RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542167.2

PUS1-208, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PUS1, Length 2,151 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-208ENST00000542167 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
PUS1-208ENST00000542167 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-208ENST00000542167 ARHGEF11O15085 1522 aa23.04■■□□□ 1.28
PUS1-208ENST00000542167 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.03■■□□□ 1.28
PUS1-208ENST00000542167 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PUS1-208ENST00000542167 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PUS1-208ENST00000542167 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.02■■□□□ 1.28
PUS1-208ENST00000542167 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PUS1-208ENST00000542167 PLB1Q6P1J6 1458 aa23■■□□□ 1.27
PUS1-208ENST00000542167 ARID3CA6NKF2 412 aa22.99■■□□□ 1.27
PUS1-208ENST00000542167 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PUS1-208ENST00000542167 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PUS1-208ENST00000542167 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.97■■□□□ 1.27
PUS1-208ENST00000542167 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PUS1-208ENST00000542167 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.97■■□□□ 1.27
PUS1-208ENST00000542167 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.96■■□□□ 1.27
PUS1-208ENST00000542167 AKNAQ7Z591 1439 aa22.96■■□□□ 1.27
PUS1-208ENST00000542167 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.95■■□□□ 1.26
PUS1-208ENST00000542167 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PUS1-208ENST00000542167 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PUS1-208ENST00000542167 KDM6BO15054 1643 aa22.94■■□□□ 1.26
PUS1-208ENST00000542167 PTPRGP23470 1445 aa22.93■■□□□ 1.26
PUS1-208ENST00000542167 ABCA8O94911 1581 aa22.93■■□□□ 1.26
PUS1-208ENST00000542167 NCOA1Q15788 1441 aa22.88■■□□□ 1.25
PUS1-208ENST00000542167 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PUS1-208ENST00000542167 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
PUS1-208ENST00000542167 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.86■■□□□ 1.25
PUS1-208ENST00000542167 CCDC184Q52MB2 194 aa22.85■■□□□ 1.25
PUS1-208ENST00000542167 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.84■■□□□ 1.25
PUS1-208ENST00000542167 CCDC7Q96M83 1385 aa22.84■■□□□ 1.25
PUS1-208ENST00000542167 OSCARQ8IYS5 282 aa22.83■■□□□ 1.25
PUS1-208ENST00000542167 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PUS1-208ENST00000542167 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.79■■□□□ 1.24
PUS1-208ENST00000542167 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PUS1-208ENST00000542167 ATP10BO94823 1461 aa22.78■■□□□ 1.24
PUS1-208ENST00000542167 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.78■■□□□ 1.24
PUS1-208ENST00000542167 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.77■■□□□ 1.24
PUS1-208ENST00000542167 MIA2Q96PC5 1412 aa22.77■■□□□ 1.24
PUS1-208ENST00000542167 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.76■■□□□ 1.23
PUS1-208ENST00000542167 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.76■■□□□ 1.23
PUS1-208ENST00000542167 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.76■■□□□ 1.23
PUS1-208ENST00000542167 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PUS1-208ENST00000542167 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PUS1-208ENST00000542167 ABCC2Q92887 1545 aa22.73■■□□□ 1.23
PUS1-208ENST00000542167 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.72■■□□□ 1.23
PUS1-208ENST00000542167 MRS2Q9HD23 443 aa22.72■■□□□ 1.23
PUS1-208ENST00000542167 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.71■■□□□ 1.23
PUS1-208ENST00000542167 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.7■■□□□ 1.23
PUS1-208ENST00000542167 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.69■■□□□ 1.22
PUS1-208ENST00000542167 KIF14Q15058 1648 aa22.68■■□□□ 1.22
PUS1-208ENST00000542167 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.68■■□□□ 1.22
PUS1-208ENST00000542167 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.68■■□□□ 1.22
PUS1-208ENST00000542167 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PUS1-208ENST00000542167 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.67■■□□□ 1.22
PUS1-208ENST00000542167 ROCK1Q13464 1354 aa22.67■■□□□ 1.22
PUS1-208ENST00000542167 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.67■■□□□ 1.22
PUS1-208ENST00000542167 FOXD1Q16676 465 aa22.66■■□□□ 1.22
PUS1-208ENST00000542167 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-208ENST00000542167 DAPK1P53355 1430 aa22.64■■□□□ 1.22
PUS1-208ENST00000542167 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.63■■□□□ 1.21
PUS1-208ENST00000542167 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PUS1-208ENST00000542167 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PUS1-208ENST00000542167 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.59■■□□□ 1.21
PUS1-208ENST00000542167 ABCC5O15440 1437 aa22.58■■□□□ 1.21
PUS1-208ENST00000542167 MBD5Q9P267 1494 aa22.58■■□□□ 1.21
PUS1-208ENST00000542167 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PUS1-208ENST00000542167 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.56■■□□□ 1.2
PUS1-208ENST00000542167 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PUS1-208ENST00000542167 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.55■■□□□ 1.2
PUS1-208ENST00000542167 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.54■■□□□ 1.2
PUS1-208ENST00000542167 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.54■■□□□ 1.2
PUS1-208ENST00000542167 PZPP20742 1482 aa22.53■■□□□ 1.2
PUS1-208ENST00000542167 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PUS1-208ENST00000542167 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PUS1-208ENST00000542167 NUDCQ9Y266 331 aa22.5■■□□□ 1.19
PUS1-208ENST00000542167 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-208ENST00000542167 KDM5CP41229 1560 aa22.49■■□□□ 1.19
PUS1-208ENST00000542167 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PUS1-208ENST00000542167 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PUS1-208ENST00000542167 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.47■■□□□ 1.19
PUS1-208ENST00000542167 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PUS1-208ENST00000542167 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.46■■□□□ 1.19
PUS1-208ENST00000542167 USP47Q96K76 1375 aa22.45■■□□□ 1.18
PUS1-208ENST00000542167 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.185e-6■□□□□ 9.5
PUS1-208ENST00000542167 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PUS1-208ENST00000542167 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-208ENST00000542167 PREX2Q70Z35 1606 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-208ENST00000542167 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PUS1-208ENST00000542167 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-208ENST00000542167 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-208ENST00000542167 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PUS1-208ENST00000542167 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.39■■□□□ 1.18
PUS1-208ENST00000542167 ADGRL2O95490 1459 aa22.38■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.38■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.38■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.38■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.38■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.38■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.36■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.35■■□□□ 1.17
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