RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-209ENST00000555009 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
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RPS6KL1-209ENST00000555009 MIA2Q96PC5 1412 aa25.84■■□□□ 1.73
RPS6KL1-209ENST00000555009 KDM6BO15054 1643 aa25.81■■□□□ 1.72
RPS6KL1-209ENST00000555009 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.8■■□□□ 1.72
RPS6KL1-209ENST00000555009 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
RPS6KL1-209ENST00000555009 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.78■■□□□ 1.72
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
RPS6KL1-209ENST00000555009 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
RPS6KL1-209ENST00000555009 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.76■■□□□ 1.71
RPS6KL1-209ENST00000555009 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
RPS6KL1-209ENST00000555009 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIF14Q15058 1648 aa25.72■■□□□ 1.71
RPS6KL1-209ENST00000555009 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
RPS6KL1-209ENST00000555009 AKNAQ7Z591 1439 aa25.71■■□□□ 1.71
RPS6KL1-209ENST00000555009 DAPK1P53355 1430 aa25.7■■□□□ 1.7
RPS6KL1-209ENST00000555009 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
RPS6KL1-209ENST00000555009 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABCC5O15440 1437 aa25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1-209ENST00000555009 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.66■■□□□ 1.7
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABCA8O94911 1581 aa25.65■■□□□ 1.7
RPS6KL1-209ENST00000555009 CHD1O14646 1710 aa25.64■■□□□ 1.7
RPS6KL1-209ENST00000555009 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.64■■□□□ 1.69
RPS6KL1-209ENST00000555009 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
RPS6KL1-209ENST00000555009 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.63■■□□□ 1.69
RPS6KL1-209ENST00000555009 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.62■■□□□ 1.69
RPS6KL1-209ENST00000555009 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
RPS6KL1-209ENST00000555009 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.61■■□□□ 1.69
RPS6KL1-209ENST00000555009 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.59■■□□□ 1.69
RPS6KL1-209ENST00000555009 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
RPS6KL1-209ENST00000555009 ATP10BO94823 1461 aa25.59■■□□□ 1.69
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC184Q52MB2 194 aa25.58■■□□□ 1.69
RPS6KL1-209ENST00000555009 FOXD1Q16676 465 aa25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1-209ENST00000555009 ROCK1Q13464 1354 aa25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1-209ENST00000555009 NCOA1Q15788 1441 aa25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1-209ENST00000555009 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC7Q96M83 1385 aa25.56■■□□□ 1.68
RPS6KL1-209ENST00000555009 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.54■■□□□ 1.68
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
RPS6KL1-209ENST00000555009 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.52■■□□□ 1.68
RPS6KL1-209ENST00000555009 MSH5O43196 834 aa25.52■■□□□ 1.68
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.51■■□□□ 1.67
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.51■■□□□ 1.67
RPS6KL1-209ENST00000555009 PTPRGP23470 1445 aa25.5■■□□□ 1.67
RPS6KL1-209ENST00000555009 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
RPS6KL1-209ENST00000555009 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.48■■□□□ 1.67
RPS6KL1-209ENST00000555009 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.48■■□□□ 1.67
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.48■■□□□ 1.67
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1-209ENST00000555009 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1-209ENST00000555009 MRS2Q9HD23 443 aa25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1-209ENST00000555009 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1-209ENST00000555009 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1-209ENST00000555009 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.45■■□□□ 1.66
RPS6KL1-209ENST00000555009 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.44■■□□□ 1.66
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.43■■□□□ 1.66
RPS6KL1-209ENST00000555009 SHROOM2Q13796 1616 aa25.42■■□□□ 1.66
RPS6KL1-209ENST00000555009 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.42■■□□□ 1.66
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.41■■□□□ 1.66
RPS6KL1-209ENST00000555009 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
RPS6KL1-209ENST00000555009 ADGRL2O95490 1459 aa25.38■■□□□ 1.65
RPS6KL1-209ENST00000555009 PZPP20742 1482 aa25.36■■□□□ 1.65
RPS6KL1-209ENST00000555009 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
RPS6KL1-209ENST00000555009 BCL11AQ9H165 835 aa25.31■■□□□ 1.64
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.31■■□□□ 1.64
RPS6KL1-209ENST00000555009 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.31■■□□□ 1.64
RPS6KL1-209ENST00000555009 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.3■■□□□ 1.64
RPS6KL1-209ENST00000555009 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.3■■□□□ 1.64
RPS6KL1-209ENST00000555009 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.28■■□□□ 1.64
RPS6KL1-209ENST00000555009 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.27■■□□□ 1.64
RPS6KL1-209ENST00000555009 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.26■■□□□ 1.63
RPS6KL1-209ENST00000555009 PREX2Q70Z35 1606 aa25.26■■□□□ 1.63
RPS6KL1-209ENST00000555009 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.26■■□□□ 1.63
RPS6KL1-209ENST00000555009 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.26■■□□□ 1.63
RPS6KL1-209ENST00000555009 MBD5Q9P267 1494 aa25.24■■□□□ 1.63
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABCC2Q92887 1545 aa25.23■■□□□ 1.63
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RPS6KL1-209ENST00000555009 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.22■■□□□ 1.63
RPS6KL1-209ENST00000555009 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.63
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.2■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 TSPY4P0CV99 314 aa25.2■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 TSPY10P0CW01 314 aa25.2■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 PKD2Q13563 968 aa25.19■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.19■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 USP47Q96K76 1375 aa25.19■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIF15Q9NS87 1388 aa25.17■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.16■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.16■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.16■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 NUP155O75694 1391 aa25.15■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.15■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS6KL1-209ENST00000555009 NUDCQ9Y266 331 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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