RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525811.5

GMDS-AS1-204, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 539 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.25■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NCOA1Q15788 1441 aa15.25■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.24■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ATP10BO94823 1461 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 HECW1Q76N89 1606 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 C3P01024 1663 aa15.19■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15.17■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.17■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.16■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 GOLGA3Q08378 1498 aa15.15■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.15■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.14■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.14■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ATP10AO60312 1499 aa15.12■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.12■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TOM1O60784 492 aa15.11■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.02■□□□□ -0
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
GMDS-AS1-204ENST00000525811 POTEAQ6S8J7 498 aa15.02■□□□□ -0
GMDS-AS1-204ENST00000525811 P3H3Q8IVL6 736 aa15.02■□□□□ -0
GMDS-AS1-204ENST00000525811 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.02□□□□□ -0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.02□□□□□ -0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ALKQ9UM73 1620 aa15.01□□□□□ -0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15□□□□□ -0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CPS1P31327 1500 aa14.97□□□□□ -0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PKD2Q13563 968 aa14.97□□□□□ -0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PLA2R1Q13018 1463 aa14.96□□□□□ -0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PTPRKQ15262 1439 aa14.96□□□□□ -0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.95□□□□□ -0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.95□□□□□ -0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.94□□□□□ -0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.91□□□□□ -0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ABCA6Q8N139 1617 aa14.91□□□□□ -0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NPATQ14207 1427 aa14.91□□□□□ -0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.9□□□□□ -0.02
GMDS-AS1-204ENST00000525811 AGLP35573 1532 aa14.89□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.89□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 REREQ9P2R6 1566 aa14.89□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MROH2AA6NES4 1674 aa14.88□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.88□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 KDM5CP41229 1560 aa14.86□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.86□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 AFAP1Q8N556 730 aa14.84□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.84□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PLCH2O75038 1416 aa14.83□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.83□□□□□ -0.03
GMDS-AS1-204ENST00000525811 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.83□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ZMYM3Q14202 1370 aa14.82□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SAMD9Q5K651 1589 aa14.81□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-204ENST00000525811 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-204ENST00000525811 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.78□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-204ENST00000525811 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.77□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TRIM52Q96A61 297 aa14.76□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-204ENST00000525811 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.74□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-204ENST00000525811 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.74□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.73□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.73□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SYNMO15061 1565 aa14.73□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-204ENST00000525811 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.71□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MYT1Q01538 1121 aa14.7□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-204ENST00000525811 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.68□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-204ENST00000525811 KIF14Q15058 1648 aa14.68□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-204ENST00000525811 IQGAP1P46940 1657 aa14.67□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PRXQ9BXM0 1461 aa14.66□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-204ENST00000525811 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-204ENST00000525811 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.63□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ABCC1P33527 1531 aa14.62□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.62□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.61□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-204ENST00000525811 DEPDC5O75140 1603 aa14.61□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.6□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-204ENST00000525811 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.6□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MED14O60244 1454 aa14.59□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-204ENST00000525811 GGT6Q6P531 493 aa14.58□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TNRQ92752 1358 aa14.57□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PHLPP1O60346 1717 aa14.56□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 LRP6O75581 1613 aa14.55□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms