RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514354.5

NHP2-206, Transcript of NHP2 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene NHP2, Length 472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2-206ENST00000514354 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.08■■□□□ 1.45
NHP2-206ENST00000514354 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.08■■□□□ 1.45
NHP2-206ENST00000514354 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.08■■□□□ 1.45
NHP2-206ENST00000514354 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.04■■□□□ 1.44
NHP2-206ENST00000514354 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
NHP2-206ENST00000514354 HSPA2P54652 639 aa24.03■■□□□ 1.44
NHP2-206ENST00000514354 HECW1Q76N89 1606 aa24.02■■□□□ 1.44
NHP2-206ENST00000514354 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.02■■□□□ 1.44
NHP2-206ENST00000514354 ATP10AO60312 1499 aa23.98■■□□□ 1.43
NHP2-206ENST00000514354 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
NHP2-206ENST00000514354 AFAP1Q8N556 730 aa23.95■■□□□ 1.42
NHP2-206ENST00000514354 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.95■■□□□ 1.42
NHP2-206ENST00000514354 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.95■■□□□ 1.42
NHP2-206ENST00000514354 CLIP1P30622 1438 aa23.94■■□□□ 1.42
NHP2-206ENST00000514354 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.93■■□□□ 1.42
NHP2-206ENST00000514354 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.91■■□□□ 1.42
NHP2-206ENST00000514354 KIF14Q15058 1648 aa23.91■■□□□ 1.42
NHP2-206ENST00000514354 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.9■■□□□ 1.42
NHP2-206ENST00000514354 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
NHP2-206ENST00000514354 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.89■■□□□ 1.41
NHP2-206ENST00000514354 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.87■■□□□ 1.41
NHP2-206ENST00000514354 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.84■■□□□ 1.41
NHP2-206ENST00000514354 CERKQ8TCT0 537 aa23.81■■□□□ 1.4
NHP2-206ENST00000514354 KDM5CP41229 1560 aa23.8■■□□□ 1.4
NHP2-206ENST00000514354 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.8■■□□□ 1.4
NHP2-206ENST00000514354 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.78■■□□□ 1.4
NHP2-206ENST00000514354 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.77■■□□□ 1.4
NHP2-206ENST00000514354 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
NHP2-206ENST00000514354 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.76■■□□□ 1.39
NHP2-206ENST00000514354 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.74■■□□□ 1.39
NHP2-206ENST00000514354 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.74■■□□□ 1.39
NHP2-206ENST00000514354 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.74■■□□□ 1.39
NHP2-206ENST00000514354 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.73■■□□□ 1.39
NHP2-206ENST00000514354 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
NHP2-206ENST00000514354 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.71■■□□□ 1.39
NHP2-206ENST00000514354 REREQ9P2R6 1566 aa23.7■■□□□ 1.38
NHP2-206ENST00000514354 ABCC1P33527 1531 aa23.7■■□□□ 1.38
NHP2-206ENST00000514354 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.7■■□□□ 1.38
NHP2-206ENST00000514354 PREX2Q70Z35 1606 aa23.69■■□□□ 1.38
NHP2-206ENST00000514354 ABCA6Q8N139 1617 aa23.68■■□□□ 1.38
NHP2-206ENST00000514354 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.67■■□□□ 1.38
NHP2-206ENST00000514354 AGLP35573 1532 aa23.66■■□□□ 1.38
NHP2-206ENST00000514354 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
NHP2-206ENST00000514354 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
NHP2-206ENST00000514354 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.61■■□□□ 1.37
NHP2-206ENST00000514354 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
NHP2-206ENST00000514354 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
NHP2-206ENST00000514354 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.6■■□□□ 1.37
NHP2-206ENST00000514354 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.57■■□□□ 1.36
NHP2-206ENST00000514354 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.57■■□□□ 1.36
NHP2-206ENST00000514354 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.57■■□□□ 1.36
NHP2-206ENST00000514354 C3P01024 1663 aa23.57■■□□□ 1.36
NHP2-206ENST00000514354 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
NHP2-206ENST00000514354 STRCQ7RTU9 1775 aa23.56■■□□□ 1.36
NHP2-206ENST00000514354 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.55■■□□□ 1.36
NHP2-206ENST00000514354 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.55■■□□□ 1.36
NHP2-206ENST00000514354 PTPRTO14522 1441 aa23.55■■□□□ 1.36
NHP2-206ENST00000514354 ZMYM3Q14202 1370 aa23.53■■□□□ 1.36
NHP2-206ENST00000514354 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.53■■□□□ 1.36
NHP2-206ENST00000514354 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.53■■□□□ 1.36
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NHP2-206ENST00000514354 NPATQ14207 1427 aa23.5■■□□□ 1.35
NHP2-206ENST00000514354 GGT6Q6P531 493 aa23.49■■□□□ 1.35
NHP2-206ENST00000514354 NCOA1Q15788 1441 aa23.47■■□□□ 1.35
NHP2-206ENST00000514354 A2MP01023 1474 aa23.47■■□□□ 1.35
NHP2-206ENST00000514354 ATP7AQ04656 1500 aa23.47■■□□□ 1.35
NHP2-206ENST00000514354 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NHP2-206ENST00000514354 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.42■■□□□ 1.34
NHP2-206ENST00000514354 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
NHP2-206ENST00000514354 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.41■■□□□ 1.34
NHP2-206ENST00000514354 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
NHP2-206ENST00000514354 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.4■■□□□ 1.34
NHP2-206ENST00000514354 MROH2AA6NES4 1674 aa23.4■■□□□ 1.34
NHP2-206ENST00000514354 PLXNC1O60486 1568 aa23.4■■□□□ 1.34
NHP2-206ENST00000514354 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.4■■□□□ 1.34
NHP2-206ENST00000514354 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.38■■□□□ 1.33
NHP2-206ENST00000514354 PTPRKQ15262 1439 aa23.37■■□□□ 1.33
NHP2-206ENST00000514354 MBD5Q9P267 1494 aa23.36■■□□□ 1.33
NHP2-206ENST00000514354 PKD2Q13563 968 aa23.35■■□□□ 1.33
NHP2-206ENST00000514354 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
NHP2-206ENST00000514354 CEP162Q5TB80 1403 aa23.34■■□□□ 1.33
NHP2-206ENST00000514354 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.34■■□□□ 1.33
NHP2-206ENST00000514354 TIAM1Q13009 1591 aa23.34■■□□□ 1.33
NHP2-206ENST00000514354 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.33■■□□□ 1.33
NHP2-206ENST00000514354 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
NHP2-206ENST00000514354 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.32■■□□□ 1.32
NHP2-206ENST00000514354 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
NHP2-206ENST00000514354 PLA2R1Q13018 1463 aa23.3■■□□□ 1.32
NHP2-206ENST00000514354 KIF3BO15066 747 aa23.3■■□□□ 1.32
NHP2-206ENST00000514354 ILDR2Q71H61 639 aa23.29■■□□□ 1.32
NHP2-206ENST00000514354 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
NHP2-206ENST00000514354 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.28■■□□□ 1.32
NHP2-206ENST00000514354 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.27■■□□□ 1.32
NHP2-206ENST00000514354 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.27■■□□□ 1.32
NHP2-206ENST00000514354 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
NHP2-206ENST00000514354 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.26■■□□□ 1.31
NHP2-206ENST00000514354 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
NHP2-206ENST00000514354 NCOA2Q15596 1464 aa23.24■■□□□ 1.31
NHP2-206ENST00000514354 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.24■■□□□ 1.31
NHP2-206ENST00000514354 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.24■■□□□ 1.31
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