RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528247.1

ARHGEF4-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF4, Length 662 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4-215ENST00000528247 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.18■■■■■ 4.82
ARHGEF4-215ENST00000528247 ABCC9O60706 1549 aa40.85■■■■■ 4.13
ARHGEF4-215ENST00000528247 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.62■■■■■ 4.09
ARHGEF4-215ENST00000528247 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.81■■■■□ 3.8
ARHGEF4-215ENST00000528247 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.76■■■■□ 3.8
ARHGEF4-215ENST00000528247 NACADO15069 1562 aa38.44■■■■□ 3.74
ARHGEF4-215ENST00000528247 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.2■■■■□ 3.71
ARHGEF4-215ENST00000528247 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.01■■■■□ 3.68
ARHGEF4-215ENST00000528247 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.95■■■■□ 3.67
ARHGEF4-215ENST00000528247 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.84■■■■□ 3.65
ARHGEF4-215ENST00000528247 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.7■■■■□ 3.63
ARHGEF4-215ENST00000528247 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
ARHGEF4-215ENST00000528247 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF4-215ENST00000528247 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.08■■■■□ 3.53
ARHGEF4-215ENST00000528247 SCRIBQ14160 1630 aa37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF4-215ENST00000528247 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF4-215ENST00000528247 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF4-215ENST00000528247 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
ARHGEF4-215ENST00000528247 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF4-215ENST00000528247 CUX2O14529 1486 aa35.54■■■■□ 3.28
ARHGEF4-215ENST00000528247 NCAPD3P42695 1498 aa35.51■■■■□ 3.28
ARHGEF4-215ENST00000528247 ERCC6Q03468 1493 aa35.38■■■■□ 3.25
ARHGEF4-215ENST00000528247 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.38■■■■□ 3.25
ARHGEF4-215ENST00000528247 SMARCA4P51532 1647 aa35.3■■■■□ 3.24
ARHGEF4-215ENST00000528247 SMARCA2P51531 1590 aa35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF4-215ENST00000528247 HMGXB3Q12766 1538 aa35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF4-215ENST00000528247 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF4-215ENST00000528247 NESP48681 1621 aa35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF4-215ENST00000528247 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
ARHGEF4-215ENST00000528247 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.95■■■■□ 3.18
ARHGEF4-215ENST00000528247 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.84■■■■□ 3.17
ARHGEF4-215ENST00000528247 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
ARHGEF4-215ENST00000528247 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.73■■■■□ 3.15
ARHGEF4-215ENST00000528247 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.59■■■■□ 3.13
ARHGEF4-215ENST00000528247 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF4-215ENST00000528247 WIZO95785 1651 aa34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF4-215ENST00000528247 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF4-215ENST00000528247 TRIM41Q8WV44 630 aa34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF4-215ENST00000528247 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.26■■■■□ 3.07
ARHGEF4-215ENST00000528247 WDR62O43379 1518 aa34.2■■■■□ 3.06
ARHGEF4-215ENST00000528247 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.07■■■■□ 3.05
ARHGEF4-215ENST00000528247 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF4-215ENST00000528247 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF4-215ENST00000528247 CFTRP13569 1480 aa33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF4-215ENST00000528247 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
ARHGEF4-215ENST00000528247 OSCARQ8IYS5 282 aa33.84■■■■□ 3.01
ARHGEF4-215ENST00000528247 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
ARHGEF4-215ENST00000528247 PRDM2Q13029 1718 aa33.64■■■□□ 2.98
ARHGEF4-215ENST00000528247 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.56■■■□□ 2.96
ARHGEF4-215ENST00000528247 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
ARHGEF4-215ENST00000528247 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF4-215ENST00000528247 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF4-215ENST00000528247 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF4-215ENST00000528247 IFT140Q96RY7 1462 aa33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF4-215ENST00000528247 TOPBP1Q92547 1522 aa33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF4-215ENST00000528247 ABCC8Q09428 1581 aa33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF4-215ENST00000528247 ARHGEF11O15085 1522 aa33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF4-215ENST00000528247 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.22■■■□□ 2.91
ARHGEF4-215ENST00000528247 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
ARHGEF4-215ENST00000528247 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
ARHGEF4-215ENST00000528247 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.07■■■□□ 2.88
ARHGEF4-215ENST00000528247 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.04■■■□□ 2.88
ARHGEF4-215ENST00000528247 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
ARHGEF4-215ENST00000528247 CHD1O14646 1710 aa33.01■■■□□ 2.87
ARHGEF4-215ENST00000528247 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF4-215ENST00000528247 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF4-215ENST00000528247 FBLN2P98095 1184 aa32.86■■■□□ 2.85
ARHGEF4-215ENST00000528247 SOGA1O94964 1423 aa32.85■■■□□ 2.85
ARHGEF4-215ENST00000528247 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
ARHGEF4-215ENST00000528247 ARAP1Q96P48 1450 aa32.83■■■□□ 2.85
ARHGEF4-215ENST00000528247 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF4-215ENST00000528247 CUX1P39880 1505 aa32.74■■■□□ 2.83
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ARHGEF4-215ENST00000528247 WDR97A6NE52 1622 aa32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF4-215ENST00000528247 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF4-215ENST00000528247 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF4-215ENST00000528247 GRIN2BQ13224 1484 aa32.59■■■□□ 2.81
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ARHGEF4-215ENST00000528247 SYNJ1O43426 1573 aa32.54■■■□□ 2.8
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ARHGEF4-215ENST00000528247 PBRM1Q86U86 1689 aa32.47■■■□□ 2.79
ARHGEF4-215ENST00000528247 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
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ARHGEF4-215ENST00000528247 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF4-215ENST00000528247 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.38■■■□□ 2.77
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ARHGEF4-215ENST00000528247 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.2■■■□□ 2.75
ARHGEF4-215ENST00000528247 GRIN2AQ12879 1464 aa32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF4-215ENST00000528247 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF4-215ENST00000528247 ADAMTS12P58397 1594 aa32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF4-215ENST00000528247 TOP2BQ02880 1626 aa32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF4-215ENST00000528247 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF4-215ENST00000528247 CEP170Q5SW79 1584 aa32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF4-215ENST00000528247 NUP160Q12769 1436 aa32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF4-215ENST00000528247 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.02■■■□□ 2.72
ARHGEF4-215ENST00000528247 SHROOM2Q13796 1616 aa31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF4-215ENST00000528247 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF4-215ENST00000528247 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
ARHGEF4-215ENST00000528247 JPH4Q96JJ6 628 aa31.74■■■□□ 2.67
ARHGEF4-215ENST00000528247 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.72■■■□□ 2.67
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