RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574406.1

NLRP1-211, Transcript of NLR family pyrin domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene NLRP1, Length 1,750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1-211ENST00000574406 ABCC5O15440 1437 aa24.06■■□□□ 1.44
NLRP1-211ENST00000574406 NAIPQ13075 1403 aa24.06■■□□□ 1.44
NLRP1-211ENST00000574406 PREX2Q70Z35 1606 aa24.03■■□□□ 1.44
NLRP1-211ENST00000574406 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.03■■□□□ 1.44
NLRP1-211ENST00000574406 ROCK1Q13464 1354 aa24.03■■□□□ 1.44
NLRP1-211ENST00000574406 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
NLRP1-211ENST00000574406 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.01■■□□□ 1.43
NLRP1-211ENST00000574406 KCNH8Q96L42 1107 aa24■■□□□ 1.43
NLRP1-211ENST00000574406 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.99■■□□□ 1.43
NLRP1-211ENST00000574406 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.99■■□□□ 1.43
NLRP1-211ENST00000574406 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.99■■□□□ 1.43
NLRP1-211ENST00000574406 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.96■■□□□ 1.43
NLRP1-211ENST00000574406 MAPKBP1O60336 1514 aa23.95■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.94■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 PLCH2O75038 1416 aa23.93■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.93■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 ASXL2Q76L83 1435 aa23.93■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.93■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.92■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 MBD5Q9P267 1494 aa23.92■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.92■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 ADGRL2O95490 1459 aa23.91■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.91■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.89■■□□□ 1.42
NLRP1-211ENST00000574406 NCOA1Q15788 1441 aa23.89■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.88■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.87■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.87■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.87■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.86■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.86■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.86■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.85■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.85■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.85■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.84■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 KDM6BO15054 1643 aa23.84■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.84■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 TSPY4P0CV99 314 aa23.83■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 TSPY10P0CW01 314 aa23.83■■□□□ 1.41
NLRP1-211ENST00000574406 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.82■■□□□ 1.4
NLRP1-211ENST00000574406 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.79■■□□□ 1.4
NLRP1-211ENST00000574406 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.76■■□□□ 1.39
NLRP1-211ENST00000574406 TRIM52Q96A61 297 aa23.76■■□□□ 1.39
NLRP1-211ENST00000574406 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.76■■□□□ 1.39
NLRP1-211ENST00000574406 ABCC1P33527 1531 aa23.76■■□□□ 1.39
NLRP1-211ENST00000574406 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.75■■□□□ 1.39
NLRP1-211ENST00000574406 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.72■■□□□ 1.39
NLRP1-211ENST00000574406 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
NLRP1-211ENST00000574406 FANCAO15360 1455 aa23.71■■□□□ 1.39
NLRP1-211ENST00000574406 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.71■■□□□ 1.39
NLRP1-211ENST00000574406 KIF15Q9NS87 1388 aa23.7■■□□□ 1.38
NLRP1-211ENST00000574406 NEUROD1Q13562 356 aa23.69■■□□□ 1.38
NLRP1-211ENST00000574406 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
NLRP1-211ENST00000574406 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.68■■□□□ 1.38
NLRP1-211ENST00000574406 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.66■■□□□ 1.38
NLRP1-211ENST00000574406 CD109Q6YHK3 1445 aa23.65■■□□□ 1.38
NLRP1-211ENST00000574406 PLXNC1O60486 1568 aa23.65■■□□□ 1.38
NLRP1-211ENST00000574406 ADGRL1O94910 1474 aa23.61■■□□□ 1.37
NLRP1-211ENST00000574406 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.61■■□□□ 1.37
NLRP1-211ENST00000574406 PZPP20742 1482 aa23.6■■□□□ 1.37
NLRP1-211ENST00000574406 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.59■■□□□ 1.37
NLRP1-211ENST00000574406 TONSLQ96HA7 1378 aa23.59■■□□□ 1.37
NLRP1-211ENST00000574406 AFAP1Q8N556 730 aa23.58■■□□□ 1.37
NLRP1-211ENST00000574406 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.58■■□□□ 1.37
NLRP1-211ENST00000574406 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NLRP1-211ENST00000574406 GLI2P10070 1586 aa23.57■■□□□ 1.36
NLRP1-211ENST00000574406 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.57■■□□□ 1.36
NLRP1-211ENST00000574406 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
NLRP1-211ENST00000574406 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.56■■□□□ 1.36
NLRP1-211ENST00000574406 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.54■■□□□ 1.36
NLRP1-211ENST00000574406 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
NLRP1-211ENST00000574406 NUP155O75694 1391 aa23.53■■□□□ 1.36
NLRP1-211ENST00000574406 ERBINQ96RT1 1412 aa23.52■■□□□ 1.36
NLRP1-211ENST00000574406 NEO1Q92859 1461 aa23.52■■□□□ 1.36
NLRP1-211ENST00000574406 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.52■■□□□ 1.36
NLRP1-211ENST00000574406 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.52■■□□□ 1.36
NLRP1-211ENST00000574406 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
NLRP1-211ENST00000574406 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
NLRP1-211ENST00000574406 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.49■■□□□ 1.35
NLRP1-211ENST00000574406 FOXD1Q16676 465 aa23.49■■□□□ 1.35
NLRP1-211ENST00000574406 ATP7AQ04656 1500 aa23.49■■□□□ 1.35
NLRP1-211ENST00000574406 UNC13BO14795 1591 aa23.47■■□□□ 1.35
NLRP1-211ENST00000574406 DIP2BQ9P265 1576 aa23.47■■□□□ 1.35
NLRP1-211ENST00000574406 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.46■■□□□ 1.35
NLRP1-211ENST00000574406 PKD2Q13563 968 aa23.45■■□□□ 1.34
NLRP1-211ENST00000574406 KDM5CP41229 1560 aa23.43■■□□□ 1.34
NLRP1-211ENST00000574406 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.43■■□□□ 1.34
NLRP1-211ENST00000574406 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NLRP1-211ENST00000574406 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.43■■□□□ 1.34
NLRP1-211ENST00000574406 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.42■■□□□ 1.34
NLRP1-211ENST00000574406 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.4■■□□□ 1.34
NLRP1-211ENST00000574406 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.39■■□□□ 1.33
NLRP1-211ENST00000574406 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
NLRP1-211ENST00000574406 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.38■■□□□ 1.33
NLRP1-211ENST00000574406 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.35■■□□□ 1.33
NLRP1-211ENST00000574406 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120 ms