RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527634.5

C11orf80-210, Transcript of chromosome 11 open reading frame 80, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene C11orf80, Length 1,666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf80-210ENST00000527634 ABCC5O15440 1437 aa36.36■■■■□ 3.41
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C11orf80-210ENST00000527634 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.28■■■■□ 3.4
C11orf80-210ENST00000527634 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.27■■■■□ 3.4
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C11orf80-210ENST00000527634 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.21■■■■□ 3.39
C11orf80-210ENST00000527634 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.2■■■■□ 3.39
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C11orf80-210ENST00000527634 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.1■■■■□ 3.37
C11orf80-210ENST00000527634 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.1■■■■□ 3.37
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C11orf80-210ENST00000527634 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.08■■■■□ 3.37
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C11orf80-210ENST00000527634 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.01■■■■□ 3.36
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C11orf80-210ENST00000527634 MBD5Q9P267 1494 aa35.98■■■■□ 3.35
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C11orf80-210ENST00000527634 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.96■■■■□ 3.35
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C11orf80-210ENST00000527634 TSPY10P0CW01 314 aa35.94■■■■□ 3.34
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C11orf80-210ENST00000527634 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.92■■■■□ 3.34
C11orf80-210ENST00000527634 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.92■■■■□ 3.34
C11orf80-210ENST00000527634 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.91■■■■□ 3.34
C11orf80-210ENST00000527634 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
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C11orf80-210ENST00000527634 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.86■■■■□ 3.33
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C11orf80-210ENST00000527634 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.79■■■■□ 3.32
C11orf80-210ENST00000527634 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.78■■■■□ 3.32
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C11orf80-210ENST00000527634 PZPP20742 1482 aa35.77■■■■□ 3.32
C11orf80-210ENST00000527634 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.76■■■■□ 3.32
C11orf80-210ENST00000527634 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.75■■■■□ 3.31
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C11orf80-210ENST00000527634 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.58■■■■□ 3.29
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C11orf80-210ENST00000527634 PKD2Q13563 968 aa35.47■■■■□ 3.27
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C11orf80-210ENST00000527634 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.42■■■■□ 3.26
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C11orf80-210ENST00000527634 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.41■■■■□ 3.26
C11orf80-210ENST00000527634 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.41■■■■□ 3.26
C11orf80-210ENST00000527634 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.4■■■■□ 3.26
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C11orf80-210ENST00000527634 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.25■■■■□ 3.23
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C11orf80-210ENST00000527634 CD109Q6YHK3 1445 aa35.21■■■■□ 3.23
C11orf80-210ENST00000527634 DEPDC5O75140 1603 aa35.21■■■■□ 3.23
C11orf80-210ENST00000527634 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.21■■■■□ 3.23
C11orf80-210ENST00000527634 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.2■■■■□ 3.23
C11orf80-210ENST00000527634 AFAP1Q8N556 730 aa35.19■■■■□ 3.22
C11orf80-210ENST00000527634 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.19■■■■□ 3.22
C11orf80-210ENST00000527634 NEO1Q92859 1461 aa35.14■■■■□ 3.22
C11orf80-210ENST00000527634 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.12■■■■□ 3.21
C11orf80-210ENST00000527634 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.12■■■■□ 3.21
C11orf80-210ENST00000527634 KDM5CP41229 1560 aa35.11■■■■□ 3.21
C11orf80-210ENST00000527634 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.1■■■■□ 3.21
C11orf80-210ENST00000527634 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.1■■■■□ 3.21
C11orf80-210ENST00000527634 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.1■■■■□ 3.21
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