RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561040.1

MEIS3-209, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEIS3, Length 1,809 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-209ENST00000561040 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.87■■□□□ 1.41
MEIS3-209ENST00000561040 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.87■■□□□ 1.41
MEIS3-209ENST00000561040 ABCC5O15440 1437 aa23.85■■□□□ 1.41
MEIS3-209ENST00000561040 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.85■■□□□ 1.41
MEIS3-209ENST00000561040 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.85■■□□□ 1.41
MEIS3-209ENST00000561040 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.84■■□□□ 1.41
MEIS3-209ENST00000561040 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.8■■□□□ 1.4
MEIS3-209ENST00000561040 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.79■■□□□ 1.4
MEIS3-209ENST00000561040 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
MEIS3-209ENST00000561040 PREX2Q70Z35 1606 aa23.77■■□□□ 1.4
MEIS3-209ENST00000561040 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
MEIS3-209ENST00000561040 ADGRL2O95490 1459 aa23.77■■□□□ 1.4
MEIS3-209ENST00000561040 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.76■■□□□ 1.39
MEIS3-209ENST00000561040 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.73■■□□□ 1.39
MEIS3-209ENST00000561040 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
MEIS3-209ENST00000561040 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.73■■□□□ 1.39
MEIS3-209ENST00000561040 KDM6BO15054 1643 aa23.72■■□□□ 1.39
MEIS3-209ENST00000561040 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.71■■□□□ 1.39
MEIS3-209ENST00000561040 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
MEIS3-209ENST00000561040 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-209ENST00000561040 NCOA1Q15788 1441 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-209ENST00000561040 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.68■■□□□ 1.38
MEIS3-209ENST00000561040 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-209ENST00000561040 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.66■■□□□ 1.38
MEIS3-209ENST00000561040 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.66■■□□□ 1.38
MEIS3-209ENST00000561040 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-209ENST00000561040 NEUROD1Q13562 356 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-209ENST00000561040 TRIM52Q96A61 297 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-209ENST00000561040 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.64■■□□□ 1.37
MEIS3-209ENST00000561040 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.63■■□□□ 1.37
MEIS3-209ENST00000561040 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.62■■□□□ 1.37
MEIS3-209ENST00000561040 TONSLQ96HA7 1378 aa23.61■■□□□ 1.37
MEIS3-209ENST00000561040 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.61■■□□□ 1.37
MEIS3-209ENST00000561040 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-209ENST00000561040 OSCARQ8IYS5 282 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-209ENST00000561040 MBD5Q9P267 1494 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-209ENST00000561040 TSPY4P0CV99 314 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-209ENST00000561040 TSPY10P0CW01 314 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-209ENST00000561040 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-209ENST00000561040 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
MEIS3-209ENST00000561040 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-209ENST00000561040 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.56■■□□□ 1.36
MEIS3-209ENST00000561040 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
MEIS3-209ENST00000561040 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.55■■□□□ 1.36
MEIS3-209ENST00000561040 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.54■■□□□ 1.36
MEIS3-209ENST00000561040 PLCH2O75038 1416 aa23.53■■□□□ 1.36
MEIS3-209ENST00000561040 MYT1Q01538 1121 aa23.52■■□□□ 1.36
MEIS3-209ENST00000561040 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.51■■□□□ 1.35
MEIS3-209ENST00000561040 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
MEIS3-209ENST00000561040 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.49■■□□□ 1.35
MEIS3-209ENST00000561040 PZPP20742 1482 aa23.48■■□□□ 1.35
MEIS3-209ENST00000561040 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.48■■□□□ 1.35
MEIS3-209ENST00000561040 KCNH8Q96L42 1107 aa23.47■■□□□ 1.35
MEIS3-209ENST00000561040 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
MEIS3-209ENST00000561040 PLXNC1O60486 1568 aa23.47■■□□□ 1.35
MEIS3-209ENST00000561040 KIF15Q9NS87 1388 aa23.46■■□□□ 1.35
MEIS3-209ENST00000561040 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.45■■□□□ 1.34
MEIS3-209ENST00000561040 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.45■■□□□ 1.34
MEIS3-209ENST00000561040 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.45■■□□□ 1.34
MEIS3-209ENST00000561040 ABCC1P33527 1531 aa23.43■■□□□ 1.34
MEIS3-209ENST00000561040 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.43■■□□□ 1.34
MEIS3-209ENST00000561040 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
MEIS3-209ENST00000561040 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.35■■□□□ 1.33
MEIS3-209ENST00000561040 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
MEIS3-209ENST00000561040 NUP155O75694 1391 aa23.35■■□□□ 1.33
MEIS3-209ENST00000561040 ASXL2Q76L83 1435 aa23.35■■□□□ 1.33
MEIS3-209ENST00000561040 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.35■■□□□ 1.33
MEIS3-209ENST00000561040 UNC13BO14795 1591 aa23.35■■□□□ 1.33
MEIS3-209ENST00000561040 FOXD1Q16676 465 aa23.31■■□□□ 1.32
MEIS3-209ENST00000561040 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.3■■□□□ 1.32
MEIS3-209ENST00000561040 ERBINQ96RT1 1412 aa23.3■■□□□ 1.32
MEIS3-209ENST00000561040 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.3■■□□□ 1.32
MEIS3-209ENST00000561040 PKD2Q13563 968 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-209ENST00000561040 MIER1Q8N108 512 aa23.29■■□□□ 1.32
MEIS3-209ENST00000561040 FANCAO15360 1455 aa23.28■■□□□ 1.32
MEIS3-209ENST00000561040 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.26■■□□□ 1.31
MEIS3-209ENST00000561040 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.26■■□□□ 1.31
MEIS3-209ENST00000561040 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.26■■□□□ 1.31
MEIS3-209ENST00000561040 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.25■■□□□ 1.31
MEIS3-209ENST00000561040 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.24■■□□□ 1.31
MEIS3-209ENST00000561040 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.23■■□□□ 1.31
MEIS3-209ENST00000561040 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.22■■□□□ 1.31
MEIS3-209ENST00000561040 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
MEIS3-209ENST00000561040 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
MEIS3-209ENST00000561040 ADGRL1O94910 1474 aa23.19■■□□□ 1.3
MEIS3-209ENST00000561040 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
MEIS3-209ENST00000561040 ATP7AQ04656 1500 aa23.17■■□□□ 1.3
MEIS3-209ENST00000561040 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
MEIS3-209ENST00000561040 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.13■■□□□ 1.29
MEIS3-209ENST00000561040 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
MEIS3-209ENST00000561040 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
MEIS3-209ENST00000561040 DEPDC5O75140 1603 aa23.11■■□□□ 1.29
MEIS3-209ENST00000561040 CD109Q6YHK3 1445 aa23.11■■□□□ 1.29
MEIS3-209ENST00000561040 AFAP1Q8N556 730 aa23.1■■□□□ 1.29
MEIS3-209ENST00000561040 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.09■■□□□ 1.29
MEIS3-209ENST00000561040 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.08■■□□□ 1.29
MEIS3-209ENST00000561040 ATP10AO60312 1499 aa23.08■■□□□ 1.29
MEIS3-209ENST00000561040 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.07■■□□□ 1.28
MEIS3-209ENST00000561040 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
MEIS3-209ENST00000561040 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
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