RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548284.1

RARG-208, Transcript of retinoic acid receptor gamma, human

TSL 1 (best)

Gene RARG, Length 556 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RARG-208	ENST00000548284	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.96	■■■■□ 3.03
RARG-208	ENST00000548284	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.96	■■■■□ 3.03
RARG-208	ENST00000548284	MLEC	Q14165	292 aa		33.94	■■■■□ 3.02
RARG-208	ENST00000548284	HECW1	Q76N89	1606 aa		33.93	■■■■□ 3.02
RARG-208	ENST00000548284	HSPA2	P54652	639 aa		33.91	■■■■□ 3.02
RARG-208	ENST00000548284	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.91	■■■■□ 3.02
RARG-208	ENST00000548284	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		33.86	■■■■□ 3.01
RARG-208	ENST00000548284	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.82	■■■■□ 3
RARG-208	ENST00000548284	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.82	■■■■□ 3
RARG-208	ENST00000548284	ATP10A	O60312	1499 aa		33.81	■■■■□ 3
RARG-208	ENST00000548284	CLIP1	P30622	1438 aa		33.79	■■■■□ 3
RARG-208	ENST00000548284	KIF14	Q15058	1648 aa		33.79	■■■■□ 3
RARG-208	ENST00000548284	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.78	■■■■□ 3
RARG-208	ENST00000548284	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.78	■■■■□ 3
RARG-208	ENST00000548284	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.77	■■■■□ 3
RARG-208	ENST00000548284	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
RARG-208	ENST00000548284	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.75	■■■□□ 2.99
RARG-208	ENST00000548284	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.75	■■■□□ 2.99
RARG-208	ENST00000548284	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RARG-208	ENST00000548284	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RARG-208	ENST00000548284	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.69	■■■□□ 2.98
RARG-208	ENST00000548284	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.68	■■■□□ 2.98
RARG-208	ENST00000548284	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
RARG-208	ENST00000548284	KDM5C	P41229	1560 aa		33.6	■■■□□ 2.97
RARG-208	ENST00000548284	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.56	■■■□□ 2.96
RARG-208	ENST00000548284	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.56	■■■□□ 2.96
RARG-208	ENST00000548284	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.55	■■■□□ 2.96
RARG-208	ENST00000548284	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.53	■■■□□ 2.96
RARG-208	ENST00000548284	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
RARG-208	ENST00000548284	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RARG-208	ENST00000548284	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RARG-208	ENST00000548284	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RARG-208	ENST00000548284	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RARG-208	ENST00000548284	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RARG-208	ENST00000548284	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.48	■■■□□ 2.95
RARG-208	ENST00000548284	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RARG-208	ENST00000548284	ABCC1	P33527	1531 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RARG-208	ENST00000548284	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.46	■■■□□ 2.95
RARG-208	ENST00000548284	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.45	■■■□□ 2.95
RARG-208	ENST00000548284	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.43	■■■□□ 2.94
RARG-208	ENST00000548284	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
RARG-208	ENST00000548284	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.39	■■■□□ 2.94
RARG-208	ENST00000548284	AGL	P35573	1532 aa		33.39	■■■□□ 2.94
RARG-208	ENST00000548284	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.38	■■■□□ 2.93
RARG-208	ENST00000548284	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.38	■■■□□ 2.93
RARG-208	ENST00000548284	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RARG-208	ENST00000548284	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
RARG-208	ENST00000548284	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.33	■■■□□ 2.93
RARG-208	ENST00000548284	C3	P01024	1663 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RARG-208	ENST00000548284	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.31	■■■□□ 2.92
RARG-208	ENST00000548284	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.3	■■■□□ 2.92
RARG-208	ENST00000548284	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
RARG-208	ENST00000548284	SOCS7	O14512	581 aa		33.27	■■■□□ 2.92
RARG-208	ENST00000548284	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.26	■■■□□ 2.91
RARG-208	ENST00000548284	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RARG-208	ENST00000548284	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.25	■■■□□ 2.91	5e-7	■■□□□ 13.3
RARG-208	ENST00000548284	PTPRT	O14522	1441 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RARG-208	ENST00000548284	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
RARG-208	ENST00000548284	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
RARG-208	ENST00000548284	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RARG-208	ENST00000548284	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RARG-208	ENST00000548284	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.17	■■■□□ 2.9
RARG-208	ENST00000548284	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RARG-208	ENST00000548284	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RARG-208	ENST00000548284	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.14	■■■□□ 2.9
RARG-208	ENST00000548284	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RARG-208	ENST00000548284	NPAT	Q14207	1427 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RARG-208	ENST00000548284	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
RARG-208	ENST00000548284	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RARG-208	ENST00000548284	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RARG-208	ENST00000548284	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RARG-208	ENST00000548284	A2M	P01023	1474 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RARG-208	ENST00000548284	GGT6	Q6P531	493 aa		33.08	■■■□□ 2.89
RARG-208	ENST00000548284	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.06	■■■□□ 2.88
RARG-208	ENST00000548284	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
RARG-208	ENST00000548284	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.05	■■■□□ 2.88
RARG-208	ENST00000548284	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
RARG-208	ENST00000548284	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RARG-208	ENST00000548284	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RARG-208	ENST00000548284	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
RARG-208	ENST00000548284	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.96	■■■□□ 2.87
RARG-208	ENST00000548284	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.96	■■■□□ 2.87
RARG-208	ENST00000548284	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.95	■■■□□ 2.86
RARG-208	ENST00000548284	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RARG-208	ENST00000548284	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RARG-208	ENST00000548284	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RARG-208	ENST00000548284	PKD2	Q13563	968 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RARG-208	ENST00000548284	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
RARG-208	ENST00000548284	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.88	■■■□□ 2.85
RARG-208	ENST00000548284	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.88	■■■□□ 2.85
RARG-208	ENST00000548284	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.88	■■■□□ 2.85
RARG-208	ENST00000548284	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.88	■■■□□ 2.85
RARG-208	ENST00000548284	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
RARG-208	ENST00000548284	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
RARG-208	ENST00000548284	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
RARG-208	ENST00000548284	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RARG-208	ENST00000548284	KIF3B	O15066	747 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RARG-208	ENST00000548284	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
RARG-208	ENST00000548284	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.79	■■■□□ 2.84
RARG-208	ENST00000548284	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.78	■■■□□ 2.84

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