RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545450.6

MSLN-202, Transcript of mesothelin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSLN, Length 2,162 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLN-202ENST00000545450 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.97■■□□□ 1.91
MSLN-202ENST00000545450 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
MSLN-202ENST00000545450 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
MSLN-202ENST00000545450 NAIPQ13075 1403 aa26.93■■□□□ 1.9
MSLN-202ENST00000545450 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.93■■□□□ 1.9
MSLN-202ENST00000545450 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.91■■□□□ 1.9
MSLN-202ENST00000545450 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
MSLN-202ENST00000545450 OSCARQ8IYS5 282 aa26.9■■□□□ 1.9
MSLN-202ENST00000545450 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.9■■□□□ 1.9
MSLN-202ENST00000545450 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
MSLN-202ENST00000545450 MAPKBP1O60336 1514 aa26.89■■□□□ 1.9
MSLN-202ENST00000545450 DAPK1P53355 1430 aa26.89■■□□□ 1.9
MSLN-202ENST00000545450 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.88■■□□□ 1.89
MSLN-202ENST00000545450 ABCC5O15440 1437 aa26.86■■□□□ 1.89
MSLN-202ENST00000545450 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.86■■□□□ 1.89
MSLN-202ENST00000545450 AKNAQ7Z591 1439 aa26.85■■□□□ 1.89
MSLN-202ENST00000545450 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.82■■□□□ 1.88
MSLN-202ENST00000545450 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.82■■□□□ 1.88
MSLN-202ENST00000545450 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.81■■□□□ 1.88
MSLN-202ENST00000545450 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
MSLN-202ENST00000545450 PREX2Q70Z35 1606 aa26.81■■□□□ 1.88
MSLN-202ENST00000545450 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.8■■□□□ 1.88
MSLN-202ENST00000545450 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.8■■□□□ 1.88
MSLN-202ENST00000545450 KDM6BO15054 1643 aa26.79■■□□□ 1.88
MSLN-202ENST00000545450 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
MSLN-202ENST00000545450 ROCK1Q13464 1354 aa26.76■■□□□ 1.87
MSLN-202ENST00000545450 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.75■■□□□ 1.87
MSLN-202ENST00000545450 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.72■■□□□ 1.87
MSLN-202ENST00000545450 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.71■■□□□ 1.87
MSLN-202ENST00000545450 KCNH8Q96L42 1107 aa26.7■■□□□ 1.87
MSLN-202ENST00000545450 ADGRL2O95490 1459 aa26.66■■□□□ 1.86
MSLN-202ENST00000545450 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.65■■□□□ 1.86
MSLN-202ENST00000545450 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.65■■□□□ 1.86
MSLN-202ENST00000545450 NCOA1Q15788 1441 aa26.64■■□□□ 1.86
MSLN-202ENST00000545450 MBD5Q9P267 1494 aa26.63■■□□□ 1.85
MSLN-202ENST00000545450 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.63■■□□□ 1.85
MSLN-202ENST00000545450 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.6■■□□□ 1.85
MSLN-202ENST00000545450 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.6■■□□□ 1.85
MSLN-202ENST00000545450 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
MSLN-202ENST00000545450 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.59■■□□□ 1.85
MSLN-202ENST00000545450 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.58■■□□□ 1.85
MSLN-202ENST00000545450 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
MSLN-202ENST00000545450 PLCH2O75038 1416 aa26.57■■□□□ 1.84
MSLN-202ENST00000545450 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.56■■□□□ 1.84
MSLN-202ENST00000545450 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.56■■□□□ 1.84
MSLN-202ENST00000545450 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.56■■□□□ 1.84
MSLN-202ENST00000545450 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.56■■□□□ 1.84
MSLN-202ENST00000545450 TRIM52Q96A61 297 aa26.55■■□□□ 1.84
MSLN-202ENST00000545450 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
MSLN-202ENST00000545450 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
MSLN-202ENST00000545450 ASXL2Q76L83 1435 aa26.52■■□□□ 1.84
MSLN-202ENST00000545450 TSPY4P0CV99 314 aa26.5■■□□□ 1.83
MSLN-202ENST00000545450 TSPY10P0CW01 314 aa26.5■■□□□ 1.83
MSLN-202ENST00000545450 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.5■■□□□ 1.83
MSLN-202ENST00000545450 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.49■■□□□ 1.83
MSLN-202ENST00000545450 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.48■■□□□ 1.83
MSLN-202ENST00000545450 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.48■■□□□ 1.83
MSLN-202ENST00000545450 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.47■■□□□ 1.83
MSLN-202ENST00000545450 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.47■■□□□ 1.83
MSLN-202ENST00000545450 FKBP8Q14318 412 aa26.46■■□□□ 1.83
MSLN-202ENST00000545450 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.46■■□□□ 1.83
MSLN-202ENST00000545450 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.46■■□□□ 1.83
MSLN-202ENST00000545450 ABCC1P33527 1531 aa26.46■■□□□ 1.83
MSLN-202ENST00000545450 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.46■■□□□ 1.83
MSLN-202ENST00000545450 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.44■■□□□ 1.82
MSLN-202ENST00000545450 KIF15Q9NS87 1388 aa26.43■■□□□ 1.82
MSLN-202ENST00000545450 CCER2I3L3R5 266 aa26.43■■□□□ 1.82
MSLN-202ENST00000545450 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
MSLN-202ENST00000545450 BCANQ96GW7 911 aa26.41■■□□□ 1.82
MSLN-202ENST00000545450 PZPP20742 1482 aa26.41■■□□□ 1.82
MSLN-202ENST00000545450 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.39■■□□□ 1.81
MSLN-202ENST00000545450 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.39■■□□□ 1.81
MSLN-202ENST00000545450 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.39■■□□□ 1.81
MSLN-202ENST00000545450 FOXD1Q16676 465 aa26.37■■□□□ 1.81
MSLN-202ENST00000545450 PLXNC1O60486 1568 aa26.37■■□□□ 1.81
MSLN-202ENST00000545450 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.35■■□□□ 1.81
MSLN-202ENST00000545450 FANCAO15360 1455 aa26.34■■□□□ 1.81
MSLN-202ENST00000545450 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
MSLN-202ENST00000545450 TONSLQ96HA7 1378 aa26.33■■□□□ 1.81
MSLN-202ENST00000545450 ANP32CO43423 234 aa26.31■■□□□ 1.8
MSLN-202ENST00000545450 NEFLP07196 543 aa26.31■■□□□ 1.8
MSLN-202ENST00000545450 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.3■■□□□ 1.8
MSLN-202ENST00000545450 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.3■■□□□ 1.8
MSLN-202ENST00000545450 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.27■■□□□ 1.8
MSLN-202ENST00000545450 NUP155O75694 1391 aa26.25■■□□□ 1.79
MSLN-202ENST00000545450 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
MSLN-202ENST00000545450 ADGRL1O94910 1474 aa26.24■■□□□ 1.79
MSLN-202ENST00000545450 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.24■■□□□ 1.79
MSLN-202ENST00000545450 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.24■■□□□ 1.79
MSLN-202ENST00000545450 AFAP1Q8N556 730 aa26.23■■□□□ 1.79
MSLN-202ENST00000545450 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
MSLN-202ENST00000545450 UNC13BO14795 1591 aa26.22■■□□□ 1.79
MSLN-202ENST00000545450 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
MSLN-202ENST00000545450 CD109Q6YHK3 1445 aa26.2■■□□□ 1.79
MSLN-202ENST00000545450 PKD2Q13563 968 aa26.2■■□□□ 1.78
MSLN-202ENST00000545450 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.19■■□□□ 1.78
MSLN-202ENST00000545450 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
MSLN-202ENST00000545450 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.19■■□□□ 1.78
MSLN-202ENST00000545450 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
MSLN-202ENST00000545450 ERBINQ96RT1 1412 aa26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms