RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561204.5

MEIS3-211, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEIS3, Length 2,195 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-211ENST00000561204 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-211ENST00000561204 SYNJ2O15056 1496 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-211ENST00000561204 FOXD1Q16676 465 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-211ENST00000561204 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-211ENST00000561204 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
MEIS3-211ENST00000561204 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
MEIS3-211ENST00000561204 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
MEIS3-211ENST00000561204 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.45■■□□□ 1.5
MEIS3-211ENST00000561204 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.44■■□□□ 1.5
MEIS3-211ENST00000561204 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.43■■□□□ 1.5
MEIS3-211ENST00000561204 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.41■■□□□ 1.5
MEIS3-211ENST00000561204 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.4■■□□□ 1.5
MEIS3-211ENST00000561204 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
MEIS3-211ENST00000561204 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.39■■□□□ 1.5
MEIS3-211ENST00000561204 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.39■■□□□ 1.5
MEIS3-211ENST00000561204 NUP160Q12769 1436 aa24.39■■□□□ 1.49
MEIS3-211ENST00000561204 KIF14Q15058 1648 aa24.39■■□□□ 1.49
MEIS3-211ENST00000561204 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
MEIS3-211ENST00000561204 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
MEIS3-211ENST00000561204 FBLN2P98095 1184 aa24.37■■□□□ 1.49
MEIS3-211ENST00000561204 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
MEIS3-211ENST00000561204 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.36■■□□□ 1.49
MEIS3-211ENST00000561204 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.35■■□□□ 1.49
MEIS3-211ENST00000561204 JPH4Q96JJ6 628 aa24.35■■□□□ 1.49
MEIS3-211ENST00000561204 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
MEIS3-211ENST00000561204 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.34■■□□□ 1.49
MEIS3-211ENST00000561204 NCOA1Q15788 1441 aa24.33■■□□□ 1.49
MEIS3-211ENST00000561204 PZPP20742 1482 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-211ENST00000561204 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-211ENST00000561204 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-211ENST00000561204 FKBP8Q14318 412 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-211ENST00000561204 ADGRL2O95490 1459 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-211ENST00000561204 ABCA8O94911 1581 aa24.26■■□□□ 1.47
MEIS3-211ENST00000561204 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.26■■□□□ 1.47
MEIS3-211ENST00000561204 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
MEIS3-211ENST00000561204 BCANQ96GW7 911 aa24.24■■□□□ 1.47
MEIS3-211ENST00000561204 CCDC7Q96M83 1385 aa24.24■■□□□ 1.47
MEIS3-211ENST00000561204 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-211ENST00000561204 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-211ENST00000561204 ATP10BO94823 1461 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-211ENST00000561204 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-211ENST00000561204 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.2■■□□□ 1.47
MEIS3-211ENST00000561204 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-211ENST00000561204 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-211ENST00000561204 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-211ENST00000561204 NEFLP07196 543 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-211ENST00000561204 MBD5Q9P267 1494 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-211ENST00000561204 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-211ENST00000561204 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-211ENST00000561204 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
MEIS3-211ENST00000561204 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.14■■□□□ 1.45
MEIS3-211ENST00000561204 PKD2Q13563 968 aa24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-211ENST00000561204 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-211ENST00000561204 CCDC184Q52MB2 194 aa24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-211ENST00000561204 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-211ENST00000561204 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.11■■□□□ 1.45
MEIS3-211ENST00000561204 NUP155O75694 1391 aa24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-211ENST00000561204 PTPRGP23470 1445 aa24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-211ENST00000561204 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.03■■□□□ 1.44
MEIS3-211ENST00000561204 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.03■■□□□ 1.44
MEIS3-211ENST00000561204 TSPY4P0CV99 314 aa24.01■■□□□ 1.43
MEIS3-211ENST00000561204 TSPY10P0CW01 314 aa24.01■■□□□ 1.43
MEIS3-211ENST00000561204 USP47Q96K76 1375 aa24.01■■□□□ 1.43
MEIS3-211ENST00000561204 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.01■■□□□ 1.43
MEIS3-211ENST00000561204 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
MEIS3-211ENST00000561204 KDM5CP41229 1560 aa23.99■■□□□ 1.43
MEIS3-211ENST00000561204 KIF15Q9NS87 1388 aa23.99■■□□□ 1.43
MEIS3-211ENST00000561204 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.99■■□□□ 1.43
MEIS3-211ENST00000561204 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.98■■□□□ 1.43
MEIS3-211ENST00000561204 MRS2Q9HD23 443 aa23.98■■□□□ 1.43
MEIS3-211ENST00000561204 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.98■■□□□ 1.43
MEIS3-211ENST00000561204 PREX2Q70Z35 1606 aa23.96■■□□□ 1.43
MEIS3-211ENST00000561204 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.95■■□□□ 1.42
MEIS3-211ENST00000561204 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.95■■□□□ 1.42
MEIS3-211ENST00000561204 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-211ENST00000561204 CHD1O14646 1710 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-211ENST00000561204 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-211ENST00000561204 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-211ENST00000561204 MYT1Q01538 1121 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-211ENST00000561204 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
MEIS3-211ENST00000561204 SHROOM2Q13796 1616 aa23.89■■□□□ 1.41
MEIS3-211ENST00000561204 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.88■■□□□ 1.41
MEIS3-211ENST00000561204 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.87■■□□□ 1.41
MEIS3-211ENST00000561204 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.87■■□□□ 1.41
MEIS3-211ENST00000561204 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
MEIS3-211ENST00000561204 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.86■■□□□ 1.41
MEIS3-211ENST00000561204 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.85■■□□□ 1.41
MEIS3-211ENST00000561204 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.85■■□□□ 1.41
MEIS3-211ENST00000561204 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.84■■□□□ 1.41
MEIS3-211ENST00000561204 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.41
MEIS3-211ENST00000561204 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.82■■□□□ 1.4
MEIS3-211ENST00000561204 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.82■■□□□ 1.4
MEIS3-211ENST00000561204 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.81■■□□□ 1.4
MEIS3-211ENST00000561204 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.81■■□□□ 1.4
MEIS3-211ENST00000561204 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.8■■□□□ 1.4
MEIS3-211ENST00000561204 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
MEIS3-211ENST00000561204 ABCC2Q92887 1545 aa23.78■■□□□ 1.4
MEIS3-211ENST00000561204 UNC13BO14795 1591 aa23.78■■□□□ 1.4
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