RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SUDS3-204ENST00000543473 FOXD1Q16676 465 aa24.92■■□□□ 1.58
SUDS3-204ENST00000543473 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.92■■□□□ 1.58
SUDS3-204ENST00000543473 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.9■■□□□ 1.58
SUDS3-204ENST00000543473 PKD2Q13563 968 aa24.89■■□□□ 1.58
SUDS3-204ENST00000543473 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.88■■□□□ 1.57
SUDS3-204ENST00000543473 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SUDS3-204ENST00000543473 USP35Q9P2H5 1018 aa24.85■■□□□ 1.57
SUDS3-204ENST00000543473 HSCBQ8IWL3 235 aa24.84■■□□□ 1.57
SUDS3-204ENST00000543473 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.84■■□□□ 1.57
SUDS3-204ENST00000543473 KANK1Q14678 1352 aa24.84■■□□□ 1.57
SUDS3-204ENST00000543473 TMF1P82094 1093 aa24.84■■□□□ 1.57
SUDS3-204ENST00000543473 GGT6Q6P531 493 aa24.84■■□□□ 1.57
SUDS3-204ENST00000543473 MLECQ14165 292 aa24.83■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.83■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 CFTRP13569 1480 aa24.81■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 RALBP1Q15311 655 aa24.81■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.8■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 MS4A1P11836 297 aa24.8■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 CASC1Q6TDU7 716 aa24.8■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.79■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.79■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 NUP155O75694 1391 aa24.78■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 C14orf37Q86TY3 774 aa24.77■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 PLEKHG5O94827 1062 aa24.77■■□□□ 1.56
SUDS3-204ENST00000543473 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.75■■□□□ 1.55
SUDS3-204ENST00000543473 NESP48681 1621 aa24.75■■□□□ 1.55
SUDS3-204ENST00000543473 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SUDS3-204ENST00000543473 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SUDS3-204ENST00000543473 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.552e-7■■■■■ 28.9
SUDS3-204ENST00000543473 POGKQ9P215 609 aa24.74■■□□□ 1.55
SUDS3-204ENST00000543473 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SUDS3-204ENST00000543473 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.73■■□□□ 1.55
SUDS3-204ENST00000543473 PDE4AP27815 886 aa24.73■■□□□ 1.55
SUDS3-204ENST00000543473 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.73■■□□□ 1.55
SUDS3-204ENST00000543473 PTPRGP23470 1445 aa24.72■■□□□ 1.55
SUDS3-204ENST00000543473 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.72■■□□□ 1.55
SUDS3-204ENST00000543473 PDE3BQ13370 1112 aa24.7■■□□□ 1.55
SUDS3-204ENST00000543473 PLCB2Q00722 1185 aa24.69■■□□□ 1.54
SUDS3-204ENST00000543473 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SUDS3-204ENST00000543473 SYNJ1O43426 1573 aa24.68■■□□□ 1.54
SUDS3-204ENST00000543473 GSE1Q14687 1217 aa24.68■■□□□ 1.54
SUDS3-204ENST00000543473 HMGXB3Q12766 1538 aa24.67■■□□□ 1.54
SUDS3-204ENST00000543473 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.67■■□□□ 1.54
SUDS3-204ENST00000543473 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.66■■□□□ 1.54
SUDS3-204ENST00000543473 KIF3BO15066 747 aa24.66■■□□□ 1.54
SUDS3-204ENST00000543473 NLRP13Q86W25 1043 aa24.66■■□□□ 1.54
SUDS3-204ENST00000543473 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.65■■□□□ 1.54
SUDS3-204ENST00000543473 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.65■■□□□ 1.54
SUDS3-204ENST00000543473 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
SUDS3-204ENST00000543473 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SUDS3-204ENST00000543473 GBP4Q96PP9 640 aa24.62■■□□□ 1.53
SUDS3-204ENST00000543473 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.61■■□□□ 1.53
SUDS3-204ENST00000543473 SLC4A3P48751 1232 aa24.61■■□□□ 1.53
SUDS3-204ENST00000543473 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.58■■□□□ 1.53
SUDS3-204ENST00000543473 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SUDS3-204ENST00000543473 GOLGA2Q08379 1002 aa24.57■■□□□ 1.52
SUDS3-204ENST00000543473 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SUDS3-204ENST00000543473 OSCARQ8IYS5 282 aa24.57■■□□□ 1.52
SUDS3-204ENST00000543473 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SUDS3-204ENST00000543473 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
SUDS3-204ENST00000543473 KIF21BO75037 1637 aa24.55■■□□□ 1.52
SUDS3-204ENST00000543473 MORC1Q86VD1 984 aa24.53■■□□□ 1.52
SUDS3-204ENST00000543473 PTMSP20962 102 aa24.53■■□□□ 1.52
SUDS3-204ENST00000543473 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SUDS3-204ENST00000543473 FAM161AQ3B820 660 aa24.53■■□□□ 1.52
SUDS3-204ENST00000543473 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.52■■□□□ 1.52
SUDS3-204ENST00000543473 GRIN2BQ13224 1484 aa24.52■■□□□ 1.52
SUDS3-204ENST00000543473 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.51■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 PLIN1O60240 522 aa24.51■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 CUX1P39880 1505 aa24.51■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 TOPBP1Q92547 1522 aa24.5■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 STK26Q9P289 416 aa24.49■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 KIF15Q9NS87 1388 aa24.49■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 TOP2BQ02880 1626 aa24.47■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.46■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.45■■□□□ 1.51
SUDS3-204ENST00000543473 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.44■■□□□ 1.5
SUDS3-204ENST00000543473 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.44■■□□□ 1.5
SUDS3-204ENST00000543473 CFAP44Q96MT7 982 aa24.44■■□□□ 1.5
SUDS3-204ENST00000543473 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.44■■□□□ 1.5
SUDS3-204ENST00000543473 CRBNQ96SW2 442 aa24.44■■□□□ 1.5
SUDS3-204ENST00000543473 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SUDS3-204ENST00000543473 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SUDS3-204ENST00000543473 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.42■■□□□ 1.5
SUDS3-204ENST00000543473 ARAP1Q96P48 1450 aa24.42■■□□□ 1.5
SUDS3-204ENST00000543473 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.42■■□□□ 1.5
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