RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568689.5

JMJD8-212, Transcript of jumonji domain containing 8, humanhuman

TSL 3

Gene JMJD8, Length 1,998 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8-212ENST00000568689 KCNH8Q96L42 1107 aa43.89■■■■■ 4.62
JMJD8-212ENST00000568689 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.89■■■■■ 4.62
JMJD8-212ENST00000568689 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.87■■■■■ 4.61
JMJD8-212ENST00000568689 NAIPQ13075 1403 aa43.86■■■■■ 4.61
JMJD8-212ENST00000568689 PREX2Q70Z35 1606 aa43.81■■■■■ 4.6
JMJD8-212ENST00000568689 AKNAQ7Z591 1439 aa43.8■■■■■ 4.6
JMJD8-212ENST00000568689 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.78■■■■■ 4.6
JMJD8-212ENST00000568689 CLSPNQ9HAW4 1339 aa43.78■■■■■ 4.6
JMJD8-212ENST00000568689 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.77■■■■■ 4.6
JMJD8-212ENST00000568689 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.76■■■■■ 4.6
JMJD8-212ENST00000568689 ROCK1Q13464 1354 aa43.73■■■■■ 4.59
JMJD8-212ENST00000568689 ASXL2Q76L83 1435 aa43.68■■■■■ 4.58
JMJD8-212ENST00000568689 GCC2Q8IWJ2 1684 aa43.68■■■■■ 4.58
JMJD8-212ENST00000568689 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.68■■■■■ 4.58
JMJD8-212ENST00000568689 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.67■■■■■ 4.58
JMJD8-212ENST00000568689 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.67■■■■■ 4.58
JMJD8-212ENST00000568689 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.66■■■■■ 4.58
JMJD8-212ENST00000568689 PLCH2O75038 1416 aa43.63■■■■■ 4.58
JMJD8-212ENST00000568689 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.61■■■■■ 4.57
JMJD8-212ENST00000568689 MBD5Q9P267 1494 aa43.59■■■■■ 4.57
JMJD8-212ENST00000568689 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.59■■■■■ 4.57
JMJD8-212ENST00000568689 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.59■■■■■ 4.57
JMJD8-212ENST00000568689 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.59■■■■■ 4.57
JMJD8-212ENST00000568689 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.59■■■■■ 4.57
JMJD8-212ENST00000568689 MAPKBP1O60336 1514 aa43.57■■■■■ 4.57
JMJD8-212ENST00000568689 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.56■■■■■ 4.56
JMJD8-212ENST00000568689 ADGRL2O95490 1459 aa43.54■■■■■ 4.56
JMJD8-212ENST00000568689 NCOA1Q15788 1441 aa43.54■■■■■ 4.56
JMJD8-212ENST00000568689 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.54■■■■■ 4.56
JMJD8-212ENST00000568689 KDM6BO15054 1643 aa43.53■■■■■ 4.56
JMJD8-212ENST00000568689 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.52■■■■■ 4.56
JMJD8-212ENST00000568689 ADGBQ8N7X0 1667 aa43.5■■■■■ 4.55
JMJD8-212ENST00000568689 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.49■■■■■ 4.55
JMJD8-212ENST00000568689 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.49■■■■■ 4.55
JMJD8-212ENST00000568689 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.48■■■■■ 4.55
JMJD8-212ENST00000568689 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.48■■■■■ 4.55
JMJD8-212ENST00000568689 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.47■■■■■ 4.55
JMJD8-212ENST00000568689 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.47■■■■■ 4.55
JMJD8-212ENST00000568689 TSPY4P0CV99 314 aa43.47■■■■■ 4.55
JMJD8-212ENST00000568689 TSPY10P0CW01 314 aa43.47■■■■■ 4.55
JMJD8-212ENST00000568689 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.47■■■■■ 4.55
JMJD8-212ENST00000568689 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa43.47■■■■■ 4.55
JMJD8-212ENST00000568689 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.47■■■■■ 4.55
JMJD8-212ENST00000568689 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.46■■■■■ 4.55
JMJD8-212ENST00000568689 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.37■■■■■ 4.53
JMJD8-212ENST00000568689 TRIM52Q96A61 297 aa43.34■■■■■ 4.53
JMJD8-212ENST00000568689 ABCC1P33527 1531 aa43.33■■■■■ 4.53
JMJD8-212ENST00000568689 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
