RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 SAMD9Q5K651 1589 aa10.93□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10.93□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.93□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 UGGT2Q9NYU1 1516 aa10.91□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 ANP32CO43423 234 aa10.91□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.91□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.91□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 PTPRKQ15262 1439 aa10.9□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 DISP1Q96F81 1524 aa10.9□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.9□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 HFM1A2PYH4 1435 aa10.89□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 NAIPQ13075 1403 aa10.89□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 UACAQ9BZF9 1416 aa10.89□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA0556O60303 1618 aa10.88□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 PKD2Q13563 968 aa10.87□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.87□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 MIA2Q96PC5 1412 aa10.87□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa10.87□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP10.86□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 26.9
TRPS1-208ENST00000519076 L3MBTL2Q969R5 705 aa10.86□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.86□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.86□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 CEP170Q5SW79 1584 aa10.85□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 RGL3Q3MIN7 710 aa10.85□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 NUP155O75694 1391 aa10.85□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 NUP160Q12769 1436 aa10.85□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa10.84□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 NEFLP07196 543 aa10.84□□□□□ -0.67
TRPS1-208ENST00000519076 DAPK1P53355 1430 aa10.82□□□□□ -0.68
TRPS1-208ENST00000519076 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa10.82□□□□□ -0.68
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF11O15085 1522 aa10.82□□□□□ -0.68
TRPS1-208ENST00000519076 MAPKBP1O60336 1514 aa10.82□□□□□ -0.68
TRPS1-208ENST00000519076 OSCARQ8IYS5 282 aa10.81□□□□□ -0.68
TRPS1-208ENST00000519076 ABCC5O15440 1437 aa10.8□□□□□ -0.68
TRPS1-208ENST00000519076 ATP10BO94823 1461 aa10.8□□□□□ -0.68
TRPS1-208ENST00000519076 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.78□□□□□ -0.68
TRPS1-208ENST00000519076 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa10.78□□□□□ -0.68
TRPS1-208ENST00000519076 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TRPS1-208ENST00000519076 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.78□□□□□ -0.68
TRPS1-208ENST00000519076 KIF15Q9NS87 1388 aa10.77□□□□□ -0.68
TRPS1-208ENST00000519076 RSPH4AQ5TD94 716 aa10.77□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.75□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 C9orf84Q5VXU9 1444 aa10.75□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 CARD11Q9BXL7 1154 aa10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP5Q13017 1502 aa10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 AFAP1Q8N556 730 aa10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 NCOA1Q15788 1441 aa10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 ROCK1Q13464 1354 aa10.73□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 ARXQ96QS3 562 aa10.73□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 KIF14Q15058 1648 aa10.73□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 DEKP35659 375 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 AKNAQ7Z591 1439 aa10.72□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 PDE4CQ08493 712 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 CYB5RLQ6IPT4 315 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-208ENST00000519076 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 FAM9BQ8IZU0 186 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 KIF3BO15066 747 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 NBPF8Q3BBV2 869 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 CHD1O14646 1710 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 BCANQ96GW7 911 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 GGT6Q6P531 493 aa10.68□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 MRS2Q9HD23 443 aa10.68□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL34Q8N239 644 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 ABCA8O94911 1581 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 ERCC6L2Q5T890 1561 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC141Q6ZP82 1450 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC144AA2RUR9 1427 aa10.65□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 KDM6BO15054 1643 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 WASHC2AQ641Q2 1341 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.62□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 KANK1Q14678 1352 aa10.62□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 ABCC2Q92887 1545 aa10.61□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 USP47Q96K76 1375 aa10.61□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 CCER2I3L3R5 266 aa10.61□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 SYCP2Q9BX26 1530 aa10.61□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-208ENST00000519076 TMC1Q8TDI8 760 aa10.6□□□□□ -0.71
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