RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556039.5

ERO1A-206, Transcript of endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha, humanhuman

TSL 5

Gene ERO1A, Length 1,855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERO1A-206ENST00000556039 ROCK1Q13464 1354 aa44.53■■■■■ 4.72
ERO1A-206ENST00000556039 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.5■■■■■ 4.71
ERO1A-206ENST00000556039 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa44.5■■■■■ 4.71
ERO1A-206ENST00000556039 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
ERO1A-206ENST00000556039 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
ERO1A-206ENST00000556039 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.7
ERO1A-206ENST00000556039 OSCARQ8IYS5 282 aa44.36■■■■■ 4.69
ERO1A-206ENST00000556039 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.36■■■■■ 4.69
ERO1A-206ENST00000556039 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.69
ERO1A-206ENST00000556039 CROCC2H7BZ55 1655 aa44.29■■■■■ 4.68
ERO1A-206ENST00000556039 PREX2Q70Z35 1606 aa44.28■■■■■ 4.68
ERO1A-206ENST00000556039 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa44.26■■■■■ 4.68
ERO1A-206ENST00000556039 ADGBQ8N7X0 1667 aa44.26■■■■■ 4.68
ERO1A-206ENST00000556039 KDM6BO15054 1643 aa44.25■■■■■ 4.67
ERO1A-206ENST00000556039 ADGRL2O95490 1459 aa44.25■■■■■ 4.67
ERO1A-206ENST00000556039 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.23■■■■■ 4.67
ERO1A-206ENST00000556039 NCOA1Q15788 1441 aa44.2■■■■■ 4.67
ERO1A-206ENST00000556039 SIN3AQ96ST3 1273 aa44.2■■■■■ 4.67
ERO1A-206ENST00000556039 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa44.2■■■■■ 4.67
ERO1A-206ENST00000556039 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.2■■■■■ 4.67
ERO1A-206ENST00000556039 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.19■■■■■ 4.66
ERO1A-206ENST00000556039 ARHGEF5Q12774 1597 aa44.16■■■■■ 4.66
ERO1A-206ENST00000556039 TRIM52Q96A61 297 aa44.16■■■■■ 4.66
ERO1A-206ENST00000556039 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa44.15■■■■■ 4.66
ERO1A-206ENST00000556039 NEUROD1Q13562 356 aa44.15■■■■■ 4.66
ERO1A-206ENST00000556039 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa44.11■■■■■ 4.65
ERO1A-206ENST00000556039 MYO5CQ9NQX4 1742 aa44.1■■■■■ 4.65
ERO1A-206ENST00000556039 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
ERO1A-206ENST00000556039 MBD5Q9P267 1494 aa44.08■■■■■ 4.65
ERO1A-206ENST00000556039 RSPH4AQ5TD94 716 aa44.08■■■■■ 4.65
ERO1A-206ENST00000556039 KCNH8Q96L42 1107 aa44.08■■■■■ 4.65
ERO1A-206ENST00000556039 ARHGAP5Q13017 1502 aa44.07■■■■■ 4.65
ERO1A-206ENST00000556039 C9orf84Q5VXU9 1444 aa44.07■■■■■ 4.65
ERO1A-206ENST00000556039 TSPY4P0CV99 314 aa44.06■■■■■ 4.64
ERO1A-206ENST00000556039 TSPY10P0CW01 314 aa44.06■■■■■ 4.64
ERO1A-206ENST00000556039 MPHOSPH9Q99550 1183 aa44.02■■■■■ 4.64
ERO1A-206ENST00000556039 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP44.02■■■■■ 4.641e-6■■■□□ 16.8
ERO1A-206ENST00000556039 CCDC141Q6ZP82 1450 aa44.01■■■■■ 4.64
ERO1A-206ENST00000556039 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
ERO1A-206ENST00000556039 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa44■■■■■ 4.63
ERO1A-206ENST00000556039 PLCH2O75038 1416 aa43.98■■■■■ 4.63
ERO1A-206ENST00000556039 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.95■■■■■ 4.63
ERO1A-206ENST00000556039 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.94■■■■■ 4.62
ERO1A-206ENST00000556039 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa43.92■■■■■ 4.62
ERO1A-206ENST00000556039 TONSLQ96HA7 1378 aa43.91■■■■■ 4.62
ERO1A-206ENST00000556039 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.9■■■■■ 4.62
ERO1A-206ENST00000556039 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.87■■■■■ 4.61
ERO1A-206ENST00000556039 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
ERO1A-206ENST00000556039 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.85■■■■■ 4.61
ERO1A-206ENST00000556039 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.83■■■■■ 4.61
ERO1A-206ENST00000556039 KIF15Q9NS87 1388 aa43.82■■■■■ 4.6
ERO1A-206ENST00000556039 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
ERO1A-206ENST00000556039 PZPP20742 1482 aa43.78■■■■■ 4.6
ERO1A-206ENST00000556039 ASXL2Q76L83 1435 aa43.75■■■■■ 4.59
ERO1A-206ENST00000556039 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.74■■■■■ 4.59
ERO1A-206ENST00000556039 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa43.73■■■■■ 4.59
ERO1A-206ENST00000556039 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.72■■■■■ 4.59
ERO1A-206ENST00000556039 ABCC1P33527 1531 aa43.71■■■■■ 4.59
ERO1A-206ENST00000556039 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.7■■■■■ 4.59
ERO1A-206ENST00000556039 FOXD1Q16676 465 aa43.66■■■■■ 4.58
ERO1A-206ENST00000556039 PLXNC1O60486 1568 aa43.65■■■■■ 4.58
ERO1A-206ENST00000556039 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.65■■■■■ 4.58
ERO1A-206ENST00000556039 NUP155O75694 1391 aa43.6■■■■■ 4.57
ERO1A-206ENST00000556039 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
ERO1A-206ENST00000556039 FANCAO15360 1455 aa43.54■■■■■ 4.56
ERO1A-206ENST00000556039 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.52■■■■■ 4.56
ERO1A-206ENST00000556039 PKD2Q13563 968 aa43.51■■■■■ 4.56
ERO1A-206ENST00000556039 DUOX2Q9NRD8 1548 aa43.5■■■■■ 4.55
ERO1A-206ENST00000556039 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa43.45■■■■■ 4.55
ERO1A-206ENST00000556039 ERBINQ96RT1 1412 aa43.42■■■■■ 4.54
ERO1A-206ENST00000556039 UNC13BO14795 1591 aa43.42■■■■■ 4.54
ERO1A-206ENST00000556039 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
ERO1A-206ENST00000556039 L3MBTL2Q969R5 705 aa43.4■■■■■ 4.54
ERO1A-206ENST00000556039 ADGRL1O94910 1474 aa43.37■■■■■ 4.53
ERO1A-206ENST00000556039 FAM135AQ9P2D6 1515 aa43.36■■■■■ 4.53
ERO1A-206ENST00000556039 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.36■■■■■ 4.53
ERO1A-206ENST00000556039 AFAP1Q8N556 730 aa43.34■■■■■ 4.53
ERO1A-206ENST00000556039 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.33■■■■■ 4.53
ERO1A-206ENST00000556039 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.31■■■■■ 4.52
ERO1A-206ENST00000556039 CD109Q6YHK3 1445 aa43.29■■■■■ 4.52
ERO1A-206ENST00000556039 MIER1Q8N108 512 aa43.27■■■■■ 4.52
ERO1A-206ENST00000556039 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.27■■■■■ 4.52
ERO1A-206ENST00000556039 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.26■■■■■ 4.52
ERO1A-206ENST00000556039 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
ERO1A-206ENST00000556039 IQGAP3Q86VI3 1631 aa43.24■■■■■ 4.51
ERO1A-206ENST00000556039 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.24■■■■■ 4.51
ERO1A-206ENST00000556039 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.24■■■■■ 4.51
ERO1A-206ENST00000556039 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.24■■■■■ 4.51
ERO1A-206ENST00000556039 ATP7AQ04656 1500 aa43.22■■■■■ 4.51
ERO1A-206ENST00000556039 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.2■■■■■ 4.51
ERO1A-206ENST00000556039 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP43.17■■■■■ 4.51e-6■□□□□ 9.4
ERO1A-206ENST00000556039 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.13■■■■■ 4.49
ERO1A-206ENST00000556039 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
ERO1A-206ENST00000556039 NBPF8Q3BBV2 869 aa43.06■■■■■ 4.48
ERO1A-206ENST00000556039 NEO1Q92859 1461 aa43.04■■■■■ 4.48
ERO1A-206ENST00000556039 MYT1LQ9UL68 1186 aa43.04■■■■■ 4.48
ERO1A-206ENST00000556039 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.02■■■■■ 4.48
ERO1A-206ENST00000556039 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP43.01■■■■■ 4.48
ERO1A-206ENST00000556039 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
ERO1A-206ENST00000556039 DEPDC5O75140 1603 aa43.01■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms