RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543447.5

ATE1-209, Transcript of arginyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 4,826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1-209ENST00000543447 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.22■□□□□ 0.99
ATE1-209ENST00000543447 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.21■□□□□ 0.99
ATE1-209ENST00000543447 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
ATE1-209ENST00000543447 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
ATE1-209ENST00000543447 CUL7Q14999 1698 aa21.19■□□□□ 0.98
ATE1-209ENST00000543447 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
ATE1-209ENST00000543447 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
ATE1-209ENST00000543447 NAIPQ13075 1403 aa21.19■□□□□ 0.98
ATE1-209ENST00000543447 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.18■□□□□ 0.98
ATE1-209ENST00000543447 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.18■□□□□ 0.98
ATE1-209ENST00000543447 PRDM2Q13029 1718 aa21.16■□□□□ 0.98
ATE1-209ENST00000543447 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.16■□□□□ 0.98
ATE1-209ENST00000543447 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
ATE1-209ENST00000543447 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.14■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 MAPKBP1O60336 1514 aa21.11■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 MIA2Q96PC5 1412 aa21.11■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 TMF1P82094 1093 aa21.11■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 CCDC7Q96M83 1385 aa21.1■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.1■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 CDCA8Q53HL2 280 aa21.09■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 USP47Q96K76 1375 aa21.09■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 PTPRGP23470 1445 aa21.08■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 HECW1Q76N89 1606 aa21.08■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.08■□□□□ 0.97
ATE1-209ENST00000543447 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.07■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.07■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 NBR1Q14596 966 aa21.07■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 IFT140Q96RY7 1462 aa21.06■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.06■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.05■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.04■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 IQGAP2Q13576 1575 aa21.03■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 RALBP1Q15311 655 aa21.03■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.02■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.02■□□□□ 0.96
ATE1-209ENST00000543447 PTPRKQ15262 1439 aa21.02■□□□□ 0.95
ATE1-209ENST00000543447 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.01■□□□□ 0.95
ATE1-209ENST00000543447 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.01■□□□□ 0.95
ATE1-209ENST00000543447 NUDCQ9Y266 331 aa21■□□□□ 0.95
ATE1-209ENST00000543447 DAPK1P53355 1430 aa21■□□□□ 0.95
ATE1-209ENST00000543447 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.99■□□□□ 0.95
ATE1-209ENST00000543447 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.98■□□□□ 0.95
ATE1-209ENST00000543447 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.98■□□□□ 0.95
ATE1-209ENST00000543447 NEFMP07197 916 aa20.98■□□□□ 0.95
ATE1-209ENST00000543447 KIF15Q9NS87 1388 aa20.97■□□□□ 0.95
ATE1-209ENST00000543447 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
ATE1-209ENST00000543447 KANK1Q14678 1352 aa20.94■□□□□ 0.94
ATE1-209ENST00000543447 NLRP13Q86W25 1043 aa20.93■□□□□ 0.94
ATE1-209ENST00000543447 CCDC184Q52MB2 194 aa20.92■□□□□ 0.94
ATE1-209ENST00000543447 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.91■□□□□ 0.94
ATE1-209ENST00000543447 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
ATE1-209ENST00000543447 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
ATE1-209ENST00000543447 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.9■□□□□ 0.94
ATE1-209ENST00000543447 ROCK1Q13464 1354 aa20.9■□□□□ 0.94
ATE1-209ENST00000543447 BCL11AQ9H165 835 aa20.89■□□□□ 0.94
ATE1-209ENST00000543447 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
ATE1-209ENST00000543447 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 ABCC5O15440 1437 aa20.88■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 KIF3BO15066 747 aa20.88■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 NEUROD2Q15784 382 aa20.88■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.88■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.87■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.87■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 PANK3Q9H999 370 aa20.85■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.85■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.84■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 GGT6Q6P531 493 aa20.84■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.83■□□□□ 0.93
ATE1-209ENST00000543447 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ATE1-209ENST00000543447 GRIN2AQ12879 1464 aa20.82■□□□□ 0.92
ATE1-209ENST00000543447 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ATE1-209ENST00000543447 SYNJ2O15056 1496 aa20.81■□□□□ 0.92
ATE1-209ENST00000543447 SLC24A1O60721 1099 aa20.8■□□□□ 0.92
ATE1-209ENST00000543447 CFAP53Q96M91 514 aa20.8■□□□□ 0.92
ATE1-209ENST00000543447 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.78■□□□□ 0.92
ATE1-209ENST00000543447 AKNAQ7Z591 1439 aa20.77■□□□□ 0.92
ATE1-209ENST00000543447 PDE3BQ13370 1112 aa20.76■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 RGS3P49796 1198 aa20.75■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 NCOA1Q15788 1441 aa20.74■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.74■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 MORC1Q86VD1 984 aa20.73■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 ARHGEF11O15085 1522 aa20.71■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.71■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.7■□□□□ 0.9
ATE1-209ENST00000543447 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms