RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531958.5

CARNS1-207, Transcript of carnosine synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CARNS1, Length 2,369 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARNS1-207ENST00000531958 HFM1A2PYH4 1435 aa25.57■■□□□ 1.68
CARNS1-207ENST00000531958 DAPK1P53355 1430 aa25.56■■□□□ 1.68
CARNS1-207ENST00000531958 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
CARNS1-207ENST00000531958 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.55■■□□□ 1.68
CARNS1-207ENST00000531958 ABCC5O15440 1437 aa25.54■■□□□ 1.68
CARNS1-207ENST00000531958 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.54■■□□□ 1.68
CARNS1-207ENST00000531958 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CARNS1-207ENST00000531958 NAIPQ13075 1403 aa25.53■■□□□ 1.68
CARNS1-207ENST00000531958 PREX2Q70Z35 1606 aa25.49■■□□□ 1.67
CARNS1-207ENST00000531958 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.49■■□□□ 1.67
CARNS1-207ENST00000531958 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
CARNS1-207ENST00000531958 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.46■■□□□ 1.67
CARNS1-207ENST00000531958 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.45■■□□□ 1.67
CARNS1-207ENST00000531958 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.44■■□□□ 1.66
CARNS1-207ENST00000531958 AKNAQ7Z591 1439 aa25.44■■□□□ 1.66
CARNS1-207ENST00000531958 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.43■■□□□ 1.66
CARNS1-207ENST00000531958 ASXL2Q76L83 1435 aa25.43■■□□□ 1.66
CARNS1-207ENST00000531958 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
CARNS1-207ENST00000531958 ROCK1Q13464 1354 aa25.42■■□□□ 1.66
CARNS1-207ENST00000531958 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.42■■□□□ 1.66
CARNS1-207ENST00000531958 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CARNS1-207ENST00000531958 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.41■■□□□ 1.66
CARNS1-207ENST00000531958 NEUROD1Q13562 356 aa25.4■■□□□ 1.66
CARNS1-207ENST00000531958 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.39■■□□□ 1.66
CARNS1-207ENST00000531958 PLCH2O75038 1416 aa25.39■■□□□ 1.65
CARNS1-207ENST00000531958 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.38■■□□□ 1.65
CARNS1-207ENST00000531958 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.38■■□□□ 1.65
CARNS1-207ENST00000531958 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.38■■□□□ 1.65
CARNS1-207ENST00000531958 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.38■■□□□ 1.65
CARNS1-207ENST00000531958 MAPKBP1O60336 1514 aa25.36■■□□□ 1.65
CARNS1-207ENST00000531958 KDM6BO15054 1643 aa25.36■■□□□ 1.65
CARNS1-207ENST00000531958 MBD5Q9P267 1494 aa25.36■■□□□ 1.65
CARNS1-207ENST00000531958 NCOA1Q15788 1441 aa25.34■■□□□ 1.65
CARNS1-207ENST00000531958 TSPY4P0CV99 314 aa25.34■■□□□ 1.65
CARNS1-207ENST00000531958 TSPY10P0CW01 314 aa25.34■■□□□ 1.65
CARNS1-207ENST00000531958 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.32■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.32■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.32■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.32■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.32■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 ADGRL2O95490 1459 aa25.31■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.31■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.3■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 TRIM52Q96A61 297 aa25.3■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.3■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.29■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.29■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.27■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.27■■□□□ 1.64
CARNS1-207ENST00000531958 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CARNS1-207ENST00000531958 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.25■■□□□ 1.63
CARNS1-207ENST00000531958 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.24■■□□□ 1.63
CARNS1-207ENST00000531958 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.21■■□□□ 1.63
CARNS1-207ENST00000531958 ABCC1P33527 1531 aa25.21■■□□□ 1.63
CARNS1-207ENST00000531958 FANCAO15360 1455 aa25.2■■□□□ 1.63
CARNS1-207ENST00000531958 MIER1Q8N108 512 aa25.2■■□□□ 1.62
CARNS1-207ENST00000531958 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.19■■□□□ 1.62
CARNS1-207ENST00000531958 KIF15Q9NS87 1388 aa25.18■■□□□ 1.62
CARNS1-207ENST00000531958 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.16■■□□□ 1.62
CARNS1-207ENST00000531958 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.16■■□□□ 1.62
CARNS1-207ENST00000531958 MYT1Q01538 1121 aa25.15■■□□□ 1.62
CARNS1-207ENST00000531958 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
CARNS1-207ENST00000531958 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.14■■□□□ 1.61
CARNS1-207ENST00000531958 CD109Q6YHK3 1445 aa25.14■■□□□ 1.61
CARNS1-207ENST00000531958 AFAP1Q8N556 730 aa25.12■■□□□ 1.61
CARNS1-207ENST00000531958 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.11■■□□□ 1.61
CARNS1-207ENST00000531958 ADGRL1O94910 1474 aa25.1■■□□□ 1.61
CARNS1-207ENST00000531958 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CARNS1-207ENST00000531958 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CARNS1-207ENST00000531958 FOXD1Q16676 465 aa25.08■■□□□ 1.61
CARNS1-207ENST00000531958 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.08■■□□□ 1.61
CARNS1-207ENST00000531958 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CARNS1-207ENST00000531958 PLXNC1O60486 1568 aa25.05■■□□□ 1.6
CARNS1-207ENST00000531958 SLC24A1O60721 1099 aa25.05■■□□□ 1.6
CARNS1-207ENST00000531958 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CARNS1-207ENST00000531958 PZPP20742 1482 aa25.04■■□□□ 1.6
CARNS1-207ENST00000531958 NUP155O75694 1391 aa25.02■■□□□ 1.6
CARNS1-207ENST00000531958 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.99■■□□□ 1.59
CARNS1-207ENST00000531958 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.98■■□□□ 1.59
CARNS1-207ENST00000531958 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.98■■□□□ 1.59
CARNS1-207ENST00000531958 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.98■■□□□ 1.59
CARNS1-207ENST00000531958 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.98■■□□□ 1.59
CARNS1-207ENST00000531958 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.98■■□□□ 1.59
CARNS1-207ENST00000531958 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.97■■□□□ 1.59
CARNS1-207ENST00000531958 TONSLQ96HA7 1378 aa24.96■■□□□ 1.59
CARNS1-207ENST00000531958 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.95■■□□□ 1.58
CARNS1-207ENST00000531958 PKD2Q13563 968 aa24.95■■□□□ 1.58
CARNS1-207ENST00000531958 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.94■■□□□ 1.58
CARNS1-207ENST00000531958 GLI2P10070 1586 aa24.94■■□□□ 1.58
CARNS1-207ENST00000531958 ATP7AQ04656 1500 aa24.94■■□□□ 1.58
CARNS1-207ENST00000531958 ERBINQ96RT1 1412 aa24.92■■□□□ 1.58
CARNS1-207ENST00000531958 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.92■■□□□ 1.58
CARNS1-207ENST00000531958 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.92■■□□□ 1.58
CARNS1-207ENST00000531958 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CARNS1-207ENST00000531958 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
CARNS1-207ENST00000531958 DIP2BQ9P265 1576 aa24.92■■□□□ 1.58
CARNS1-207ENST00000531958 NEO1Q92859 1461 aa24.91■■□□□ 1.58
CARNS1-207ENST00000531958 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.89■■□□□ 1.58
CARNS1-207ENST00000531958 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CARNS1-207ENST00000531958 UNC13BO14795 1591 aa24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms