RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530405.5

PACSIN3-206, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-206ENST00000530405 PLCH2O75038 1416 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-206ENST00000530405 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-206ENST00000530405 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-206ENST00000530405 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-206ENST00000530405 ATP10AO60312 1499 aa27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-206ENST00000530405 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-206ENST00000530405 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-206ENST00000530405 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3-206ENST00000530405 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-206ENST00000530405 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.36■■□□□ 1.97
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.34■■□□□ 1.97
PACSIN3-206ENST00000530405 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
PACSIN3-206ENST00000530405 STRCQ7RTU9 1775 aa27.34■■□□□ 1.97
PACSIN3-206ENST00000530405 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
PACSIN3-206ENST00000530405 FMN1Q68DA7 1419 aa27.32■■□□□ 1.96
PACSIN3-206ENST00000530405 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PACSIN3-206ENST00000530405 KDM5CP41229 1560 aa27.31■■□□□ 1.96
PACSIN3-206ENST00000530405 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.3■■□□□ 1.96
PACSIN3-206ENST00000530405 KIF14Q15058 1648 aa27.28■■□□□ 1.96
PACSIN3-206ENST00000530405 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
PACSIN3-206ENST00000530405 AFAP1Q8N556 730 aa27.26■■□□□ 1.95
PACSIN3-206ENST00000530405 REREQ9P2R6 1566 aa27.26■■□□□ 1.95
PACSIN3-206ENST00000530405 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.26■■□□□ 1.95
PACSIN3-206ENST00000530405 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
PACSIN3-206ENST00000530405 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.24■■□□□ 1.95
PACSIN3-206ENST00000530405 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.24■■□□□ 1.95
PACSIN3-206ENST00000530405 PTPRTO14522 1441 aa27.21■■□□□ 1.95
PACSIN3-206ENST00000530405 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.2■■□□□ 1.95
PACSIN3-206ENST00000530405 CLIP1P30622 1438 aa27.2■■□□□ 1.94
PACSIN3-206ENST00000530405 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.19■■□□□ 1.94
PACSIN3-206ENST00000530405 ILDR2Q71H61 639 aa27.19■■□□□ 1.94
PACSIN3-206ENST00000530405 C3P01024 1663 aa27.19■■□□□ 1.94
PACSIN3-206ENST00000530405 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.18■■□□□ 1.94
PACSIN3-206ENST00000530405 ABCA6Q8N139 1617 aa27.17■■□□□ 1.94
PACSIN3-206ENST00000530405 AGLP35573 1532 aa27.16■■□□□ 1.94
PACSIN3-206ENST00000530405 SOCS7O14512 581 aa27.16■■□□□ 1.94
PACSIN3-206ENST00000530405 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
PACSIN3-206ENST00000530405 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.16■■□□□ 1.94
PACSIN3-206ENST00000530405 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.12■■□□□ 1.93
PACSIN3-206ENST00000530405 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.12■■□□□ 1.93
PACSIN3-206ENST00000530405 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PACSIN3-206ENST00000530405 ABCC1P33527 1531 aa27.1■■□□□ 1.93
PACSIN3-206ENST00000530405 PREX2Q70Z35 1606 aa27.09■■□□□ 1.93
PACSIN3-206ENST00000530405 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.09■■□□□ 1.93
PACSIN3-206ENST00000530405 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.08■■□□□ 1.93
PACSIN3-206ENST00000530405 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-206ENST00000530405 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-206ENST00000530405 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-206ENST00000530405 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-206ENST00000530405 NCOA1Q15788 1441 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-206ENST00000530405 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-206ENST00000530405 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27■■□□□ 1.91
PACSIN3-206ENST00000530405 NPATQ14207 1427 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-206ENST00000530405 MROH2AA6NES4 1674 aa26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-206ENST00000530405 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-206ENST00000530405 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-206ENST00000530405 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.95■■□□□ 1.91
PACSIN3-206ENST00000530405 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.93■■□□□ 1.9
PACSIN3-206ENST00000530405 ZMYM3Q14202 1370 aa26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3-206ENST00000530405 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-206ENST00000530405 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-206ENST00000530405 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-206ENST00000530405 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-206ENST00000530405 PLA2R1Q13018 1463 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-206ENST00000530405 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 PKD2Q13563 968 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 PLXNC1O60486 1568 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 ATP7AQ04656 1500 aa26.81■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 PTPRKQ15262 1439 aa26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 A2MP01023 1474 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-206ENST00000530405 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-206ENST00000530405 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-206ENST00000530405 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-206ENST00000530405 GGT6Q6P531 493 aa26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-206ENST00000530405 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.69■■□□□ 1.86
PACSIN3-206ENST00000530405 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.68■■□□□ 1.86
PACSIN3-206ENST00000530405 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.66■■□□□ 1.86
PACSIN3-206ENST00000530405 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
PACSIN3-206ENST00000530405 CPS1P31327 1500 aa26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-206ENST00000530405 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.58■■□□□ 1.84
PACSIN3-206ENST00000530405 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-206ENST00000530405 MBD5Q9P267 1494 aa26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-206ENST00000530405 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-206ENST00000530405 TOM1O60784 492 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-206ENST00000530405 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-206ENST00000530405 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.54■■□□□ 1.84
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