RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555834.5

RPS6KL1-211, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 2

Gene RPS6KL1, Length 5,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-211ENST00000555834 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.96■□□□□ 0.95
RPS6KL1-211ENST00000555834 GBP4Q96PP9 640 aa20.95■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 ARID3AQ99856 593 aa20.95■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 A0A0G2JS52 829 aa20.95■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 KCNJ4P48050 445 aa20.94■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 FGD1P98174 961 aa20.94■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.94■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 DRC7Q8IY82 874 aa20.93■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.92■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.92■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 PTMSP20962 102 aa20.91■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 MCCP23508 829 aa20.9■□□□□ 0.94
RPS6KL1-211ENST00000555834 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-211ENST00000555834 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-211ENST00000555834 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-211ENST00000555834 POGKQ9P215 609 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-211ENST00000555834 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-211ENST00000555834 CFAP44Q96MT7 982 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KL1-211ENST00000555834 FOXD1Q16676 465 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-211ENST00000555834 MORC1Q86VD1 984 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-211ENST00000555834 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-211ENST00000555834 RALBP1Q15311 655 aa20.82■□□□□ 0.92
RPS6KL1-211ENST00000555834 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
RPS6KL1-211ENST00000555834 USP35Q9P2H5 1018 aa20.79■□□□□ 0.92
RPS6KL1-211ENST00000555834 APBB1O00213 710 aa20.79■□□□□ 0.92
RPS6KL1-211ENST00000555834 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
RPS6KL1-211ENST00000555834 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.78■□□□□ 0.92
RPS6KL1-211ENST00000555834 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
RPS6KL1-211ENST00000555834 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.76■□□□□ 0.91
RPS6KL1-211ENST00000555834 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.75■□□□□ 0.91
RPS6KL1-211ENST00000555834 PKD2Q13563 968 aa20.75■□□□□ 0.91
RPS6KL1-211ENST00000555834 ERCC6Q03468 1493 aa20.75■□□□□ 0.91
RPS6KL1-211ENST00000555834 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
RPS6KL1-211ENST00000555834 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
RPS6KL1-211ENST00000555834 GSE1Q14687 1217 aa20.72■□□□□ 0.91
RPS6KL1-211ENST00000555834 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.71■□□□□ 0.91
RPS6KL1-211ENST00000555834 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.71■□□□□ 0.91
RPS6KL1-211ENST00000555834 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 PDE4AP27815 886 aa20.69■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.69■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 SLC4A3P48751 1232 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 WIZO95785 1651 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 GOLGA2Q08379 1002 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 PDE3BQ13370 1112 aa20.67■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 KANK1Q14678 1352 aa20.65■□□□□ 0.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 NLRP13Q86W25 1043 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 SOX12O15370 315 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 FAM161AQ3B820 660 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 FMN1Q68DA7 1419 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 SMARCA2P51531 1590 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 NUP155O75694 1391 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.56■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 PLIN1O60240 522 aa20.55■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.55■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.54■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 PHF14O94880 888 aa20.52■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 KIF15Q9NS87 1388 aa20.52■□□□□ 0.88
RPS6KL1-211ENST00000555834 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.52■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 TPM4P67936 248 aa20.51■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.51■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 STK26Q9P289 416 aa20.51■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 GGT6Q6P531 493 aa20.5■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 CRBNQ96SW2 442 aa20.5■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.5■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 ST18O60284 1047 aa20.5■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms