RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534967.1

GOLGA3-204, Transcript of golgin A3, humanhuman

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 484 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3-204ENST00000534967 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
GOLGA3-204ENST00000534967 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
GOLGA3-204ENST00000534967 HSPA2P54652 639 aa43.85■■■■■ 4.61
GOLGA3-204ENST00000534967 MLECQ14165 292 aa43.85■■■■■ 4.61
GOLGA3-204ENST00000534967 FMN1Q68DA7 1419 aa43.82■■■■■ 4.6
GOLGA3-204ENST00000534967 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.77■■■■■ 4.6
GOLGA3-204ENST00000534967 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa43.75■■■■■ 4.59
GOLGA3-204ENST00000534967 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.75■■■■■ 4.59
GOLGA3-204ENST00000534967 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.74■■■■■ 4.59
GOLGA3-204ENST00000534967 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
GOLGA3-204ENST00000534967 ATP10AO60312 1499 aa43.7■■■■■ 4.59
GOLGA3-204ENST00000534967 KIF14Q15058 1648 aa43.7■■■■■ 4.59
GOLGA3-204ENST00000534967 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.67■■■■■ 4.58
GOLGA3-204ENST00000534967 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.64■■■■■ 4.58
GOLGA3-204ENST00000534967 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
GOLGA3-204ENST00000534967 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.59■■■■■ 4.57
GOLGA3-204ENST00000534967 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.58■■■■■ 4.57
GOLGA3-204ENST00000534967 CLIP1P30622 1438 aa43.56■■■■■ 4.56
GOLGA3-204ENST00000534967 AFAP1Q8N556 730 aa43.55■■■■■ 4.56
GOLGA3-204ENST00000534967 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.53■■■■■ 4.56
GOLGA3-204ENST00000534967 KDM5CP41229 1560 aa43.51■■■■■ 4.56
GOLGA3-204ENST00000534967 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
GOLGA3-204ENST00000534967 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.51■■■■■ 4.56
GOLGA3-204ENST00000534967 MYT1LQ9UL68 1186 aa43.47■■■■■ 4.55
GOLGA3-204ENST00000534967 PREX1Q8TCU6 1659 aa43.46■■■■■ 4.55
GOLGA3-204ENST00000534967 CERKQ8TCT0 537 aa43.44■■■■■ 4.54
GOLGA3-204ENST00000534967 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa43.42■■■■■ 4.54
GOLGA3-204ENST00000534967 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.42■■■■■ 4.54
GOLGA3-204ENST00000534967 ABCA6Q8N139 1617 aa43.35■■■■■ 4.53
GOLGA3-204ENST00000534967 REREQ9P2R6 1566 aa43.33■■■■■ 4.53
GOLGA3-204ENST00000534967 MLH3Q9UHC1 1453 aa43.33■■■■■ 4.53
GOLGA3-204ENST00000534967 PREX2Q70Z35 1606 aa43.33■■■■■ 4.53
GOLGA3-204ENST00000534967 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.31■■■■■ 4.52
GOLGA3-204ENST00000534967 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.31■■■■■ 4.52
GOLGA3-204ENST00000534967 ABCC1P33527 1531 aa43.3■■■■■ 4.52
GOLGA3-204ENST00000534967 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.3■■■■■ 4.52
GOLGA3-204ENST00000534967 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa43.28■■■■■ 4.52
GOLGA3-204ENST00000534967 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.25■■■■■ 4.51
GOLGA3-204ENST00000534967 STRCQ7RTU9 1775 aa43.24■■■■■ 4.51
GOLGA3-204ENST00000534967 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
GOLGA3-204ENST00000534967 AGLP35573 1532 aa43.21■■■■■ 4.51
GOLGA3-204ENST00000534967 C3P01024 1663 aa43.2■■■■■ 4.51
GOLGA3-204ENST00000534967 DMRT2Q9Y5R5 561 aa43.19■■■■■ 4.5
GOLGA3-204ENST00000534967 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.17■■■■■ 4.5
GOLGA3-204ENST00000534967 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
GOLGA3-204ENST00000534967 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa43.15■■■■■ 4.5
GOLGA3-204ENST00000534967 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.1■■■■■ 4.49
GOLGA3-204ENST00000534967 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
