RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528247.1

ARHGEF4-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF4, Length 662 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4-215ENST00000528247 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF4-215ENST00000528247 FMN1Q68DA7 1419 aa29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF4-215ENST00000528247 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF4-215ENST00000528247 HSPA2P54652 639 aa29.65■■■□□ 2.34
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ARHGEF4-215ENST00000528247 MLECQ14165 292 aa29.6■■■□□ 2.33
ARHGEF4-215ENST00000528247 CERKQ8TCT0 537 aa29.6■■■□□ 2.33
ARHGEF4-215ENST00000528247 KIF14Q15058 1648 aa29.6■■■□□ 2.33
ARHGEF4-215ENST00000528247 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.57■■■□□ 2.32
ARHGEF4-215ENST00000528247 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.57■■■□□ 2.32
ARHGEF4-215ENST00000528247 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
ARHGEF4-215ENST00000528247 ATP10AO60312 1499 aa29.55■■■□□ 2.32
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ARHGEF4-215ENST00000528247 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF4-215ENST00000528247 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.51■■■□□ 2.31
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ARHGEF4-215ENST00000528247 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.42■■■□□ 2.3
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ARHGEF4-215ENST00000528247 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.34■■■□□ 2.29
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ARHGEF4-215ENST00000528247 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.32■■■□□ 2.28
ARHGEF4-215ENST00000528247 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.31■■■□□ 2.28
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ARHGEF4-215ENST00000528247 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.31■■■□□ 2.28
ARHGEF4-215ENST00000528247 ABCC1P33527 1531 aa29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF4-215ENST00000528247 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF4-215ENST00000528247 STRCQ7RTU9 1775 aa29.27■■■□□ 2.28
ARHGEF4-215ENST00000528247 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.27■■■□□ 2.28
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ARHGEF4-215ENST00000528247 C3P01024 1663 aa29.21■■■□□ 2.27
ARHGEF4-215ENST00000528247 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.21■■■□□ 2.27
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ARHGEF4-215ENST00000528247 CEP162Q5TB80 1403 aa28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF4-215ENST00000528247 PLA2R1Q13018 1463 aa28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF4-215ENST00000528247 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF4-215ENST00000528247 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF4-215ENST00000528247 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF4-215ENST00000528247 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF4-215ENST00000528247 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
ARHGEF4-215ENST00000528247 NCOA2Q15596 1464 aa28.66■■■□□ 2.18
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ARHGEF4-215ENST00000528247 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.66■■■□□ 2.18
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