RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540737.5

C11orf80-218, Transcript of chromosome 11 open reading frame 80, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene C11orf80, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf80-218ENST00000540737 ABCC5O15440 1437 aa37.23■■■■□ 3.55
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C11orf80-218ENST00000540737 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.21■■■■□ 3.55
C11orf80-218ENST00000540737 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.21■■■■□ 3.55
C11orf80-218ENST00000540737 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
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C11orf80-218ENST00000540737 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.9■■■■□ 3.5
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C11orf80-218ENST00000540737 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.83■■■■□ 3.49
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C11orf80-218ENST00000540737 TSPY10P0CW01 314 aa36.78■■■■□ 3.48
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C11orf80-218ENST00000540737 KCNH8Q96L42 1107 aa36.73■■■■□ 3.47
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C11orf80-218ENST00000540737 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.69■■■■□ 3.46
C11orf80-218ENST00000540737 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.68■■■■□ 3.46
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C11orf80-218ENST00000540737 ASXL2Q76L83 1435 aa36.63■■■■□ 3.45
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C11orf80-218ENST00000540737 KIF15Q9NS87 1388 aa36.59■■■■□ 3.45
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C11orf80-218ENST00000540737 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.58■■■■□ 3.45
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C11orf80-218ENST00000540737 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.54■■■■□ 3.44
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C11orf80-218ENST00000540737 NEO1Q92859 1461 aa36.11■■■■□ 3.37
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C11orf80-218ENST00000540737 KDM5CP41229 1560 aa36.04■■■■□ 3.36
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C11orf80-218ENST00000540737 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.03■■■■□ 3.36
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C11orf80-218ENST00000540737 ATP10AO60312 1499 aa36.01■■■■□ 3.36
C11orf80-218ENST00000540737 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
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