RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
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PRRX1-208ENST00000553786 MLECQ14165 292 aa27.87■■■□□ 2.05
PRRX1-208ENST00000553786 HSPA2P54652 639 aa27.86■■■□□ 2.05
PRRX1-208ENST00000553786 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.83■■■□□ 2.05
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PRRX1-208ENST00000553786 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.82■■■□□ 2.04
PRRX1-208ENST00000553786 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
PRRX1-208ENST00000553786 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.81■■■□□ 2.04
PRRX1-208ENST00000553786 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.8■■■□□ 2.04
PRRX1-208ENST00000553786 ATP10AO60312 1499 aa27.8■■■□□ 2.04
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PRRX1-208ENST00000553786 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.77■■■□□ 2.04
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PRRX1-208ENST00000553786 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.76■■■□□ 2.03
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PRRX1-208ENST00000553786 CLIP1P30622 1438 aa27.75■■■□□ 2.03
PRRX1-208ENST00000553786 KDM5CP41229 1560 aa27.69■■■□□ 2.02
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PRRX1-208ENST00000553786 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.66■■■□□ 2.02
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PRRX1-208ENST00000553786 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.62■■■□□ 2.01
PRRX1-208ENST00000553786 CERKQ8TCT0 537 aa27.61■■■□□ 2.01
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PRRX1-208ENST00000553786 AGLP35573 1532 aa27.49■■□□□ 1.99
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PRRX1-208ENST00000553786 STRCQ7RTU9 1775 aa27.45■■□□□ 1.98
PRRX1-208ENST00000553786 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.44■■□□□ 1.98
PRRX1-208ENST00000553786 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.42■■□□□ 1.98
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PRRX1-208ENST00000553786 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.36■■□□□ 1.97
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PRRX1-208ENST00000553786 A2MP01023 1474 aa27.21■■□□□ 1.95
PRRX1-208ENST00000553786 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.21■■□□□ 1.95
PRRX1-208ENST00000553786 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.21■■□□□ 1.95
PRRX1-208ENST00000553786 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.21■■□□□ 1.95
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PRRX1-208ENST00000553786 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.11■■□□□ 1.93
PRRX1-208ENST00000553786 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.1■■□□□ 1.93
PRRX1-208ENST00000553786 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
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PRRX1-208ENST00000553786 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
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PRRX1-208ENST00000553786 MBD5Q9P267 1494 aa27.05■■□□□ 1.92
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PRRX1-208ENST00000553786 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PRRX1-208ENST00000553786 CEP162Q5TB80 1403 aa27.02■■□□□ 1.92
PRRX1-208ENST00000553786 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.01■■□□□ 1.91
PRRX1-208ENST00000553786 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.98■■□□□ 1.91
PRRX1-208ENST00000553786 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
PRRX1-208ENST00000553786 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.96■■□□□ 1.91
PRRX1-208ENST00000553786 SOCS7O14512 581 aa26.96■■□□□ 1.91
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.95■■□□□ 1.91
PRRX1-208ENST00000553786 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.93■■□□□ 1.9
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