RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557014.1

GTF3AP2-201, Transcript of general transcription factor IIIA pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GTF3AP2, Length 266 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AP2-201ENST00000557014 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 AKNAQ7Z591 1439 aa4.95□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 YEATS2Q9ULM3 1422 aa4.95□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 HECW1Q76N89 1606 aa4.94□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 EFCAB5A4FU69 1503 aa4.94□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa4.94□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 FHOD3Q2V2M9 1422 aa4.94□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 SAMD9Q5K651 1589 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 C3P01024 1663 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 LTBP4Q8N2S1 1624 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 ATP10AO60312 1499 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 MAGI2Q86UL8 1455 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 PRXQ9BXM0 1461 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 PTPRTO14522 1441 aa4.9□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 MYO5CQ9NQX4 1742 aa4.9□□□□□ -1.62
GTF3AP2-201ENST00000557014 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 C9orf84Q5VXU9 1444 aa4.89□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 SCAPERQ9BY12 1400 aa4.89□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 IQSEC2Q5JU85 1478 aa4.89□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 PLEKHD1A6NEE1 506 aa4.89□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 UBAP1LF5GYI3 381 aa4.88□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 NCOA1Q15788 1441 aa4.88□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa4.87□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa4.87□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 PLCH2O75038 1416 aa4.87□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 KIF14Q15058 1648 aa4.86□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 ABCA6Q8N139 1617 aa4.86□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 AFAP1Q8N556 730 aa4.86□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 MYT1LQ9UL68 1186 aa4.86□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 KDM5CP41229 1560 aa4.86□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa4.85□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa4.85□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa4.85□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 REREQ9P2R6 1566 aa4.85□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa4.85□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa4.84□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 MROH2AA6NES4 1674 aa4.84□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 ARHGAP5Q13017 1502 aa4.84□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 HSPA1LP34931 641 aa4.84□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa4.84□□□□□ -1.63
GTF3AP2-201ENST00000557014 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa4.83□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 ITSN2Q9NZM3 1697 aa4.83□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 MYO3AQ8NEV4 1616 aa4.83□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 AGLP35573 1532 aa4.83□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 PIP4K2BP78356 416 aa4.83□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 PREX2Q70Z35 1606 aa4.82□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 MLH3Q9UHC1 1453 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 NPATQ14207 1427 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 CNTLNQ9NXG0 1405 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 CSRNP3Q8WYN3 585 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 ABCC1P33527 1531 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZMYM3Q14202 1370 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 PKD2Q13563 968 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 PLA2R1Q13018 1463 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 ALKQ9UM73 1620 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 TOM1O60784 492 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 RNF39Q9H2S5 420 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 NEURL4Q96JN8 1562 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 STRCP1A6NGW2 1772 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 CPS1P31327 1500 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 SHANK2Q9UPX8 1470 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 DCAF8L1A6NGE4 600 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 CLIP1P30622 1438 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 PTPRKQ15262 1439 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3AP2-201ENST00000557014 A2ML1A8K2U0 1454 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 EHMT2Q96KQ7 1210 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 FMN1Q68DA7 1419 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 VWDEQ8N2E2 1590 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 SYCP2Q9BX26 1530 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 ADGBQ8N7X0 1667 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 PLXNC1O60486 1568 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.2 ms