RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.03■■■□□ 2.4
CTU2-210ENST00000567949 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30■■■□□ 2.39
CTU2-210ENST00000567949 ROCK1Q13464 1354 aa30■■■□□ 2.39
CTU2-210ENST00000567949 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.93■■■□□ 2.38
CTU2-210ENST00000567949 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CTU2-210ENST00000567949 OSCARQ8IYS5 282 aa29.92■■■□□ 2.38
CTU2-210ENST00000567949 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CTU2-210ENST00000567949 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
CTU2-210ENST00000567949 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.88■■■□□ 2.37
CTU2-210ENST00000567949 KDM6BO15054 1643 aa29.88■■■□□ 2.37
CTU2-210ENST00000567949 PREX2Q70Z35 1606 aa29.87■■■□□ 2.37
CTU2-210ENST00000567949 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.37
CTU2-210ENST00000567949 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.85■■■□□ 2.37
CTU2-210ENST00000567949 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CTU2-210ENST00000567949 ADGRL2O95490 1459 aa29.83■■■□□ 2.37
CTU2-210ENST00000567949 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.83■■■□□ 2.37
CTU2-210ENST00000567949 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.82■■■□□ 2.36
CTU2-210ENST00000567949 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.81■■■□□ 2.36
CTU2-210ENST00000567949 NCOA1Q15788 1441 aa29.8■■■□□ 2.36
CTU2-210ENST00000567949 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.79■■■□□ 2.36
CTU2-210ENST00000567949 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.78■■■□□ 2.36
CTU2-210ENST00000567949 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.77■■■□□ 2.36
CTU2-210ENST00000567949 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.77■■■□□ 2.36
CTU2-210ENST00000567949 NEUROD1Q13562 356 aa29.75■■■□□ 2.35
CTU2-210ENST00000567949 TRIM52Q96A61 297 aa29.75■■■□□ 2.35
CTU2-210ENST00000567949 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.75■■■□□ 2.35
CTU2-210ENST00000567949 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.74■■■□□ 2.35
CTU2-210ENST00000567949 MBD5Q9P267 1494 aa29.74■■■□□ 2.35
CTU2-210ENST00000567949 KCNH8Q96L42 1107 aa29.73■■■□□ 2.35
CTU2-210ENST00000567949 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.72■■■□□ 2.35
CTU2-210ENST00000567949 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.71■■■□□ 2.35
CTU2-210ENST00000567949 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
CTU2-210ENST00000567949 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.69■■■□□ 2.34
CTU2-210ENST00000567949 TSPY4P0CV99 314 aa29.68■■■□□ 2.34
CTU2-210ENST00000567949 TSPY10P0CW01 314 aa29.68■■■□□ 2.34
CTU2-210ENST00000567949 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.68■■■□□ 2.34
CTU2-210ENST00000567949 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CTU2-210ENST00000567949 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.67■■■□□ 2.34
CTU2-210ENST00000567949 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.67■■■□□ 2.34
CTU2-210ENST00000567949 PLCH2O75038 1416 aa29.65■■■□□ 2.34
CTU2-210ENST00000567949 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.64■■■□□ 2.34
CTU2-210ENST00000567949 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.63■■■□□ 2.33
CTU2-210ENST00000567949 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.63■■■□□ 2.33
CTU2-210ENST00000567949 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.62■■■□□ 2.33
CTU2-210ENST00000567949 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.6■■■□□ 2.33
CTU2-210ENST00000567949 TONSLQ96HA7 1378 aa29.57■■■□□ 2.32
CTU2-210ENST00000567949 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.56■■■□□ 2.32
CTU2-210ENST00000567949 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.56■■■□□ 2.32
CTU2-210ENST00000567949 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.55■■■□□ 2.32
CTU2-210ENST00000567949 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CTU2-210ENST00000567949 KIF15Q9NS87 1388 aa29.54■■■□□ 2.32
CTU2-210ENST00000567949 PZPP20742 1482 aa29.53■■■□□ 2.32
CTU2-210ENST00000567949 ASXL2Q76L83 1435 aa29.52■■■□□ 2.32
CTU2-210ENST00000567949 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
CTU2-210ENST00000567949 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.5■■■□□ 2.31
CTU2-210ENST00000567949 ABCC1P33527 1531 aa29.49■■■□□ 2.31
CTU2-210ENST00000567949 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.49■■■□□ 2.31
CTU2-210ENST00000567949 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.47■■■□□ 2.31
CTU2-210ENST00000567949 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
CTU2-210ENST00000567949 FOXD1Q16676 465 aa29.45■■■□□ 2.31
CTU2-210ENST00000567949 PLXNC1O60486 1568 aa29.44■■■□□ 2.3
CTU2-210ENST00000567949 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.43■■■□□ 2.3
CTU2-210ENST00000567949 NUP155O75694 1391 aa29.38■■■□□ 2.29
CTU2-210ENST00000567949 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CTU2-210ENST00000567949 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.36■■■□□ 2.29
CTU2-210ENST00000567949 FANCAO15360 1455 aa29.36■■■□□ 2.29
CTU2-210ENST00000567949 PKD2Q13563 968 aa29.32■■■□□ 2.28
CTU2-210ENST00000567949 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.32■■■□□ 2.28
CTU2-210ENST00000567949 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.29■■■□□ 2.28
CTU2-210ENST00000567949 UNC13BO14795 1591 aa29.28■■■□□ 2.28
CTU2-210ENST00000567949 ERBINQ96RT1 1412 aa29.26■■■□□ 2.28
CTU2-210ENST00000567949 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.26■■■□□ 2.27
CTU2-210ENST00000567949 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CTU2-210ENST00000567949 ADGRL1O94910 1474 aa29.24■■■□□ 2.27
CTU2-210ENST00000567949 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.24■■■□□ 2.27
CTU2-210ENST00000567949 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.24■■■□□ 2.27
CTU2-210ENST00000567949 AFAP1Q8N556 730 aa29.24■■■□□ 2.27
CTU2-210ENST00000567949 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.23■■■□□ 2.27
CTU2-210ENST00000567949 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.21■■■□□ 2.27
CTU2-210ENST00000567949 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.21■■■□□ 2.27
CTU2-210ENST00000567949 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.21■■■□□ 2.27
CTU2-210ENST00000567949 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.21■■■□□ 2.27
CTU2-210ENST00000567949 CD109Q6YHK3 1445 aa29.19■■■□□ 2.26
CTU2-210ENST00000567949 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CTU2-210ENST00000567949 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.17■■■□□ 2.26
CTU2-210ENST00000567949 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.17■■■□□ 2.26
CTU2-210ENST00000567949 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.16■■■□□ 2.26
CTU2-210ENST00000567949 MIER1Q8N108 512 aa29.16■■■□□ 2.26
CTU2-210ENST00000567949 ATP7AQ04656 1500 aa29.16■■■□□ 2.26
CTU2-210ENST00000567949 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.15■■■□□ 2.26
CTU2-210ENST00000567949 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
CTU2-210ENST00000567949 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.07■■■□□ 2.24
CTU2-210ENST00000567949 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CTU2-210ENST00000567949 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.04■■■□□ 2.24
CTU2-210ENST00000567949 NEO1Q92859 1461 aa29.02■■■□□ 2.24
CTU2-210ENST00000567949 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.01■■■□□ 2.24
CTU2-210ENST00000567949 DEPDC5O75140 1603 aa29.01■■■□□ 2.24
CTU2-210ENST00000567949 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.01■■■□□ 2.23
CTU2-210ENST00000567949 MYT1LQ9UL68 1186 aa29■■■□□ 2.23
CTU2-210ENST00000567949 KDM5CP41229 1560 aa29■■■□□ 2.23
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