GOLGA3-204ENST00000534967 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.04■■■■■ 4.48
GOLGA3-204ENST00000534967 CNTLNQ9NXG0 1405 aa43.01■■■■■ 4.48
GOLGA3-204ENST00000534967 PTPRTO14522 1441 aa43■■■■■ 4.47
GOLGA3-204ENST00000534967 SYCP2Q9BX26 1530 aa43■■■■■ 4.47
GOLGA3-204ENST00000534967 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
GOLGA3-204ENST00000534967 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.95■■■■■ 4.473e-12■■■□□ 15.6
GOLGA3-204ENST00000534967 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
GOLGA3-204ENST00000534967 NCOA1Q15788 1441 aa42.88■■■■■ 4.46
GOLGA3-204ENST00000534967 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
GOLGA3-204ENST00000534967 MROH2AA6NES4 1674 aa42.87■■■■■ 4.45
GOLGA3-204ENST00000534967 ATP7AQ04656 1500 aa42.85■■■■■ 4.45
GOLGA3-204ENST00000534967 ZMYM3Q14202 1370 aa42.84■■■■■ 4.45
GOLGA3-204ENST00000534967 NPATQ14207 1427 aa42.84■■■■■ 4.45
GOLGA3-204ENST00000534967 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
GOLGA3-204ENST00000534967 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.82■■■■■ 4.45
GOLGA3-204ENST00000534967 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.81■■■■■ 4.44
GOLGA3-204ENST00000534967 LTBP4Q8N2S1 1624 aa42.81■■■■■ 4.44
GOLGA3-204ENST00000534967 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.81■■■■■ 4.44
GOLGA3-204ENST00000534967 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
GOLGA3-204ENST00000534967 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.79■■■■■ 4.44
GOLGA3-204ENST00000534967 A2MP01023 1474 aa42.77■■■■■ 4.44
GOLGA3-204ENST00000534967 PLXNC1O60486 1568 aa42.77■■■■■ 4.44
GOLGA3-204ENST00000534967 DISP3Q9P2K9 1392 aa42.76■■■■■ 4.44
GOLGA3-204ENST00000534967 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
GOLGA3-204ENST00000534967 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.74■■■■■ 4.43
GOLGA3-204ENST00000534967 GGT6Q6P531 493 aa42.69■■■■■ 4.42
GOLGA3-204ENST00000534967 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa42.68■■■■■ 4.42
GOLGA3-204ENST00000534967 IQSEC2Q5JU85 1478 aa42.65■■■■■ 4.42
GOLGA3-204ENST00000534967 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.64■■■■■ 4.42
GOLGA3-204ENST00000534967 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
GOLGA3-204ENST00000534967 PTPRKQ15262 1439 aa42.63■■■■■ 4.42
GOLGA3-204ENST00000534967 ILDR2Q71H61 639 aa42.63■■■■■ 4.41
GOLGA3-204ENST00000534967 TIAM1Q13009 1591 aa42.61■■■■■ 4.41
GOLGA3-204ENST00000534967 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
GOLGA3-204ENST00000534967 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.6■■■■■ 4.41
GOLGA3-204ENST00000534967 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.57■■■■■ 4.41
GOLGA3-204ENST00000534967 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
GOLGA3-204ENST00000534967 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.55■■■■■ 4.4
GOLGA3-204ENST00000534967 PLA2R1Q13018 1463 aa42.55■■■■■ 4.4
GOLGA3-204ENST00000534967 MBD5Q9P267 1494 aa42.55■■■■■ 4.4
GOLGA3-204ENST00000534967 PKD2Q13563 968 aa42.52■■■■■ 4.4
GOLGA3-204ENST00000534967 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.52■■■■■ 4.4
GOLGA3-204ENST00000534967 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.5■■■■■ 4.39
GOLGA3-204ENST00000534967 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
GOLGA3-204ENST00000534967 CEP162Q5TB80 1403 aa42.47■■■■■ 4.39
GOLGA3-204ENST00000534967 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.46■■■■■ 4.39
GOLGA3-204ENST00000534967 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
GOLGA3-204ENST00000534967 SOCS7O14512 581 aa42.4■■■■■ 4.38
GOLGA3-204ENST00000534967 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.39■■■■■ 4.38
GOLGA3-204ENST00000534967 UBAP1LF5GYI3 381 aa42.38■■■■■ 4.37
GOLGA3-204ENST00000534967 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
GOLGA3-204ENST00000534967 KIF3BO15066 747 aa42.34■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms