RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515737.5

SH3BP2-228, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-228ENST00000515737 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-228ENST00000515737 DAPK1P53355 1430 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-228ENST00000515737 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-228ENST00000515737 ABCC5O15440 1437 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-228ENST00000515737 KCNH8Q96L42 1107 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-228ENST00000515737 AKNAQ7Z591 1439 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-228ENST00000515737 MAPKBP1O60336 1514 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-228ENST00000515737 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-228ENST00000515737 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-228ENST00000515737 ROCK1Q13464 1354 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-228ENST00000515737 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-228ENST00000515737 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-228ENST00000515737 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-228ENST00000515737 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-228ENST00000515737 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-228ENST00000515737 PREX2Q70Z35 1606 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-228ENST00000515737 KDM6BO15054 1643 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-228ENST00000515737 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-228ENST00000515737 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-228ENST00000515737 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-228ENST00000515737 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-228ENST00000515737 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 NCOA1Q15788 1441 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 TRIM52Q96A61 297 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 TSPY4P0CV99 314 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 TSPY10P0CW01 314 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 MBD5Q9P267 1494 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 ADGRL2O95490 1459 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 PLCH2O75038 1416 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-228ENST00000515737 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.64■■□□□ 1.53
SH3BP2-228ENST00000515737 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-228ENST00000515737 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-228ENST00000515737 ASXL2Q76L83 1435 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-228ENST00000515737 NEUROD1Q13562 356 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-228ENST00000515737 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-228ENST00000515737 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-228ENST00000515737 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-228ENST00000515737 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-228ENST00000515737 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.58■■□□□ 1.52
SH3BP2-228ENST00000515737 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-228ENST00000515737 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-228ENST00000515737 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-228ENST00000515737 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-228ENST00000515737 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-228ENST00000515737 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-228ENST00000515737 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-228ENST00000515737 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-228ENST00000515737 KIF15Q9NS87 1388 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-228ENST00000515737 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-228ENST00000515737 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-228ENST00000515737 ABCC1P33527 1531 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2-228ENST00000515737 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2-228ENST00000515737 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-228ENST00000515737 FANCAO15360 1455 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-228ENST00000515737 FOXD1Q16676 465 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-228ENST00000515737 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-228ENST00000515737 PZPP20742 1482 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-228ENST00000515737 TONSLQ96HA7 1378 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-228ENST00000515737 AFAP1Q8N556 730 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP2-228ENST00000515737 NUP155O75694 1391 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2-228ENST00000515737 PLXNC1O60486 1568 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2-228ENST00000515737 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2-228ENST00000515737 CD109Q6YHK3 1445 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2-228ENST00000515737 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-228ENST00000515737 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-228ENST00000515737 ADGRL1O94910 1474 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-228ENST00000515737 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-228ENST00000515737 PKD2Q13563 968 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-228ENST00000515737 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-228ENST00000515737 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-228ENST00000515737 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-228ENST00000515737 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-228ENST00000515737 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-228ENST00000515737 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-228ENST00000515737 ERBINQ96RT1 1412 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-228ENST00000515737 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-228ENST00000515737 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.477e-8■■□□□ 12
SH3BP2-228ENST00000515737 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-228ENST00000515737 ATP7AQ04656 1500 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-228ENST00000515737 UNC13BO14795 1591 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-228ENST00000515737 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-228ENST00000515737 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-228ENST00000515737 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-228ENST00000515737 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-228ENST00000515737 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-228ENST00000515737 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-228ENST00000515737 NEO1Q92859 1461 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-228ENST00000515737 GLI2P10070 1586 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-228ENST00000515737 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-228ENST00000515737 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-228ENST00000515737 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-228ENST00000515737 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-228ENST00000515737 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-228ENST00000515737 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms