RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555497.5

TMEM260-207, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM260, Length 2,218 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-207ENST00000555497 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
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TMEM260-207ENST00000555497 ROCK1Q13464 1354 aa34.94■■■■□ 3.18
TMEM260-207ENST00000555497 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.93■■■■□ 3.18
TMEM260-207ENST00000555497 TRIM52Q96A61 297 aa34.93■■■■□ 3.18
TMEM260-207ENST00000555497 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.92■■■■□ 3.18
TMEM260-207ENST00000555497 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
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TMEM260-207ENST00000555497 PTPRGP23470 1445 aa34.89■■■■□ 3.18
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TMEM260-207ENST00000555497 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
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TMEM260-207ENST00000555497 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.81■■■■□ 3.16
TMEM260-207ENST00000555497 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.8■■■■□ 3.16
TMEM260-207ENST00000555497 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.73■■■■□ 3.15
TMEM260-207ENST00000555497 FOXD1Q16676 465 aa34.73■■■■□ 3.15
TMEM260-207ENST00000555497 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.72■■■■□ 3.15
TMEM260-207ENST00000555497 NCOA1Q15788 1441 aa34.72■■■■□ 3.15
TMEM260-207ENST00000555497 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
TMEM260-207ENST00000555497 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.72■■■■□ 3.15
TMEM260-207ENST00000555497 ADGRL2O95490 1459 aa34.67■■■■□ 3.14
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TMEM260-207ENST00000555497 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa34.61■■■■□ 3.13
TMEM260-207ENST00000555497 PZPP20742 1482 aa34.57■■■■□ 3.13
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TMEM260-207ENST00000555497 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.56■■■■□ 3.12
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TMEM260-207ENST00000555497 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.53■■■■□ 3.12
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TMEM260-207ENST00000555497 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.51■■■■□ 3.12
TMEM260-207ENST00000555497 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.51■■■■□ 3.12
TMEM260-207ENST00000555497 ABCC2Q92887 1545 aa34.51■■■■□ 3.11
TMEM260-207ENST00000555497 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.5■■■■□ 3.11
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TMEM260-207ENST00000555497 PREX2Q70Z35 1606 aa34.49■■■■□ 3.11
TMEM260-207ENST00000555497 MBD5Q9P267 1494 aa34.47■■■■□ 3.11
TMEM260-207ENST00000555497 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.47■■■■□ 3.11
TMEM260-207ENST00000555497 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.47■■■■□ 3.11
TMEM260-207ENST00000555497 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.45■■■■□ 3.11
TMEM260-207ENST00000555497 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.43■■■■□ 3.1
TMEM260-207ENST00000555497 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.1
TMEM260-207ENST00000555497 TSPY4P0CV99 314 aa34.41■■■■□ 3.1
TMEM260-207ENST00000555497 TSPY10P0CW01 314 aa34.41■■■■□ 3.1
TMEM260-207ENST00000555497 KCNH8Q96L42 1107 aa34.41■■■■□ 3.1
TMEM260-207ENST00000555497 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.41■■■■□ 3.1
TMEM260-207ENST00000555497 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.36■■■■□ 3.09
TMEM260-207ENST00000555497 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.34■■■■□ 3.09
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TMEM260-207ENST00000555497 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.24■■■■□ 3.07
TMEM260-207ENST00000555497 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.24■■■■□ 3.07
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TMEM260-207ENST00000555497 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.07■■■■□ 3.04
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TMEM260-207ENST00000555497 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.92■■■■□ 3.02
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TMEM260-207ENST00000555497 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33.87■■■■□ 3.01
TMEM260-207ENST00000555497 PLA2R1Q13018 1463 aa33.85■■■■□ 3.01
TMEM260-207ENST00000555497 USP47Q96K76 1375 aa33.85■■■■□ 3.01
TMEM260-207ENST00000555497 ERBINQ96RT1 1412 aa33.84■■■■□ 3.01
TMEM260-207ENST00000555497 RALGAPBQ86X10 1494 aa33.83■■■■□ 3.01
TMEM260-207ENST00000555497 KDM5CP41229 1560 aa33.83■■■■□ 3.01
TMEM260-207ENST00000555497 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa33.83■■■■□ 3.01
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TMEM260-207ENST00000555497 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.82■■■■□ 3
TMEM260-207ENST00000555497 AFAP1Q8N556 730 aa33.81■■■■□ 3
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