RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 PLCH2O75038 1416 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80E-212ENST00000568043 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80E-212ENST00000568043 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.52■■■□□ 2.48
INO80E-212ENST00000568043 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.5■■■□□ 2.47
INO80E-212ENST00000568043 ATP10AO60312 1499 aa30.5■■■□□ 2.47
INO80E-212ENST00000568043 CERKQ8TCT0 537 aa30.47■■■□□ 2.47
INO80E-212ENST00000568043 KIF14Q15058 1648 aa30.47■■■□□ 2.47
INO80E-212ENST00000568043 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.45■■■□□ 2.46
INO80E-212ENST00000568043 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
INO80E-212ENST00000568043 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.42■■■□□ 2.46
INO80E-212ENST00000568043 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.42■■■□□ 2.46
INO80E-212ENST00000568043 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.42■■■□□ 2.46
INO80E-212ENST00000568043 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.41■■■□□ 2.46
INO80E-212ENST00000568043 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
INO80E-212ENST00000568043 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.39■■■□□ 2.46
INO80E-212ENST00000568043 FMN1Q68DA7 1419 aa30.39■■■□□ 2.45
INO80E-212ENST00000568043 STRCQ7RTU9 1775 aa30.38■■■□□ 2.45
INO80E-212ENST00000568043 KDM5CP41229 1560 aa30.37■■■□□ 2.45
INO80E-212ENST00000568043 AFAP1Q8N556 730 aa30.36■■■□□ 2.45
INO80E-212ENST00000568043 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.34■■■□□ 2.45
INO80E-212ENST00000568043 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
INO80E-212ENST00000568043 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
INO80E-212ENST00000568043 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
INO80E-212ENST00000568043 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.32■■■□□ 2.44
INO80E-212ENST00000568043 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.31■■■□□ 2.44
INO80E-212ENST00000568043 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
INO80E-212ENST00000568043 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.31■■■□□ 2.44
INO80E-212ENST00000568043 ABCA6Q8N139 1617 aa30.26■■■□□ 2.44
INO80E-212ENST00000568043 REREQ9P2R6 1566 aa30.24■■■□□ 2.43
INO80E-212ENST00000568043 C3P01024 1663 aa30.23■■■□□ 2.43
INO80E-212ENST00000568043 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.22■■■□□ 2.43
INO80E-212ENST00000568043 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.2■■■□□ 2.43
INO80E-212ENST00000568043 CLIP1P30622 1438 aa30.2■■■□□ 2.42
INO80E-212ENST00000568043 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.2■■■□□ 2.42
INO80E-212ENST00000568043 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.19■■■□□ 2.42
INO80E-212ENST00000568043 PREX2Q70Z35 1606 aa30.18■■■□□ 2.42
INO80E-212ENST00000568043 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.17■■■□□ 2.42
INO80E-212ENST00000568043 ABCC1P33527 1531 aa30.17■■■□□ 2.42
INO80E-212ENST00000568043 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.16■■■□□ 2.42
INO80E-212ENST00000568043 AGLP35573 1532 aa30.15■■■□□ 2.42
INO80E-212ENST00000568043 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.14■■■□□ 2.42
INO80E-212ENST00000568043 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.11■■■□□ 2.41
INO80E-212ENST00000568043 ILDR2Q71H61 639 aa30.1■■■□□ 2.41
INO80E-212ENST00000568043 PTPRTO14522 1441 aa30.09■■■□□ 2.41
INO80E-212ENST00000568043 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.05■■■□□ 2.4
INO80E-212ENST00000568043 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.05■■■□□ 2.4
INO80E-212ENST00000568043 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.04■■■□□ 2.4
INO80E-212ENST00000568043 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.03■■■□□ 2.4
INO80E-212ENST00000568043 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.02■■■□□ 2.4
INO80E-212ENST00000568043 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30■■■□□ 2.39
INO80E-212ENST00000568043 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
INO80E-212ENST00000568043 NCOA1Q15788 1441 aa29.99■■■□□ 2.39
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INO80E-212ENST00000568043 MROH2AA6NES4 1674 aa29.95■■■□□ 2.38
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INO80E-212ENST00000568043 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.92■■■□□ 2.38
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INO80E-212ENST00000568043 ZMYM3Q14202 1370 aa29.9■■■□□ 2.38
INO80E-212ENST00000568043 NPATQ14207 1427 aa29.89■■■□□ 2.38
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INO80E-212ENST00000568043 SOCS7O14512 581 aa29.88■■■□□ 2.37
INO80E-212ENST00000568043 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.87■■■□□ 2.37
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INO80E-212ENST00000568043 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
INO80E-212ENST00000568043 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
INO80E-212ENST00000568043 PLXNC1O60486 1568 aa29.84■■■□□ 2.37
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INO80E-212ENST00000568043 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.83■■■□□ 2.37
INO80E-212ENST00000568043 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
INO80E-212ENST00000568043 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
INO80E-212ENST00000568043 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.79■■■□□ 2.36
INO80E-212ENST00000568043 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.79■■■□□ 2.36
INO80E-212ENST00000568043 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
INO80E-212ENST00000568043 A2MP01023 1474 aa29.77■■■□□ 2.36
INO80E-212ENST00000568043 PTPRKQ15262 1439 aa29.77■■■□□ 2.36
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INO80E-212ENST00000568043 PLA2R1Q13018 1463 aa29.73■■■□□ 2.35
INO80E-212ENST00000568043 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
INO80E-212ENST00000568043 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.72■■■□□ 2.35
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INO80E-212ENST00000568043 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.69■■■□□ 2.34
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INO80E-212ENST00000568043 PKD2Q13563 968 aa29.67■■■□□ 2.34
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INO80E-212ENST00000568043 MBD5Q9P267 1494 aa29.63■■■□□ 2.33
INO80E-212ENST00000568043 TIAM1Q13009 1591 aa29.63■■■□□ 2.33
INO80E-212ENST00000568043 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
INO80E-212ENST00000568043 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.61■■■□□ 2.33
INO80E-212ENST00000568043 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.6■■■□□ 2.33
INO80E-212ENST00000568043 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.58■■■□□ 2.33
INO80E-212ENST00000568043 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.54■■■□□ 2.32
INO80E-212ENST00000568043 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
INO80E-212ENST00000568043 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.52■■■□□ 2.32
INO80E-212ENST00000568043 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
INO80E-212ENST00000568043 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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