RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528016.1

ACADM-211, Transcript of acyl-CoA dehydrogenase medium chain, humanhuman

TSL 4

Gene ACADM, Length 546 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADM-211ENST00000528016 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.51■■■□□ 2.48
ACADM-211ENST00000528016 PLCH2O75038 1416 aa30.49■■■□□ 2.47
ACADM-211ENST00000528016 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.48■■■□□ 2.47
ACADM-211ENST00000528016 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
ACADM-211ENST00000528016 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.44■■■□□ 2.46
ACADM-211ENST00000528016 KIF14Q15058 1648 aa30.4■■■□□ 2.46
ACADM-211ENST00000528016 ATP10AO60312 1499 aa30.4■■■□□ 2.46
ACADM-211ENST00000528016 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.4■■■□□ 2.46
ACADM-211ENST00000528016 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.38■■■□□ 2.45
ACADM-211ENST00000528016 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.36■■■□□ 2.45
ACADM-211ENST00000528016 CERKQ8TCT0 537 aa30.35■■■□□ 2.45
ACADM-211ENST00000528016 FMN1Q68DA7 1419 aa30.35■■■□□ 2.45
ACADM-211ENST00000528016 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.35■■■□□ 2.45
ACADM-211ENST00000528016 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
ACADM-211ENST00000528016 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
ACADM-211ENST00000528016 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.33■■■□□ 2.45
ACADM-211ENST00000528016 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.3■■■□□ 2.44
ACADM-211ENST00000528016 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.29■■■□□ 2.44
ACADM-211ENST00000528016 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.28■■■□□ 2.44
ACADM-211ENST00000528016 AFAP1Q8N556 730 aa30.27■■■□□ 2.44
ACADM-211ENST00000528016 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
ACADM-211ENST00000528016 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
ACADM-211ENST00000528016 KDM5CP41229 1560 aa30.27■■■□□ 2.44
ACADM-211ENST00000528016 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.24■■■□□ 2.43
ACADM-211ENST00000528016 STRCQ7RTU9 1775 aa30.23■■■□□ 2.43
ACADM-211ENST00000528016 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.22■■■□□ 2.43
ACADM-211ENST00000528016 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.21■■■□□ 2.43
ACADM-211ENST00000528016 ABCA6Q8N139 1617 aa30.19■■■□□ 2.42
ACADM-211ENST00000528016 CLIP1P30622 1438 aa30.19■■■□□ 2.42
ACADM-211ENST00000528016 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.14■■■□□ 2.42
ACADM-211ENST00000528016 C3P01024 1663 aa30.14■■■□□ 2.41
ACADM-211ENST00000528016 REREQ9P2R6 1566 aa30.13■■■□□ 2.41
ACADM-211ENST00000528016 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
ACADM-211ENST00000528016 PREX2Q70Z35 1606 aa30.12■■■□□ 2.41
ACADM-211ENST00000528016 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.12■■■□□ 2.41
ACADM-211ENST00000528016 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.11■■■□□ 2.41
ACADM-211ENST00000528016 ABCC1P33527 1531 aa30.1■■■□□ 2.41
ACADM-211ENST00000528016 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.09■■■□□ 2.41
ACADM-211ENST00000528016 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.06■■■□□ 2.4
ACADM-211ENST00000528016 AGLP35573 1532 aa30.04■■■□□ 2.4
ACADM-211ENST00000528016 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.04■■■□□ 2.4
ACADM-211ENST00000528016 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.02■■■□□ 2.4
ACADM-211ENST00000528016 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.01■■■□□ 2.39
ACADM-211ENST00000528016 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.99■■■□□ 2.39
ACADM-211ENST00000528016 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.99■■■□□ 2.39
ACADM-211ENST00000528016 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
ACADM-211ENST00000528016 PTPRTO14522 1441 aa29.96■■■□□ 2.39
ACADM-211ENST00000528016 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.96■■■□□ 2.39
ACADM-211ENST00000528016 ILDR2Q71H61 639 aa29.93■■■□□ 2.38
ACADM-211ENST00000528016 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.93■■■□□ 2.38
ACADM-211ENST00000528016 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
ACADM-211ENST00000528016 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.91■■■□□ 2.38
ACADM-211ENST00000528016 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.89■■■□□ 2.38
ACADM-211ENST00000528016 NCOA1Q15788 1441 aa29.88■■■□□ 2.37
ACADM-211ENST00000528016 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.88■■■□□ 2.37
ACADM-211ENST00000528016 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
ACADM-211ENST00000528016 MROH2AA6NES4 1674 aa29.85■■■□□ 2.37
ACADM-211ENST00000528016 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.85■■■□□ 2.37
ACADM-211ENST00000528016 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.84■■■□□ 2.37
ACADM-211ENST00000528016 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
ACADM-211ENST00000528016 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.82■■■□□ 2.36
ACADM-211ENST00000528016 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
ACADM-211ENST00000528016 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
ACADM-211ENST00000528016 NPATQ14207 1427 aa29.79■■■□□ 2.36
ACADM-211ENST00000528016 ZMYM3Q14202 1370 aa29.79■■■□□ 2.36
ACADM-211ENST00000528016 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.79■■■□□ 2.36
ACADM-211ENST00000528016 ATP7AQ04656 1500 aa29.79■■■□□ 2.36
ACADM-211ENST00000528016 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
ACADM-211ENST00000528016 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.74■■■□□ 2.35
ACADM-211ENST00000528016 PLXNC1O60486 1568 aa29.74■■■□□ 2.35
ACADM-211ENST00000528016 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.74■■■□□ 2.35
ACADM-211ENST00000528016 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.73■■■□□ 2.35
ACADM-211ENST00000528016 SOCS7O14512 581 aa29.72■■■□□ 2.35
ACADM-211ENST00000528016 A2MP01023 1474 aa29.72■■■□□ 2.35
ACADM-211ENST00000528016 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
ACADM-211ENST00000528016 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
ACADM-211ENST00000528016 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
ACADM-211ENST00000528016 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.69■■■□□ 2.34
ACADM-211ENST00000528016 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.67■■■□□ 2.34
ACADM-211ENST00000528016 GGT6Q6P531 493 aa29.67■■■□□ 2.34
ACADM-211ENST00000528016 PTPRKQ15262 1439 aa29.67■■■□□ 2.34
ACADM-211ENST00000528016 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.67■■■□□ 2.34
ACADM-211ENST00000528016 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
ACADM-211ENST00000528016 PLA2R1Q13018 1463 aa29.61■■■□□ 2.33
ACADM-211ENST00000528016 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.61■■■□□ 2.33
ACADM-211ENST00000528016 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
ACADM-211ENST00000528016 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.61■■■□□ 2.33
ACADM-211ENST00000528016 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
ACADM-211ENST00000528016 TIAM1Q13009 1591 aa29.58■■■□□ 2.33
ACADM-211ENST00000528016 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.57■■■□□ 2.32
ACADM-211ENST00000528016 PKD2Q13563 968 aa29.57■■■□□ 2.32
ACADM-211ENST00000528016 MBD5Q9P267 1494 aa29.53■■■□□ 2.32
ACADM-211ENST00000528016 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
ACADM-211ENST00000528016 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.5■■■□□ 2.31
ACADM-211ENST00000528016 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.5■■■□□ 2.31
ACADM-211ENST00000528016 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.49■■■□□ 2.31
ACADM-211ENST00000528016 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
ACADM-211ENST00000528016 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
ACADM-211ENST00000528016 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
ACADM-211ENST00000528016 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms