RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.4■□□□□ 0.06
LMO3-216ENST00000537568 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
LMO3-216ENST00000537568 PKD2Q13563 968 aa15.38■□□□□ 0.05
LMO3-216ENST00000537568 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
LMO3-216ENST00000537568 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
LMO3-216ENST00000537568 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
LMO3-216ENST00000537568 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
LMO3-216ENST00000537568 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
LMO3-216ENST00000537568 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
LMO3-216ENST00000537568 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
LMO3-216ENST00000537568 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.33■□□□□ 0.05
LMO3-216ENST00000537568 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.3■□□□□ 0.04
LMO3-216ENST00000537568 EFCAB3Q8N7B9 438 aa15.3■□□□□ 0.04
LMO3-216ENST00000537568 RGL2O15211 777 aa15.26■□□□□ 0.03
LMO3-216ENST00000537568 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.25■□□□□ 0.03
LMO3-216ENST00000537568 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.25■□□□□ 0.03
LMO3-216ENST00000537568 PLCB2Q00722 1185 aa15.23■□□□□ 0.03
LMO3-216ENST00000537568 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
LMO3-216ENST00000537568 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.22■□□□□ 0.03
LMO3-216ENST00000537568 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
LMO3-216ENST00000537568 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
LMO3-216ENST00000537568 CHD1O14646 1710 aa15.19■□□□□ 0.02
LMO3-216ENST00000537568 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.17■□□□□ 0.02
LMO3-216ENST00000537568 STK24Q9Y6E0 443 aa15.17■□□□□ 0.02
LMO3-216ENST00000537568 IFT140Q96RY7 1462 aa15.16■□□□□ 0.02
LMO3-216ENST00000537568 STK25O00506 426 aa15.15■□□□□ 0.02
LMO3-216ENST00000537568 SOX12O15370 315 aa15.14■□□□□ 0.01
LMO3-216ENST00000537568 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
LMO3-216ENST00000537568 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
LMO3-216ENST00000537568 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
LMO3-216ENST00000537568 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.13■□□□□ 0.01
LMO3-216ENST00000537568 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.13■□□□□ 0.01
LMO3-216ENST00000537568 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.12■□□□□ 0.01
LMO3-216ENST00000537568 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
LMO3-216ENST00000537568 CFTRP13569 1480 aa15.11■□□□□ 0.01
LMO3-216ENST00000537568 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.1■□□□□ 0.01
LMO3-216ENST00000537568 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.09■□□□□ 0.01
LMO3-216ENST00000537568 G3V3G9 751 aa15.09■□□□□ 0.01
LMO3-216ENST00000537568 POTEMA6NI47 508 aa15.07■□□□□ 0
LMO3-216ENST00000537568 FBXO41Q8TF61 875 aa15.06■□□□□ 0
LMO3-216ENST00000537568 POTEGQ6S5H5 508 aa15.05■□□□□ -0
LMO3-216ENST00000537568 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.04■□□□□ -0
LMO3-216ENST00000537568 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
LMO3-216ENST00000537568 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.02■□□□□ -0
LMO3-216ENST00000537568 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.02■□□□□ -0
LMO3-216ENST00000537568 MFRPQ9BY79 579 aa15.02■□□□□ -0
LMO3-216ENST00000537568 NLRP6P59044 892 aa15.01□□□□□ -0.01
LMO3-216ENST00000537568 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15□□□□□ -0.01
LMO3-216ENST00000537568 MICALL2Q8IY33 904 aa15□□□□□ -0.01
LMO3-216ENST00000537568 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.99□□□□□ -0.01
LMO3-216ENST00000537568 SOCS7O14512 581 aa14.98□□□□□ -0.01
LMO3-216ENST00000537568 ILDR2Q71H61 639 aa14.98□□□□□ -0.01
LMO3-216ENST00000537568 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.98□□□□□ -0.01
LMO3-216ENST00000537568 ST18O60284 1047 aa14.97□□□□□ -0.01
LMO3-216ENST00000537568 SNPHO15079 494 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-216ENST00000537568 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO3-216ENST00000537568 TOPBP1Q92547 1522 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO3-216ENST00000537568 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO3-216ENST00000537568 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LMO3-216ENST00000537568 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-216ENST00000537568 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LMO3-216ENST00000537568 BCANQ96GW7 911 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-216ENST00000537568 SYNJ1O43426 1573 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-216ENST00000537568 WIZO95785 1651 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-216ENST00000537568 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-216ENST00000537568 SYNJ2O15056 1496 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-216ENST00000537568 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO3-216ENST00000537568 ADGRL1O94910 1474 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-216ENST00000537568 PPP1R37O75864 691 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-216ENST00000537568 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO3-216ENST00000537568 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-216ENST00000537568 MARVELD3Q96A59 401 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-216ENST00000537568 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO3-216ENST00000537568 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-216ENST00000537568 KDM6BO15054 1643 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-216ENST00000537568 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-216ENST00000537568 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-216ENST00000537568 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-216ENST00000537568 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-216ENST00000537568 DOK7Q18PE1 504 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-216ENST00000537568 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LMO3-216ENST00000537568 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-216ENST00000537568 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-216ENST00000537568 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-216ENST00000537568 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LMO3-216ENST00000537568 EMP3P54852 163 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-216ENST00000537568 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-216ENST00000537568 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LMO3-216ENST00000537568 ABCC8Q09428 1581 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-216ENST00000537568 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-216ENST00000537568 PRDM2Q13029 1718 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-216ENST00000537568 C2orf72A6NCS6 295 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-216ENST00000537568 KIF3CO14782 793 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-216ENST00000537568 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-216ENST00000537568 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LMO3-216ENST00000537568 DIP2BQ9P265 1576 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-216ENST00000537568 RIMBP2O15034 1052 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-216ENST00000537568 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-216ENST00000537568 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-216ENST00000537568 CFAP44Q96MT7 982 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms