RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572656.2

TRAPPC1-205, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC1, Length 409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-205ENST00000572656 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1-205ENST00000572656 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 MLECQ14165 292 aa16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 HECW1Q76N89 1606 aa16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 HSPA2P54652 639 aa16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ATP10AO60312 1499 aa16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC1-205ENST00000572656 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC1-205ENST00000572656 AFAP1Q8N556 730 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1-205ENST00000572656 CLIP1P30622 1438 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1-205ENST00000572656 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1-205ENST00000572656 KIF14Q15058 1648 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1-205ENST00000572656 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1-205ENST00000572656 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1-205ENST00000572656 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1-205ENST00000572656 KDM5CP41229 1560 aa16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1-205ENST00000572656 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1-205ENST00000572656 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1-205ENST00000572656 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1-205ENST00000572656 CERKQ8TCT0 537 aa16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1-205ENST00000572656 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1-205ENST00000572656 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1-205ENST00000572656 REREQ9P2R6 1566 aa16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1-205ENST00000572656 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1-205ENST00000572656 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC1-205ENST00000572656 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1-205ENST00000572656 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1-205ENST00000572656 ABCC1P33527 1531 aa16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1-205ENST00000572656 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1-205ENST00000572656 AGLP35573 1532 aa16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1-205ENST00000572656 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1-205ENST00000572656 PREX2Q70Z35 1606 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1-205ENST00000572656 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1-205ENST00000572656 ABCA6Q8N139 1617 aa16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC1-205ENST00000572656 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC1-205ENST00000572656 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1-205ENST00000572656 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1-205ENST00000572656 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1-205ENST00000572656 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1-205ENST00000572656 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1-205ENST00000572656 PTPRTO14522 1441 aa16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC1-205ENST00000572656 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1-205ENST00000572656 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1-205ENST00000572656 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1-205ENST00000572656 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1-205ENST00000572656 C3P01024 1663 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC1-205ENST00000572656 STRCQ7RTU9 1775 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC1-205ENST00000572656 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC1-205ENST00000572656 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.99■□□□□ 0.15
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TRAPPC1-205ENST00000572656 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZMYM3Q14202 1370 aa15.98■□□□□ 0.15
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TRAPPC1-205ENST00000572656 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC1-205ENST00000572656 NCOA1Q15788 1441 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1-205ENST00000572656 ATP7AQ04656 1500 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1-205ENST00000572656 A2MP01023 1474 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1-205ENST00000572656 GGT6Q6P531 493 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1-205ENST00000572656 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1-205ENST00000572656 PLXNC1O60486 1568 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1-205ENST00000572656 MROH2AA6NES4 1674 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1-205ENST00000572656 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1-205ENST00000572656 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1-205ENST00000572656 PTPRKQ15262 1439 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1-205ENST00000572656 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1-205ENST00000572656 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1-205ENST00000572656 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1-205ENST00000572656 MBD5Q9P267 1494 aa15.88■□□□□ 0.13
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TRAPPC1-205ENST00000572656 PKD2Q13563 968 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC1-205ENST00000572656 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC1-205ENST00000572656 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1-205ENST00000572656 CEP162Q5TB80 1403 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1-205ENST00000572656 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1-205ENST00000572656 TIAM1Q13009 1591 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1-205ENST00000572656 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1-205ENST00000572656 PLA2R1Q13018 1463 aa15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1-205ENST00000572656 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC1-205ENST00000572656 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1-205ENST00000572656 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1-205ENST00000572656 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1-205ENST00000572656 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1-205ENST00000572656 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC1-205ENST00000572656 KIF3BO15066 747 aa15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1-205ENST00000572656 ILDR2Q71H61 639 aa15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC1-205ENST00000572656 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1-205ENST00000572656 NCOA2Q15596 1464 aa15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1-205ENST00000572656 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1-205ENST00000572656 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.77■□□□□ 0.12
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