RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530238.5

BRMS1-207, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 5

Gene BRMS1, Length 1,817 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-207ENST00000530238 DIP2BQ9P265 1576 aa33.2■■■□□ 2.91
BRMS1-207ENST00000530238 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.19■■■□□ 2.9
BRMS1-207ENST00000530238 NCOA2Q15596 1464 aa33.18■■■□□ 2.9
BRMS1-207ENST00000530238 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.18■■■□□ 2.9
BRMS1-207ENST00000530238 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.15■■■□□ 2.9
BRMS1-207ENST00000530238 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.15■■■□□ 2.9
BRMS1-207ENST00000530238 KCNH8Q96L42 1107 aa33.12■■■□□ 2.89
BRMS1-207ENST00000530238 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.08■■■□□ 2.89
BRMS1-207ENST00000530238 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
BRMS1-207ENST00000530238 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.02■■■□□ 2.88
BRMS1-207ENST00000530238 AKNAQ7Z591 1439 aa33.01■■■□□ 2.88
BRMS1-207ENST00000530238 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.87
BRMS1-207ENST00000530238 NAIPQ13075 1403 aa33■■■□□ 2.87
BRMS1-207ENST00000530238 TSPOAP1O95153 1857 aa33■■■□□ 2.87
BRMS1-207ENST00000530238 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32.99■■■□□ 2.87
BRMS1-207ENST00000530238 PTPRKQ15262 1439 aa32.97■■■□□ 2.87
BRMS1-207ENST00000530238 GLI2P10070 1586 aa32.97■■■□□ 2.87
BRMS1-207ENST00000530238 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.97■■■□□ 2.87
BRMS1-207ENST00000530238 TONSLQ96HA7 1378 aa32.95■■■□□ 2.87
BRMS1-207ENST00000530238 MIA2Q96PC5 1412 aa32.93■■■□□ 2.86
BRMS1-207ENST00000530238 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
BRMS1-207ENST00000530238 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.9■■■□□ 2.86
BRMS1-207ENST00000530238 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
BRMS1-207ENST00000530238 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.85
BRMS1-207ENST00000530238 CD109Q6YHK3 1445 aa32.82■■■□□ 2.85
BRMS1-207ENST00000530238 KIF14Q15058 1648 aa32.81■■■□□ 2.84
BRMS1-207ENST00000530238 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.81■■■□□ 2.84
BRMS1-207ENST00000530238 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.79■■■□□ 2.84
BRMS1-207ENST00000530238 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.79■■■□□ 2.84
BRMS1-207ENST00000530238 CCER2I3L3R5 266 aa32.77■■■□□ 2.84
BRMS1-207ENST00000530238 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
BRMS1-207ENST00000530238 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.82
BRMS1-207ENST00000530238 ROCK1Q13464 1354 aa32.66■■■□□ 2.82
BRMS1-207ENST00000530238 ANP32CO43423 234 aa32.66■■■□□ 2.82
BRMS1-207ENST00000530238 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.64■■■□□ 2.82
BRMS1-207ENST00000530238 MYT1Q01538 1121 aa32.61■■■□□ 2.81
BRMS1-207ENST00000530238 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.61■■■□□ 2.81
BRMS1-207ENST00000530238 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
BRMS1-207ENST00000530238 KDM6BO15054 1643 aa32.58■■■□□ 2.81
BRMS1-207ENST00000530238 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.58■■■□□ 2.81
BRMS1-207ENST00000530238 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.55■■■□□ 2.8
BRMS1-207ENST00000530238 PLCH2O75038 1416 aa32.55■■■□□ 2.8
BRMS1-207ENST00000530238 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
BRMS1-207ENST00000530238 DAPK1P53355 1430 aa32.54■■■□□ 2.8
BRMS1-207ENST00000530238 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.54■■■□□ 2.8
BRMS1-207ENST00000530238 FANCAO15360 1455 aa32.53■■■□□ 2.8
BRMS1-207ENST00000530238 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
BRMS1-207ENST00000530238 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.49■■■□□ 2.79
BRMS1-207ENST00000530238 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.49■■■□□ 2.79
BRMS1-207ENST00000530238 NEO1Q92859 1461 aa32.47■■■□□ 2.79
BRMS1-207ENST00000530238 TRIM52Q96A61 297 aa32.47■■■□□ 2.79
BRMS1-207ENST00000530238 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.46■■■□□ 2.79
BRMS1-207ENST00000530238 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.45■■■□□ 2.79
BRMS1-207ENST00000530238 PREX2Q70Z35 1606 aa32.45■■■□□ 2.79
BRMS1-207ENST00000530238 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.44■■■□□ 2.78
BRMS1-207ENST00000530238 ABCC5O15440 1437 aa32.42■■■□□ 2.78
BRMS1-207ENST00000530238 RAPGEF3O95398 923 aa32.41■■■□□ 2.78
BRMS1-207ENST00000530238 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
BRMS1-207ENST00000530238 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.41■■■□□ 2.78
BRMS1-207ENST00000530238 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.4■■■□□ 2.78
BRMS1-207ENST00000530238 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.4■■■□□ 2.78
BRMS1-207ENST00000530238 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
BRMS1-207ENST00000530238 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.38■■■□□ 2.77
BRMS1-207ENST00000530238 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
BRMS1-207ENST00000530238 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.37■■■□□ 2.77
BRMS1-207ENST00000530238 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
BRMS1-207ENST00000530238 ADGRL1O94910 1474 aa32.36■■■□□ 2.77
BRMS1-207ENST00000530238 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
BRMS1-207ENST00000530238 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP32.34■■■□□ 2.77
BRMS1-207ENST00000530238 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.33■■■□□ 2.77
BRMS1-207ENST00000530238 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.32■■■□□ 2.76
BRMS1-207ENST00000530238 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.32■■■□□ 2.76
BRMS1-207ENST00000530238 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.31■■■□□ 2.76
BRMS1-207ENST00000530238 ADGRL2O95490 1459 aa32.3■■■□□ 2.76
BRMS1-207ENST00000530238 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.29■■■□□ 2.76
BRMS1-207ENST00000530238 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
BRMS1-207ENST00000530238 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.28■■■□□ 2.76
BRMS1-207ENST00000530238 NEFLP07196 543 aa32.28■■■□□ 2.76
BRMS1-207ENST00000530238 RICTORQ6R327 1708 aa32.27■■■□□ 2.76
BRMS1-207ENST00000530238 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
BRMS1-207ENST00000530238 ABCC1P33527 1531 aa32.24■■■□□ 2.75
BRMS1-207ENST00000530238 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.24■■■□□ 2.75
BRMS1-207ENST00000530238 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.22■■■□□ 2.75
BRMS1-207ENST00000530238 WASHC2AQ641Q2 1341 aa32.22■■■□□ 2.75
BRMS1-207ENST00000530238 AFAP1Q8N556 730 aa32.21■■■□□ 2.75
BRMS1-207ENST00000530238 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.21■■■□□ 2.75
BRMS1-207ENST00000530238 NCOA1Q15788 1441 aa32.21■■■□□ 2.75
BRMS1-207ENST00000530238 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.2■■■□□ 2.75
BRMS1-207ENST00000530238 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.2■■■□□ 2.75
BRMS1-207ENST00000530238 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.2■■■□□ 2.74
BRMS1-207ENST00000530238 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.16■■■□□ 2.74
BRMS1-207ENST00000530238 PZPP20742 1482 aa32.15■■■□□ 2.74
BRMS1-207ENST00000530238 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.15■■■□□ 2.74
BRMS1-207ENST00000530238 FKBP8Q14318 412 aa32.14■■■□□ 2.74
BRMS1-207ENST00000530238 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
BRMS1-207ENST00000530238 MBD5Q9P267 1494 aa32.13■■■□□ 2.73
BRMS1-207ENST00000530238 CCDC7Q96M83 1385 aa32.12■■■□□ 2.73
BRMS1-207ENST00000530238 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.12■■■□□ 2.73
BRMS1-207ENST00000530238 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.12■■■□□ 2.73
BRMS1-207ENST00000530238 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.1■■■□□ 2.73
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