RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 MLECQ14165 292 aa33.27■■■□□ 2.92
RABGGTA-214ENST00000560163 CERKQ8TCT0 537 aa33.26■■■□□ 2.91
RABGGTA-214ENST00000560163 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.26■■■□□ 2.91
RABGGTA-214ENST00000560163 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.22■■■□□ 2.91
RABGGTA-214ENST00000560163 ATP10AO60312 1499 aa33.21■■■□□ 2.91
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RABGGTA-214ENST00000560163 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.1■■■□□ 2.89
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RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.04■■■□□ 2.88
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RABGGTA-214ENST00000560163 AFAP1Q8N556 730 aa33.02■■■□□ 2.88
RABGGTA-214ENST00000560163 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
RABGGTA-214ENST00000560163 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.87
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RABGGTA-214ENST00000560163 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.94■■■□□ 2.86
RABGGTA-214ENST00000560163 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.94■■■□□ 2.86
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RABGGTA-214ENST00000560163 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.88■■■□□ 2.85
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RABGGTA-214ENST00000560163 ABCA6Q8N139 1617 aa32.86■■■□□ 2.85
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RABGGTA-214ENST00000560163 PTPRTO14522 1441 aa32.85■■■□□ 2.85
RABGGTA-214ENST00000560163 AGLP35573 1532 aa32.84■■■□□ 2.85
RABGGTA-214ENST00000560163 ILDR2Q71H61 639 aa32.83■■■□□ 2.85
RABGGTA-214ENST00000560163 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.82■■■□□ 2.84
RABGGTA-214ENST00000560163 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.81■■■□□ 2.84
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RABGGTA-214ENST00000560163 ABCC1P33527 1531 aa32.77■■■□□ 2.84
RABGGTA-214ENST00000560163 PREX2Q70Z35 1606 aa32.77■■■□□ 2.84
RABGGTA-214ENST00000560163 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.73■■■□□ 2.83
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RABGGTA-214ENST00000560163 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.66■■■□□ 2.82
RABGGTA-214ENST00000560163 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.65■■■□□ 2.82
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RABGGTA-214ENST00000560163 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa32.47■■■□□ 2.79
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RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
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RABGGTA-214ENST00000560163 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
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RABGGTA-214ENST00000560163 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.28■■■□□ 2.76
RABGGTA-214ENST00000560163 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.25■■■□□ 2.75
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RABGGTA-214ENST00000560163 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.17■■■□□ 2.74
RABGGTA-214ENST00000560163 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.17■■■□□ 2.74
RABGGTA-214ENST00000560163 TIAM1Q13009 1591 aa32.15■■■□□ 2.74
RABGGTA-214ENST00000560163 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
RABGGTA-214ENST00000560163 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
RABGGTA-214ENST00000560163 NEURL4Q96JN8 1562 aa32.1■■■□□ 2.73
RABGGTA-214ENST00000560163 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
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