JMJD8-212ENST00000568689 FANCAO15360 1455 aa43.28■■■■■ 4.52
JMJD8-212ENST00000568689 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa43.26■■■■■ 4.52
JMJD8-212ENST00000568689 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.26■■■■■ 4.52
JMJD8-212ENST00000568689 KIF15Q9NS87 1388 aa43.24■■■■■ 4.51
JMJD8-212ENST00000568689 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.21■■■■■ 4.51
JMJD8-212ENST00000568689 SIN3AQ96ST3 1273 aa43.2■■■■■ 4.51
JMJD8-212ENST00000568689 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
JMJD8-212ENST00000568689 CD109Q6YHK3 1445 aa43.17■■■■■ 4.5
JMJD8-212ENST00000568689 MPHOSPH9Q99550 1183 aa43.17■■■■■ 4.5
JMJD8-212ENST00000568689 NEUROD1Q13562 356 aa43.1■■■■■ 4.49
JMJD8-212ENST00000568689 ADGRL1O94910 1474 aa43.1■■■■■ 4.49
JMJD8-212ENST00000568689 PLXNC1O60486 1568 aa43.08■■■■■ 4.49
JMJD8-212ENST00000568689 AFAP1Q8N556 730 aa43.07■■■■■ 4.49
JMJD8-212ENST00000568689 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.06■■■■■ 4.48
JMJD8-212ENST00000568689 PZPP20742 1482 aa43.02■■■■■ 4.48
JMJD8-212ENST00000568689 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
JMJD8-212ENST00000568689 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
JMJD8-212ENST00000568689 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.98■■■■■ 4.47
JMJD8-212ENST00000568689 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa42.96■■■■■ 4.47
JMJD8-212ENST00000568689 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.96■■■■■ 4.47
JMJD8-212ENST00000568689 FOXD1Q16676 465 aa42.94■■■■■ 4.47
JMJD8-212ENST00000568689 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.94■■■■■ 4.46
JMJD8-212ENST00000568689 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.94■■■■■ 4.46
JMJD8-212ENST00000568689 GLI2P10070 1586 aa42.93■■■■■ 4.46
JMJD8-212ENST00000568689 NUP155O75694 1391 aa42.93■■■■■ 4.46
JMJD8-212ENST00000568689 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.89■■■■■ 4.46
JMJD8-212ENST00000568689 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.89■■■■■ 4.46
JMJD8-212ENST00000568689 ERBINQ96RT1 1412 aa42.86■■■■■ 4.45
JMJD8-212ENST00000568689 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
JMJD8-212ENST00000568689 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa42.86■■■■■ 4.45
JMJD8-212ENST00000568689 NEO1Q92859 1461 aa42.85■■■■■ 4.45
JMJD8-212ENST00000568689 ATP7AQ04656 1500 aa42.84■■■■■ 4.45
JMJD8-212ENST00000568689 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.83■■■■■ 4.45
JMJD8-212ENST00000568689 DIP2BQ9P265 1576 aa42.83■■■■■ 4.45
JMJD8-212ENST00000568689 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.82■■■■■ 4.45
JMJD8-212ENST00000568689 TONSLQ96HA7 1378 aa42.81■■■■■ 4.44
JMJD8-212ENST00000568689 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.79■■■■■ 4.44
JMJD8-212ENST00000568689 PKD2Q13563 968 aa42.79■■■■■ 4.44
JMJD8-212ENST00000568689 UNC13BO14795 1591 aa42.77■■■■■ 4.44
JMJD8-212ENST00000568689 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.74■■■■■ 4.43
JMJD8-212ENST00000568689 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
JMJD8-212ENST00000568689 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.71■■■■■ 4.43
JMJD8-212ENST00000568689 KDM5CP41229 1560 aa42.71■■■■■ 4.43
JMJD8-212ENST00000568689 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
JMJD8-212ENST00000568689 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.67■■■■■ 4.42
JMJD8-212ENST00000568689 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.67■■■■■ 4.42
JMJD8-212ENST00000568689 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.67■■■■■ 4.42
JMJD8-212ENST00000568689 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
JMJD8-212ENST00000568689 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.62■■■■■ 4.41
JMJD8-212ENST00000568689 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
JMJD8-212ENST00000568689 RAPGEF3O95398 923 aa42.6■■■■■ 4.41
JMJD8-212ENST00000568689 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.59■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms