENST00000588767 ABCA6Q8N139 1617 aa23.92■■□□□ 1.42
SLC25A39-211ENST00000588767 C3P01024 1663 aa23.9■■□□□ 1.42
SLC25A39-211ENST00000588767 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.9■■□□□ 1.42
SLC25A39-211ENST00000588767 SOCS7O14512 581 aa23.9■■□□□ 1.42
SLC25A39-211ENST00000588767 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.88■■□□□ 1.41
SLC25A39-211ENST00000588767 ABCC1P33527 1531 aa23.86■■□□□ 1.41
SLC25A39-211ENST00000588767 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.86■■□□□ 1.41
SLC25A39-211ENST00000588767 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.85■■□□□ 1.41
SLC25A39-211ENST00000588767 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.85■■□□□ 1.41
SLC25A39-211ENST00000588767 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.84■■□□□ 1.41
SLC25A39-211ENST00000588767 PREX2Q70Z35 1606 aa23.84■■□□□ 1.41
SLC25A39-211ENST00000588767 NCOA1Q15788 1441 aa23.84■■□□□ 1.41
SLC25A39-211ENST00000588767 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.83■■□□□ 1.41
SLC25A39-211ENST00000588767 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.82■■□□□ 1.4
SLC25A39-211ENST00000588767 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.81■■□□□ 1.4
SLC25A39-211ENST00000588767 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC25A39-211ENST00000588767 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.78■■□□□ 1.4
SLC25A39-211ENST00000588767 NPATQ14207 1427 aa23.76■■□□□ 1.39
SLC25A39-211ENST00000588767 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SLC25A39-211ENST00000588767 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.74■■□□□ 1.39
SLC25A39-211ENST00000588767 MROH2AA6NES4 1674 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-211ENST00000588767 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.71■■□□□ 1.39
SLC25A39-211ENST00000588767 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.7■■□□□ 1.38
SLC25A39-211ENST00000588767 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.7■■□□□ 1.38
SLC25A39-211ENST00000588767 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.69■■□□□ 1.38
SLC25A39-211ENST00000588767 ZMYM3Q14202 1370 aa23.66■■□□□ 1.38
SLC25A39-211ENST00000588767 PLA2R1Q13018 1463 aa23.64■■□□□ 1.38
SLC25A39-211ENST00000588767 PLXNC1O60486 1568 aa23.64■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.63■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 ATP7AQ04656 1500 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 PTPRKQ15262 1439 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.58■■□□□ 1.37
SLC25A39-211ENST00000588767 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 APLP2Q06481 763 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 PKD2Q13563 968 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 A2MP01023 1474 aa23.56■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 TIAM1Q13009 1591 aa23.55■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.55■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.53■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 MAP3K1Q13233 1512 aa23.52■■□□□ 1.36
SLC25A39-211ENST00000588767 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-211ENST00000588767 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-211ENST00000588767 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC25A39-211ENST00000588767 NCOA2Q15596 1464 aa23.47■■□□□ 1.35
SLC25A39-211ENST00000588767 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.46■■□□□ 1.35
SLC25A39-211ENST00000588767 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.44■■□□□ 1.34
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